Lille RNA-sekventering-Illumina
Funktioner
● Størrelsesvalg af RNA før biblioteksforberedelse
● Bioinformatisk analyse centreret omkring miRNA-forudsigelse og deres mål
Service fordele
●Omfattende bioinformatikanalyse:muliggør identifikation af både kendte og nye miRNA'er, identifikation af miRNA-mål og tilsvarende funktionel annotering og berigelse med flere databaser (KEGG, GO)
●Strenge kvalitetskontrol: Vi implementerer kernekontrolpunkter på tværs af alle stadier, fra prøve- og biblioteksforberedelse til sekventering og bioinformatik.Denne omhyggelige overvågning sikrer levering af konsekvent højkvalitetsresultater.
●Support efter salg: Vores engagement strækker sig ud over projektafslutning med en 3-måneders eftersalgsserviceperiode.I løbet af denne tid tilbyder vi projektopfølgning, fejlfindingshjælp og Q&A-sessioner for at løse eventuelle spørgsmål relateret til resultaterne.
●Omfattende ekspertise: Med en track record med succesfuld lukning af flere sRNA-projekter, der dækker over 100 arter i forskellige forskningsdomæner, bringer vores team et væld af erfaring til hvert projekt.
Prøvekrav og levering
| Bibliotek | Platform | Anbefalede data | Data QC |
| Størrelse valgt | Illumina SE50 | 10M-20M aflæsninger | Q30≥85 % |
Prøvekrav:
Nukleotider:
| Konc.(ng/μl) | Mængde (μg) | Renhed | Integritet |
| ≥ 80 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Begrænset eller ingen protein- eller DNA-kontamination vist på gel. | RIN≥6,5; 5,0≥28S/18S≥1,0; begrænset eller ingen basislinjestigning |
● Planter:
Rod, stilk eller kronblad: 450 mg
Blad eller frø: 300 mg
Frugt: 1,2 g
● Dyr:
Hjerte eller tarm: 450 mg
Indvolde eller hjerne: 240 mg
Muskel: 600 mg
Knogler, hår eller hud: 1,5 g
● Leddyr:
Insekter: 9g
Krebsdyr: 450 mg
● Fuldblod: 2 rør
● Celler: 106 celler
● Serum og plasma:6 ml
Anbefalet prøvelevering
Beholder:
2 ml centrifugerør (stanniol anbefales ikke)
Prøvemærkning: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Forsendelse:
1.Tøris: Prøver skal pakkes i poser og begraves i tøris.
2.RNAstabile rør: RNA-prøver kan tørres i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i stuetemperatur.
Service Work Flow
Eksperimentdesign
Prøve levering
RNA-ekstraktion
Biblioteksbyggeri
Sekvensering
Dataanalyse
Eftersalgsservice
Bioinformatik
Identifikation af miRNA: struktur og dybde
Differentiel ekspression af miRNA - hierarkisk klyngning
Funktionel annotering af mål for differentielt udtrykte miRNA'er
Udforsk de forskningsfremskridt, der er lettet af BMKGene's sRNA-sekventeringstjenester gennem en kurateret samling af publikationer.
Chen, H. et al.(2023) 'Virale infektioner hæmmer saponinbiosyntese og fotosyntese i Panax notoginseng', Plant Physiology and Biochemistry, 203, s.108038. doi: 10.1016/J.PLAPHY.2023.108038.
Li, H. et al.(2023) 'Det plante-FYVE-domæneholdige protein FREE1 associerer med mikroprocessorkomponenter for at undertrykke miRNA-biogenese', rapporterer EMBO, 24(1).doi: 10.15252/EMBR.202255037/SUPPL_FILE/EMBR202255037-SUP-0004-SDATAFIG4.TIF.
Yu, J. et al.(2023) 'MicroRNA Ame-Bantam-3p kontrollerer larvepuppeudviklingen ved at målrette mod det multiple epidermale vækstfaktorlignende domæne 8-gen (megf8) i honningbien, Apis mellifera', International Journal of Molecular Sciences, 24(6), s. .5726. doi: 10.3390/IJMS24065726/S1.
Zhang, M. et al.(2018) 'Integreret analyse af MiRNA og gener associeret med kødkvalitet afslører, at Gga-MiR-140-5p påvirker intramuskulær fedtaflejring hos kyllinger', Cellular Physiology and Biochemistry, 46(6), s. 2421-2433.doi: 10.1159/000489649.
