-
Single-nucleus RNA-sekventering
Fremskridtet inden for enkeltcelleindfangning og individuel bibliotekskonstruktionsteknik kombineret med high-throughput sekventering muliggør genekspressionsundersøgelser på celle-for-celle basis.Det muliggør en dybere og komplet systemanalyse af komplekse cellepopulationer, hvor den stort set undgår maskering af deres heterogenitet ved at tage gennemsnit af alle celler.
Nogle celler er dog ikke egnede til at blive omdannet til enkeltcellesuspension, så andre prøveforberedelsesmetoder – kerneekstraktion fra væv er nødvendig, det vil sige, at kerne ekstraheres direkte fra væv eller celle og fremstilles til single-nucleussuspension til enkelt- cellesekvensering.
BMK leverer 10× Genomics ChromiumTM baseret enkeltcellet RNA-sekventeringsservice.Denne service er blevet meget brugt i undersøgelser af sygdomsrelaterede undersøgelser, såsom immuncelledifferentiering, tumorheterogenitet, vævsudvikling osv.
Rumlig transkriptomchip: 10× Genomics
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics står i spidsen for videnskabelig innovation og giver forskere mulighed for at dykke ned i indviklede genekspressionsmønstre i væv, mens de bevarer deres rumlige kontekst.Blandt forskellige platforme har BMKGene udviklet BMKManu S1000 Spatial Transcriptome Chip, der kan prale af enforbedret opløsningpå 5 µM, når det subcellulære område og muliggørmulti-level opløsningsindstillinger.S1000-chippen, der har cirka 2 millioner pletter, anvender mikrobrønde lagdelt med perler fyldt med rumligt stregkodede indfangningsprober.Et cDNA-bibliotek, beriget med rumlige stregkoder, fremstilles fra S1000-chippen og sekventeres efterfølgende på Illumina NovaSeq-platformen.Kombinationen af rumligt stregkodede prøver og UMI'er sikrer nøjagtigheden og specificiteten af de genererede data.BMKManu S1000-chippens unikke egenskab ligger i dens alsidighed, der tilbyder opløsningsindstillinger på flere niveauer, der kan finjusteres til forskellige væv og detaljeringsniveauer.Denne tilpasningsevne positionerer chippen som et fremragende valg til forskellige rumlige transkriptomiske undersøgelser, hvilket sikrer præcis rumlig klyngning med minimal støj.
Ved at bruge BMKManu S1000-chippen og andre rumlige transkriptomiske teknologier kan forskere opnå en bedre forståelse af den rumlige organisering af celler og de komplekse molekylære interaktioner, der forekommer i væv, hvilket giver uvurderlig indsigt i de mekanismer, der ligger til grund for biologiske processer på en lang række områder, bl.a. onkologi, neurovidenskab, udviklingsbiologi, immunologi og botaniske studier.
Platform: BMKManu S1000-chip og Illumina NovaSeq
-
10x Genomics Visium Spatial Transcriptome
Spatial transcriptomics er en banebrydende teknologi, der giver forskere mulighed for at undersøge genekspressionsmønstre i væv og samtidig bevare deres rumlige kontekst.En kraftfuld platform i dette domæne er 10x Genomics Visium koblet med Illumina-sekventering.Princippet i 10X Visium ligger på en specialiseret chip med et udpeget indfangningsområde, hvor vævssnit placeres.Dette indfangningsområde indeholder stregkodede pletter, der hver svarer til en unik rumlig placering i vævet.De opfangede RNA-molekyler fra vævet mærkes derefter med unikke molekylære identifikatorer (UMI'er) under omvendt transkriptionsprocessen.Disse stregkodede pletter og UMI'er muliggør præcis rumlig kortlægning og kvantificering af genekspression ved en enkeltcellet opløsning.Kombinationen af rumligt stregkodede prøver og UMI'er sikrer nøjagtigheden og specificiteten af de genererede data.Ved at bruge denne Spatial Transcriptomics-teknologi kan forskere opnå en dybere forståelse af den rumlige organisering af celler og de komplekse molekylære interaktioner, der forekommer i væv, hvilket giver uvurderlig indsigt i de mekanismer, der ligger til grund for biologiske processer på flere områder, herunder onkologi, neurovidenskab, udviklingsbiologi, immunologi og botaniske studier.
Platform: 10X Genomics Visium og Illumina NovaSeq
