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Einzelkern-RNA-Sequenzierung
Der Fortschritt in der Einzelzellerfassung und der Technik zum Aufbau individueller Bibliotheken in Kombination mit Hochdurchsatzsequenzierung ermöglicht Genexpressionsstudien auf Zelle-für-Zelle-Basis.Es ermöglicht eine tiefere und vollständige Systemanalyse komplexer Zellpopulationen, bei der eine Maskierung ihrer Heterogenität durch Mittelwertbildung aller Zellen weitgehend vermieden wird.
Einige Zellen eignen sich jedoch nicht für die Herstellung einer Einzelzellsuspension. Daher sind andere Probenvorbereitungsmethoden erforderlich – die Kernextraktion aus Geweben, d. Zellsequenzierung.
BMK bietet einen 10× Genomics ChromiumTM-basierten Einzelzell-RNA-Sequenzierungsservice an.Dieser Dienst wird häufig in Studien zu krankheitsbezogenen Studien genutzt, beispielsweise zur Differenzierung von Immunzellen, zur Tumorheterogenität, zur Gewebeentwicklung usw.
Räumlicher Transkriptom-Chip: 10× Genomics
Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform
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BMKMANU S1000 räumliches Transkriptom
Die räumliche Transkriptomik steht an der Spitze der wissenschaftlichen Innovation und ermöglicht es Forschern, in komplexe Genexpressionsmuster innerhalb von Geweben einzutauchen und gleichzeitig deren räumlichen Kontext zu bewahren.Unter verschiedenen Plattformen hat BMKGene den BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip entwickelt, der über eine verfügtverbesserte Auflösungvon 5 µM, den subzellulären Bereich erreichend und ermöglichendmehrstufige Auflösungseinstellungen.Der S1000-Chip verfügt über etwa 2 Millionen Spots und verwendet Mikrowells, die mit Perlen bestückt sind, die mit räumlich mit Barcodes versehenen Einfangsonden beladen sind.Aus dem S1000-Chip wird eine mit räumlichen Barcodes angereicherte cDNA-Bibliothek erstellt und anschließend auf der Illumina NovaSeq-Plattform sequenziert.Die Kombination aus räumlich mit Barcodes versehenen Proben und UMIs gewährleistet die Genauigkeit und Spezifität der generierten Daten.Die einzigartige Eigenschaft des BMKManu S1000-Chips liegt in seiner Vielseitigkeit, da er mehrstufige Auflösungseinstellungen bietet, die fein auf verschiedene Gewebe und Detailebenen abgestimmt werden können.Diese Anpassungsfähigkeit macht den Chip zu einer hervorragenden Wahl für verschiedene räumliche Transkriptomstudien und gewährleistet eine präzise räumliche Clusterbildung mit minimalem Rauschen.
Mithilfe des BMKManu S1000-Chips und anderer räumlicher Transkriptomik-Technologien können Forscher ein besseres Verständnis der räumlichen Organisation von Zellen und der komplexen molekularen Wechselwirkungen innerhalb von Geweben erlangen und unschätzbare Einblicke in die Mechanismen liefern, die biologischen Prozessen in einer Vielzahl von Bereichen zugrunde liegen, darunter Onkologie, Neurowissenschaften, Entwicklungsbiologie, Immunologie und botanische Studien.
Plattform: BMKManu S1000-Chip und Illumina NovaSeq
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10x Genomics Visium Spatial Transkriptom
Die räumliche Transkriptomik ist eine hochmoderne Technologie, die es Forschern ermöglicht, Genexpressionsmuster innerhalb von Geweben zu untersuchen und gleichzeitig deren räumlichen Kontext zu bewahren.Eine leistungsstarke Plattform in diesem Bereich ist 10x Genomics Visium in Verbindung mit der Illumina-Sequenzierung.Das Prinzip von 10X Visium basiert auf einem speziellen Chip mit einem bestimmten Erfassungsbereich, in dem Gewebeschnitte platziert werden.Dieser Erfassungsbereich enthält Barcode-Punkte, die jeweils einer eindeutigen räumlichen Position im Gewebe entsprechen.Die eingefangenen RNA-Moleküle aus dem Gewebe werden dann während des Reverse-Transkriptionsprozesses mit eindeutigen molekularen Identifikatoren (UMIs) markiert.Diese Barcode-Spots und UMIs ermöglichen eine präzise räumliche Kartierung und Quantifizierung der Genexpression mit Einzelzellauflösung.Die Kombination aus räumlich mit Barcodes versehenen Proben und UMIs gewährleistet die Genauigkeit und Spezifität der generierten Daten.Durch den Einsatz dieser Spatial Transcriptomics-Technologie können Forscher ein tieferes Verständnis der räumlichen Organisation von Zellen und der komplexen molekularen Wechselwirkungen innerhalb von Geweben erlangen und unschätzbare Einblicke in die Mechanismen bieten, die biologischen Prozessen in verschiedenen Bereichen zugrunde liegen, darunter Onkologie, Neurowissenschaften, Entwicklungsbiologie und Immunologie und botanische Studien.
Plattform: 10X Genomics Visium und Illumina NovaSeq
