Heatmap-skuffe bruges til varmekorttegning, som kan filtrere, normalisere og klynge matrixdata. Den bruges mest til klyngeanalyse af genekspressionsniveau mellem forskellige prøver.
Tilknytning af biologiske funktioner til sekvenser i FASTA-fil ved at tilpasse sekvenser til database, herunder NR, KEGG, COG, SwissProt, TrEMBL, KOG, Pfam.
BLAST (Basic Local Alignment Search Tool) er en algoritme og et program til at finde områder med lignende biologiske sekvenser.Den sammenligner disse sekvenser med sekvensdatabaser og beregner den statistiske signifikans.BLAST består af fire typer værktøjer baseret på sekvenstype: blastn, lastp, blastx og tblastn.