BMKGENE stellte vollständige Transkriptomsequenzierungsdienste unter Verwendung von PacBio- und ONT-Technologien für eine Studie mit dem Titel „Vergleichende Analyse von PacBio- und ONT-RNA-Sequenzierungsmethoden zur Identifizierung von Nemopilema Nomurai-Gift“ bereit, die in der Zeitschrift Genomics veröffentlicht wurde.Ziel der Studie war es, die Wirksamkeit der RNA-Sequenzierungsmethoden von PacBio und ONT bei der Identifizierung des Giftes der Quallenart Nemopilema nomurai zu vergleichen.
Die Ergebnisse der Studie legen nahe, dass ONT bei der Transkriptomanalyse im Allgemeinen eine höhere Rohdatenqualität lieferte, während PacBio längere Leselängen generierte.PacBio erwies sich bei der Identifizierung kodierender Sequenzen und langkettiger nichtkodierender RNA als überlegen, während ONT bei der Vorhersage alternativer Spleißereignisse, einfacher Sequenzwiederholungen und Transkriptionsfaktoren kostengünstiger war.
Diese Studie hat erhebliche Auswirkungen auf zukünftige Sequenzierungstechnologien bei Meeresquallen und unterstreicht die Leistungsfähigkeit der Transkriptomanalyse in voller Länge bei der Entdeckung potenzieller therapeutischer Ziele für Quallendermatitis.
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Zeitpunkt der Veröffentlichung: 20. Dezember 2023