● Sehr erfahren: Über 200.000 Proben wurden in BMK verarbeitet und decken verschiedene Probentypen ab, darunter Zellkultur, Gewebe, Körperflüssigkeit usw., und über 7.000 mRNA-Seq-Projekte wurden abgeschlossen, die verschiedene Forschungsbereiche abdecken.
● Strenges Qualitätskontrollsystem: Die wichtigsten Qualitätskontrollpunkte in allen Schritten, einschließlich Probenvorbereitung, Bibliotheksvorbereitung, Sequenzierung und Bioinformatik, werden genau überwacht, um qualitativ hochwertige Ergebnisse zu liefern.
● Mehrere Datenbanken stehen für Funktionsannotations- und Anreicherungsstudien zur Verfügung, um verschiedene Forschungsziele zu erfüllen.
● Kundendienst: Kundendienst, gültig für 3 Monate nach Projektabschluss, einschließlich Projektnachverfolgung, Fehlerbehebung, Fragen und Antworten zu Ergebnissen usw.
Bibliothek | Sequenzierungsstrategie | Daten empfohlen | Qualitätskontrolle |
Poly A angereichert | Illumina PE150 | 6 GB | Q30≥85 % |
Nukleotide:
Konz. (ng/μl) | Menge (μg) | Reinheit | Integrität |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Begrenzte oder keine Protein- oder DNA-Kontamination auf dem Gel sichtbar. | Für Pflanzen: RIN≥6,5; Für Tiere: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; begrenzte oder keine Grundlinienhöhe |
Gewebe: Gewicht (trocken):≥1 g
*Für Gewebe mit weniger als 5 mg empfehlen wir, schockgefrorene (in flüssigem Stickstoff) Gewebeproben einzusenden.
Zellsuspension:Zellzahl = 3×106- 1×107
*Wir empfehlen den Versand von gefrorenem Zelllysat.Für den Fall, dass die Zellenzahl kleiner als 5×105 ist.
Blutproben:Volumen≥1 ml
Mikroorganismus:Masse ≥ 1 g
Behälter: 2 ml Zentrifugenröhrchen (Alufolie wird nicht empfohlen)
Probenbeschriftung: Gruppe+Replikation, z. B. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Sendung:
Bioinformatik
Eukaryotisch Arbeitsablauf zur mRNA-Sequenzierungsanalyse
Bioinformatik
ØQualitätskontrolle der Rohdaten
ØReferenzgenom-Alignment
ØAnalyse der Transkriptstruktur
ØExpressionsquantifizierung
ØDifferentialausdrucksanalyse
ØFunktionsannotation und -anreicherung
1.mRNA-Datensättigungskurve
2.Differentialausdrucksanalyse – Vulkandiagramm
3.KEGG-Anmerkung zu DEGs
4.GO-Klassifizierung für DEGs