Ein wichtiges gartenbauliches Merkmal, das Nabelorangen von anderen gängigen Süßorangensorten unterscheidet, ist das Vorhandensein eines Nabels an der Frucht.Dieses Merkmal ist auch ein wichtiges Kriterium für die Klassifizierung von Süßorangen-Gartenbausorten.
Die Kunden von BMKGENE nutzten die von BMKGENE selbst entwickelte SLAF-Sequenzierungstechnologie, um eine Studie mit dem Titel „Abbau von Genen im Zusammenhang mit der Fruchtqualität in Süßorangen basierend auf der Sequenzierung spezifischer Locus-amplifizierter Fragmente.„
Die Studie umfasste die Sequenzierung von 240 Keimplasmaressourcen von Süßorangen mit großer genetischer Vielfalt und unterschiedlicher geografischer Herkunft, was zu 497,82 MB kurzgelesenen Daten führte.Die Analyse der Daten ergab 1.467.968 SNP-Genotypen im gesamten Genom.Mithilfe der Fst-Analyse identifizierte die Studie sechs Kandidatengene, die mit dem Vorhandensein eines Nabels, des Fruchtgewichts und des titrierbaren Säuregehalts zusammenhängen und eine Grundlage für die gezielte Verbesserung von Süßorangensorten bildeten.
Für die groß angelegte Populationssequenzierung ist die spezifische Locus-Amplified-Fragment-Sequenzierung (SLAF) im Vergleich zur Gesamtgenomsequenzierung (WGS) kosteneffektiver und hocheffektiver.
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Zeitpunkt der Veröffentlichung: 05.12.2023