Höhepunkte
Es ist uns eine große Ehre, zu diesem zweistündigen Webinar sechs Experten aus dem Bereich der Pflanzengenomik eingeladen zu haben.Unsere Referenten werden eine ausführliche Interpretation zweier Roggen-Genomstudien geben, die erst kürzlich auf veröffentlicht wurdenNaturgenetik:
1. Die Genomassemblierung im Chromosomenmaßstab bietet Einblicke in die Biologie, Evolution und das agronomische Potenzial von Roggen
2. Eine qualitativ hochwertige Genomassemblierung hebt die genomischen Merkmale und agronomisch wichtigen Gene des Roggens hervor
Wir freuen uns außerdem, dass der leitende Forschungs- und Entwicklungswissenschaftler von Biomarker Technologies seine Erfahrungen bei der De-novo-Genomassemblierung weitergibt.
Agenda
09:00 Uhr MEZ
Begrüßende Bemerkungen
Zheng Hong-kun
Gründer und CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Präsident der School of Advanced Agricultural Sciences der Universität Peking
09:15 Uhr
Verbesserung der Roggen-, Triticale- und Weizenverbesserung durch Verwendung hochwertiger Referenzgenomsequenzen
In diesem Webinar gab uns Prof. Wang einen umfassenden Überblick über den aktuellen Stand der Triticeae-Genomforschung und demonstrierte den Erfolg und die Durchbrüche der beiden herausragenden Arbeiten zu Roggen-Genomstudien, die erst kürzlich auf Nature Genetics veröffentlicht wurden und die gesamte Forschung vorstellen Gruppen, die die Arbeiten leiten und daran mitwirken.
09:25 Uhr
Getreidegenomik @ IPK Gatersleben
Getreidegräser des Triticeae-Stammes sind eine wichtige Nahrungsquelle in gemäßigten Regionen, die seit langem als Hotspot für die Verbesserung und Züchtung von Nutzpflanzen gelten.Unter allen kultivierten Arten ist dieser Stamm für seine äußerst komplexen genomischen Merkmale bekannt, darunter große Genomgrößen, hoher Gehalt an TEs, Polyploidie usw. In dieser Sitzung gab uns Prof. Nils Stein eine allgemeine Einführung in das IPK Gatersleben und den aktuellen Status von Getreide Genomforschung@IPK Gatersleben.
09:35 Uhr
Die Genomassemblierung auf Chromosomenebene bietet Einblicke in die Biologie, Evolution und das agronomische Potenzial von Roggen
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz-Institut für Pflanzengenetik und Anbauplanforschung (IPK)Roggen (Secale Cereale L.) ist eine außergewöhnlich klimaresistente Getreidepflanze, die in großem Umfang zur Produktion verbesserter Weizensorten durch introgressive Hybridisierung verwendet wird und über das gesamte Repertoire an Genen verfügt, die für die Hybridzüchtung erforderlich sind.Roggen ist allogam und erst vor kurzem domestiziert, wodurch Kulturroggen Zugang zu einem vielfältigen und verwertbaren Wildgenpool erhält.Um das agronomische Potenzial von Roggen weiter zu steigern, haben wir eine annotierte Zusammenstellung des 7,9-Mbp-Roggengenoms im Chromosomenmaßstab erstellt und seine Qualität mithilfe einer Reihe molekulargenetischer Ressourcen umfassend validiert.Wir demonstrieren Anwendungen dieser Ressource mit einem breiten Spektrum an Untersuchungen.Wir präsentieren Ergebnisse zur unvollständigen genetischen Isolierung von Kulturroggen von wilden Verwandten, zu Mechanismen der Genomstrukturentwicklung, zur Pathogenresistenz, zur Toleranz gegenüber niedrigen Temperaturen, zu Fruchtbarkeitskontrollsystemen für die Hybridzüchtung und zu den Ertragsvorteilen von Roggen-Weizen-Introgressionen.
10:05 Uhr
Eine qualitativ hochwertige Genomassemblierung hebt die genomischen Merkmale und agronomisch wichtigen Gene des Roggens hervor
Roggen ist eine wertvolle Nahrungs- und Futterpflanze, eine wichtige genetische Ressource für die Verbesserung von Weizen und Triticale und ein unverzichtbares Material für effiziente vergleichende Genomstudien an Gräsern.Hier haben wir das Genom von Weining-Roggen, einer Elite-Roggensorte Chinas, sequenziert.Die zusammengesetzten Contigs (7,74 Gb) machten 98,47 % der geschätzten Genomgröße (7,86 Gb) aus, wobei 93,67 % der Contigs (7,25 Gb) sieben Chromosomen zugeordnet waren.Repetitive Elemente machten 90,31 % des zusammengesetzten Genoms aus.Im Vergleich zu zuvor sequenzierten Triticeae-Genomen zeigten die Retrotransposons Daniela, Sumaya und Sumana eine starke Expansion im Roggen.Weitere Analysen der Weining-Assemblierung werfen neues Licht auf genomweite Genduplikationen und deren Auswirkungen auf Stärkebiosynthesegene, physikalische Organisationen komplexer Prolamin-Loci, Genexpressionsmerkmale, die dem frühen Kopfmerkmal zugrunde liegen, und mutmaßliche domestizierungsassoziierte chromosomale Regionen und Loci im Roggen.Diese Genomsequenz verspricht eine Beschleunigung der Genomik- und Züchtungsstudien von Roggen und verwandten Getreidearten.
10:35 Uhr
Herausforderungen, Lösungen und Zukunft für die Genom-De-novo-Assemblierung
Genom von hoher Qualität ist die Grundlage für Genomstudien.Obwohl die rasante Entwicklung der Sequenzierung und des Algorithmus eine viel einfachere und effizientere Genomassemblierung ermöglicht hat, steigen mit der Vertiefung der Forschungsziele auch die Anforderungen an die Genauigkeit und Vollständigkeit der Assemblierung.In diesem Vortrag werde ich die derzeit beliebten Technologien zur Genomassemblierung anhand einiger erfolgreicher Fälle diskutieren und einen Blick auf die zukünftige Entwicklung werfen.
Zeitpunkt der Veröffentlichung: 08.01.2022