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BSA
Die Bulked Segregant Analysis-Plattform besteht aus einer einstufigen Standardanalyse und einer erweiterten Analyse mit benutzerdefinierten Parametereinstellungen.BSA ist eine Technik zur schnellen Identifizierung phänotypischer genetischer Marker.Der Hauptarbeitsablauf von BSA umfasst: 1. Auswahl zweier Gruppen von Individuen mit äußerst gegensätzlichen Phänotypen;2. Zusammenfassen der DNA, RNA oder SLAF-seq (entwickelt von Biomarker) aller Individuen, um zwei DNA-Massen zu bilden;3. Identifizierung von Differenzsequenzen im Vergleich zum Referenzgenom oder dazwischen, 4. Vorhersage verknüpfter Kandidatenregionen durch ED- und SNP-Index-Algorithmus;5. Funktionsanalyse und Anreicherung von Genen in Kandidatenregionen usw. Eine erweiterte Datenauswertung, einschließlich genetischer Marker-Screening und Primer-Design, ist ebenfalls verfügbar.
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Amplikon (16S/18S/ITS)
Die Amplicon-Plattform (16S/18S/ITS) wurde mit jahrelanger Erfahrung in der Projektanalyse der mikrobiellen Diversität entwickelt und umfasst standardisierte Basisanalysen und personalisierte Analysen: Die Basisanalyse deckt den Mainstream-Analyseinhalt der aktuellen mikrobiellen Forschung ab, der Analyseinhalt ist reichhaltig und umfassend. und Analyseergebnisse werden in Form von Projektberichten präsentiert;Die Inhalte der personalisierten Analyse sind vielfältig.Je nach grundlegendem Analysebericht und Forschungszweck können Proben ausgewählt und Parameter flexibel eingestellt werden, um individuelle Anforderungen zu erfüllen.Windows-Betriebssystem, einfach und schnell.
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Evolutionäre Genetik
Evolutionäre Genetik ist ein umfassender Sequenzierungsdienst, der eine umfassende Interpretation der evolutionären Informationen bestimmter Materialien auf der Grundlage genetischer Variationen, einschließlich SNPs, InDels, SVs und CNVs, ermöglicht.Es bietet alle grundlegenden Analysen, die zur Beschreibung evolutionärer Veränderungen und genetischer Merkmale von Populationen erforderlich sind, wie z. B. Populationsstruktur, genetische Vielfalt, Phylogeniebeziehungen usw. Es enthält auch Studien zum Genfluss, die die Schätzung der effektiven Populationsgröße und der Divergenzzeit ermöglichen.
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Vergleichende Genomik
Unter vergleichender Genomik versteht man im wörtlichen Sinne den Vergleich der vollständigen Genomsequenzen und -strukturen verschiedener Arten.Diese Disziplin zielt darauf ab, die Artenentwicklung, Genfunktion und Genregulationsmechanismen auf Genomebene aufzudecken, indem die Sequenzstrukturen und Elemente identifiziert werden, die zwischen verschiedenen Arten konserviert oder differenziert wurden.Typische vergleichende Genomstudien umfassen Analysen der Genfamilie, der evolutionären Entwicklung, der Vervielfältigung des gesamten Genoms, des Selektionsdrucks usw.
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Evolutionäre Genetik
Die Plattform für die Populations- und evolutionäre genetische Analyse basiert auf der umfangreichen Erfahrung, die das Forschungs- und Entwicklungsteam von BMK über Jahre hinweg gesammelt hat.Es ist ein benutzerfreundliches Tool, insbesondere für Forscher, die sich nicht auf Bioinformatik konzentrieren.Diese Plattform ermöglicht grundlegende Analysen im Zusammenhang mit der Evolutionsgenetik, einschließlich phylogenetischer Baumkonstruktion, Verknüpfungsungleichgewichtsanalyse, Bewertung der genetischen Diversität, selektive Sweep-Analyse, Verwandtschaftsanalyse, PCA, Analyse der Populationsstruktur usw.
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Hi-C-basierte Genomassemblierung
Hi-C ist eine Methode zur Erfassung der Chromosomenkonfiguration durch die Kombination von proximitätsbasierten Interaktionen und Hochdurchsatzsequenzierung.Es wird angenommen, dass die Intensität dieser Wechselwirkungen negativ mit der physischen Distanz auf den Chromosomen korreliert.Daher könnten Hi-C-Daten die Clusterung, Reihenfolge und Ausrichtung zusammengesetzter Sequenzen in einem Entwurfsgenom steuern und diese auf einer bestimmten Anzahl von Chromosomen verankern.Diese Technologie ermöglicht eine Genomassemblierung auf Chromosomenebene, ohne dass eine bevölkerungsbasierte genetische Karte vorhanden ist.Jedes einzelne Genom benötigt ein Hi-C.
Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform / DNBSEQ
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De-novo-Genomsequenzierung von Pflanzen und Tieren
De NovoUnter Sequenzierung versteht man die Konstruktion des gesamten Genoms einer Art mithilfe von Sequenzierungstechnologien, z. B. PacBio, Nanopore, NGS usw., ohne dass ein Referenzgenom vorhanden ist.Die bemerkenswerte Verbesserung der Leselänge von Sequenzierungstechnologien der dritten Generation hat neue Möglichkeiten bei der Zusammenstellung komplexer Genome eröffnet, beispielsweise solcher mit hoher Heterozygotie, hohem Anteil repetitiver Regionen, Polyploiden usw. Mit Leselängen im Bereich von mehreren zehn Kilobasen ermöglichen diese Sequenzierungs-Lesevorgänge Auflösung sich wiederholender Elemente, Regionen mit abnormalem GC-Gehalt und anderen hochkomplexen Regionen.
Plattform: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/Illumina NovaSeq-Plattform
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Sequenzierung des gesamten menschlichen Exoms
Die Sequenzierung des gesamten Exoms (WES) gilt als kostengünstige Sequenzierungsstrategie zur Identifizierung krankheitsverursachender Mutationen.Obwohl Exons nur etwa 1,7 % des gesamten Genoms ausmachen, stellen sie direkt das Profil der gesamten Proteinfunktionen dar.Im menschlichen Genom wurde berichtet, dass mehr als 85 % der krankheitsbedingten Mutationen in der proteinkodierenden Region auftreten.
BMKGENE bietet umfassende und flexible Dienste zur Sequenzierung des gesamten menschlichen Exoms mit verschiedenen Strategien zur Exon-Erfassung, um verschiedene Forschungsziele zu erreichen.
Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform
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Spezifische Locus-amplifizierte Fragmentsequenzierung (SLAF-Seq)
Die Hochdurchsatz-Genotypisierung, insbesondere bei großen Populationen, ist ein grundlegender Schritt in genetischen Assoziationsstudien, der die genetische Grundlage für die Entdeckung funktioneller Gene, die Evolutionsanalyse usw. liefert. Anstelle der tiefgreifenden Neusequenzierung des gesamten Genoms wird die Genomsequenzierung mit reduzierter Darstellung (Reduced Representation Genome Sequencing, RRGS) verwendet ) wird eingeführt, um die Sequenzierungskosten pro Probe zu minimieren und gleichzeitig eine angemessene Effizienz bei der Entdeckung genetischer Marker aufrechtzuerhalten.Dies wird üblicherweise durch Extrahieren von Restriktionsfragmenten innerhalb eines bestimmten Größenbereichs erreicht, der als „Reduced Representation Library“ (RRL) bezeichnet wird.Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq) ist eine selbst entwickelte Strategie zur SNP-Genotypisierung mit oder ohne Referenzgenom.
Plattform: Illumina NovaSeq-Plattform -
Illumina und BGI
Die Sequenzierungstechnologie von Illumina, die auf Sequencing by Synthesis (SBS) basiert, ist eine weltweit anerkannte NGS-Innovation, die für die Generierung von über 90 % der weltweiten Sequenzierungsdaten verantwortlich ist.Das Prinzip der SBS besteht darin, fluoreszierend markierte reversible Terminatoren abzubilden, wenn jedes dNTP hinzugefügt und anschließend gespalten wird, um den Einbau der nächsten Base zu ermöglichen.Da alle vier reversiblen terminatorgebundenen dNTPs in jedem Sequenzierungszyklus vorhanden sind, minimiert die natürliche Konkurrenz den Einbaufehler.Diese vielseitige Technologie unterstützt sowohl Single-Read- als auch Paired-End-Bibliotheken und deckt eine Reihe genomischer Anwendungen ab.Die Hochdurchsatzfähigkeiten und Präzision der Illumina-Sequenzierung machen sie zu einem Eckpfeiler der Genomforschung und ermöglichen es Wissenschaftlern, die Feinheiten von Genomen mit unübertroffener Detailgenauigkeit und Effizienz zu entschlüsseln.
DNBSEQ, entwickelt von BGI, ist eine weitere innovative NGS-Technologie, die es geschafft hat, die Sequenzierungskosten weiter zu senken und den Durchsatz zu erhöhen.Die Vorbereitung von DNBSEQ-Bibliotheken umfasst die DNA-Fragmentierung, die Vorbereitung von ssDNA und die Rolling-Circle-Amplifikation, um die DNA-Nanoballs (DNB) zu erhalten.Diese werden dann auf eine feste Oberfläche geladen und anschließend durch kombinatorische Sonden-Anker-Synthese (cPAS) sequenziert.
Unser vorgefertigter Bibliothekssequenzierungsservice erleichtert Kunden die Vorbereitung ihrer Sequenzierungsbibliotheken aus verschiedenen Quellen (u. a. mRNA, gesamtes Genom, Amplikon).Anschließend können diese Bibliotheken zur Qualitätskontrolle und Sequenzierung auf Illumina- oder BGI-Plattformen an unsere Sequenzierungszentren versandt werden.
