Die Erforschung von Genexpressionsmustern am ursprünglichen Standort eines Organismus ist entscheidend für das Verständnis der Typen und Funktionen seiner Zellen.Aktuelle räumliche Transkriptomanalysemethoden weisen jedoch Einschränkungen auf, wie z. B. einen geringen Durchsatz oder eine unzureichende Auflösung.Der von BMKMANU entwickelte BMKMANU S1000 Spatial Chip kann In-situ-Genexpressionsinformationen in vollständigen Gewebeschnitten mit subzellulärer Auflösung erkennen und ermöglicht so eine differenzierte Interpretation der Gewebestruktur.
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Produktkomponenten
Der räumliche Chip BMKMANU S1000 und das passende Reagenzienkit umfassen:
1) Tissue Optimization Kit, enthält Reagenzien zur Gewebeoptimierung (optimale Zeitermittlung für die Gewebepermeabilisierung).
2) Gene Expression Kit, enthält Reagenzien zum Einfangen von mRNA in Gewebeschnitten für die anschließende Bibliotheksvorbereitung und Sequenzierung.
3) Startup-Kit: Enthält einen Thermostatadapter und einen Transkriptom-Magnetseparator.
Technisches Prinzip
Der Chip basiert auf Mikroporen und Mikrokügelchen, und mRNA kann in situ durch Oligo auf den Mikrokügelchen eingefangen werden.Das Oligo besteht aus vier Teilen: Read1, Spatial Barcode, UMI und Poly(dT)VN.Nachdem das Gewebe am Chip befestigt ist, wird mRNA durch ein Permeabilisierungsenzym aus dem Gewebe freigesetzt.Da die meisten mRNA-3'-Enden einen Poly-A-Schwanz haben, werden sie von Oligo mit Poly(dT)VN eingefangen.Nach RT-PCR und cDNA-Amplifikation, Bibliotheksvorbereitung und Sequenzierung wird die räumliche Positionsverfolgung durch Spatial Barcode erreicht.Dies ermöglicht eine Genexpressionsanalyse an räumlichen Standorten und Gewebeheterogenität.
Produktvorteile
Anwendungen
Es kann auf die meisten Bereiche der biologischen und medizinischen Forschung angewendet werden, einschließlich Tumor-, Krankheits-, Immunologie- und Entwicklungsbiologie, und trägt dazu bei, mit räumlicher Expressionsanalyse mit subzellulärer Auflösung neue Durchbrüche in diesen Bereichen zu erzielen.
●Tumor und Krankheit:
Räumliche Heterogenität und Mikroumgebung von Tumoren und Krankheiten
Entstehung und Entwicklung von Tumoren und Krankheiten
Ansprechen auf die Behandlung von Tumoren und Krankheiten
●Entwicklungsbiologie
Raumzeitlicher Atlas der Organe
Genregulationsmechanismen während der Entwicklung
●Stressreaktion
Biotische Stressreaktion
Reaktion auf abiotischen Stress
●Immunologie
Immunantwort bei Organtransplantationen
Immunmechanismen von Tumoren und Krankheiten
Pathogenese von Autoimmunerkrankungen
●Arzneimittelresistenzanalyse
Mechanismen der Arzneimittelresistenz
Forschung und Entwicklung neuer Medikamente
Fälle und Demodaten
Die Leistung von BMKMANU S1000 wurde in Hunderten von Fällen bei verschiedenen Gewebetypen überprüft.
