●Plattformen:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten und BGI-DNB-T7
●Sequenzierungsmodi:PE50, PE100, PE150, PE250
●Qualitätskontrolle von Bibliotheken vor der Sequenzierung
●Lieferung der Sequenzierungsdaten und Qualitätskontrolle:Bereitstellung des QC-Berichts und der Rohdaten im FastQ-Format nach Demultiplexierung und Filterung der Q30-Lesevorgänge.
●Vielseitigkeit der Sequenzierungsdienste:Der Kunde kann die Reihenfolge nach Spur, Fließzelle oder Datenmenge wählen.
●Vielseitigkeit der Plattformen:DNB-Bibliotheken können auf Illumina-Plattformen übertragen werden
●Umfangreiche Erfahrung mit der Illumina-Sequenzierungsplattform:mit Tausenden abgeschlossenen Projekten mit verschiedenen Arten.
●Lieferung des Sequenzierungs-QC-Berichts:mit Qualitätsmetriken, Datengenauigkeit und Gesamtleistung des Sequenzierungsprojekts.
●Reifer Sequenzierungsprozess:mit kurzer Bearbeitungszeit.
●Strenge Qualitätskontrolle: Wir setzen strenge QC-Anforderungen um, um die Lieferung gleichbleibend hochwertiger Ergebnisse zu gewährleisten.
Datenmenge (X) | Konzentration (qPCR/nM) | Volumen |
X ≤ 50 GB | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 GB ≤ X < 100 GB | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 GB | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Plattform | Konzentration (qPCR/nM) | Volumen |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
Neben Konzentration und Gesamtmenge ist auch ein passendes Peakmuster erforderlich.
Vor der Sequenzierung wird ein Bericht über die Qualität der Bibliothek erstellt, in dem die Bibliotheksmenge und die Fragmentierung beurteilt werden.
Tabelle 1. Statistiken zu Sequenzierungsdaten.
Proben-ID | BMKID | Rohe Lesevorgänge | Rohdaten (bp) | Saubere Lesevorgänge (%) | Q20(%) | Q30(%) | GC(%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96,48 | 99,14 | 94,85 | 36,67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96,00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Abbildung 1. Qualitätsverteilung entlang der Lesevorgänge in jeder Stichprobe
Abbildung 2. Basisinhaltsverteilung
Abbildung 3. Verteilung der gelesenen Inhalte in Sequenzierungsdaten