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PacBio-Transkriptom in voller Länge (keine Referenz)

Mithilfe der Isoform-Sequenzierungsdaten von Pacific Biosciences (PacBio) als Eingabe ist diese App in der Lage, Transkriptsequenzen in voller Länge (ohne Assemblierung) zu identifizieren.Durch die Kartierung von Sequenzen voller Länge gegen das Referenzgenom können Transkripte durch bekannte Gene, Transkripte, kodierende Regionen usw. optimiert werden. In diesem Fall kann eine genauere Identifizierung von mRNA-Strukturen, wie z. B. alternatives Spleißen usw., erreicht werden.Die gemeinsame Analyse mit NGS-Transkriptomsequenzierungsdaten ermöglicht eine umfassendere Annotation und eine genauere Quantifizierung der Expression auf Transkriptebene, was der nachgelagerten differenziellen Expression und Funktionsanalyse weitgehend zugute kommt.


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