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Bakterien vervollständigen das Genom

Biomarker Technologies bietet Sequenzierungsdienste für die Konstruktion des vollständigen Genoms von Bakterien ohne Lücken.Der Hauptarbeitsablauf der vollständigen Genomkonstruktion von Bakterien umfasst die Sequenzierung der dritten Generation, den Zusammenbau, die funktionale Annotation und die fortgeschrittene bioinformatische Analyse zur Erfüllung spezifischer Forschungsziele.Eine umfassendere Profilierung des Bakteriengenoms ermöglicht die Aufdeckung grundlegender Mechanismen, die ihren biologischen Prozessen zugrunde liegen, was auch wertvolle Referenzen für Genomforschungen bei höheren eukaryontischen Arten liefern könnte

Plattform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq-Plattform

PacBio Fortsetzung II

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Servicedetails

Demo-Ergebnisse

Servicevorteile

● Mehrere Sequenzierungsstrategien für unterschiedliche Forschungsziele verfügbar

● Komplettes Bakteriengenom ohne garantierte Lücken.

● Sehr erfahren in der Zusammenstellung von Bakteriengenomen mit über 10.000 assemblierten vollständigen Genomen.

● Professionelles technisches Kundendienstteam, das spezifischere Forschungsanforderungen erfüllt.

Leistungsbeschreibung

SequenzierungStrategie

Bibliothek

Qualität garantiert

Geschätzte Bearbeitungszeit

Nanopore 100X + Illumina 50X

Nanopore 20K

PE150

0 Lücke

30 Tage

PacBio HiFi 30X

PacBio 10K

Bioinformatische Analysen

● Qualitätskontrolle der Rohdaten

● Genomassemblierung

● Genomkomponentenanalyse

● Annotation der Genfunktion

● Vergleichende Genomanalyse

Musteranforderungen und Lieferung

Probenanforderungen:

FürDNA-Extrakte:

Beispielstyp	Menge	Konzentration	Reinheit
DNA-Extrakte	＞ 2 μg	＞ 20 ng/μl	AD260/280= 1,6-2,5

Für Gewebeproben:

Beispielstyp

Empfohlene Probenbehandlung

Probenlagerung und -versand

Bakterien

Beobachten Sie Bakterien unter dem Mikroskop und sammeln Sie Bakterien in ihrer exponentiellen Phase

Übertragen Sie die Bakterienkultur (enthält ca. 3–4,5e9 Zellen) in einen 1,5 oder 2 ml Eppendorf.(Auf Eis bleiben)

Zentrifugieren Sie das Röhrchen 1 Minute lang bei 14.000 g, um Bakterien zu sammeln, und entfernen Sie den Überstand vorsichtig

Verschließen Sie das Röhrchen und frieren Sie die Bakterien mindestens 30 Minuten lang in flüssigem Stickstoff ein.Bewahren Sie das Röhrchen im Kühlschrank bei -80 °C auf.

Frieren Sie die Proben 3-4 Stunden lang in flüssigem Stickstoff ein und lagern Sie sie zur Langzeitkonservierung in flüssigem Stickstoff oder bei -80 Grad.Der Probenversand mit Trockeneis ist erforderlich.