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Produkte

Illumina und BGI

Die Sequenzierungstechnologie von Illumina, die auf Sequencing by Synthesis (SBS) basiert, ist eine weltweit anerkannte NGS-Innovation, die für die Generierung von über 90 % der weltweiten Sequenzierungsdaten verantwortlich ist.Das Prinzip der SBS besteht darin, fluoreszierend markierte reversible Terminatoren abzubilden, wenn jedes dNTP hinzugefügt und anschließend gespalten wird, um den Einbau der nächsten Base zu ermöglichen.Da alle vier reversiblen terminatorgebundenen dNTPs in jedem Sequenzierungszyklus vorhanden sind, minimiert die natürliche Konkurrenz den Einbaufehler.Diese vielseitige Technologie unterstützt sowohl Single-Read- als auch Paired-End-Bibliotheken und deckt eine Reihe genomischer Anwendungen ab.Die Hochdurchsatzfähigkeiten und Präzision der Illumina-Sequenzierung machen sie zu einem Eckpfeiler der Genomforschung und ermöglichen es Wissenschaftlern, die Feinheiten von Genomen mit unübertroffener Detailgenauigkeit und Effizienz zu entschlüsseln.

DNBSEQ, entwickelt von BGI, ist eine weitere innovative NGS-Technologie, die es geschafft hat, die Sequenzierungskosten weiter zu senken und den Durchsatz zu erhöhen.Die Vorbereitung von DNBSEQ-Bibliotheken umfasst die DNA-Fragmentierung, die Vorbereitung von ssDNA und die Rolling-Circle-Amplifikation, um die DNA-Nanoballs (DNB) zu erhalten.Diese werden dann auf eine feste Oberfläche geladen und anschließend durch kombinatorische Sonden-Anker-Synthese (cPAS) sequenziert.

Unser vorgefertigter Bibliothekssequenzierungsservice erleichtert Kunden die Vorbereitung ihrer Sequenzierungsbibliotheken aus verschiedenen Quellen (u. a. mRNA, gesamtes Genom, Amplikon).Anschließend können diese Bibliotheken zur Qualitätskontrolle und Sequenzierung auf Illumina- oder BGI-Plattformen an unsere Sequenzierungszentren versandt werden.


Servicedetails

Demo-Ergebnis

Merkmale

Plattformen:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten und BGI-DNB-T7

Sequenzierungsmodi:PE50, PE100, PE150, PE250

Qualitätskontrolle von Bibliotheken vor der Sequenzierung

Lieferung der Sequenzierungsdaten und Qualitätskontrolle:Bereitstellung des QC-Berichts und der Rohdaten im FastQ-Format nach Demultiplexierung und Filterung der Q30-Lesevorgänge.

 

Servicevorteile

Vielseitigkeit der Sequenzierungsdienste:Der Kunde kann die Reihenfolge nach Spur, Fließzelle oder Datenmenge wählen.

Vielseitigkeit der Plattformen:DNB-Bibliotheken können auf Illumina-Plattformen übertragen werden

Umfangreiche Erfahrung mit der Illumina-Sequenzierungsplattform:mit Tausenden abgeschlossenen Projekten mit verschiedenen Arten. 

Lieferung des Sequenzierungs-QC-Berichts:mit Qualitätsmetriken, Datengenauigkeit und Gesamtleistung des Sequenzierungsprojekts.

Reifer Sequenzierungsprozess:mit kurzer Bearbeitungszeit.

Strenge Qualitätskontrolle: Wir setzen strenge QC-Anforderungen um, um die Lieferung gleichbleibend hochwertiger Ergebnisse zu gewährleisten.

Probenanforderungen*

Teilweise Spursequenzierung

Datenmenge (X)

Konzentration (qPCR/nM)

Volumen

X ≤ 50 GB

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 GB ≤ X < 100 GB

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 GB

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Einspurig (Illumina)

Plattform

Konzentration (qPCR/nM)

Volumen

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Neben Konzentration und Gesamtmenge ist auch ein passendes Peakmuster erforderlich.

 

Bitte wenden Sie sich an uns, wenn Ihre Proben nicht den Anforderungen an das Ausgangsmaterial entsprechen.

Service-Workflow

Probenvorbereitung

Qualitätskontrolle der Bibliothek

Sequenzierung

Sequenzierung

Datenanalyse

Datenqualitätskontrolle

Proben-QC

Projektabwicklung


  • Vorherige:
  • Nächste:

  • QC-Bericht der Bibliothek

    Vor der Sequenzierung wird ein Bericht über die Qualität der Bibliothek erstellt, in dem die Bibliotheksmenge und die Fragmentierung beurteilt werden.

     

    Sequenzierungs-QC-Bericht

     

    Tabelle 1. Statistiken zu Sequenzierungsdaten.

    Proben-ID

    BMKID

    Rohe Lesevorgänge

    Rohdaten (bp)

    Saubere Lesevorgänge (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37.08

    Abbildung 1. Qualitätsverteilung entlang der Lesevorgänge in jeder Stichprobe

    A9

    Abbildung 2. Basisinhaltsverteilung

    A10

    Abbildung 3. Verteilung der gelesenen Inhalte in Sequenzierungsdaten

    A11

     

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