-
BSA
Bulked Segregant Analysis platform består af et-trins standardanalyse og avanceret analyse med tilpasset parameterindstilling.BSA er en teknik, der bruges til hurtigt at identificere fænotypeassocierede genetiske markører.Hovedarbejdsgangen for BSA indeholder: 1. udvælgelse af to grupper af individer med ekstremt modsatrettede fænotyper;2. pooling af DNA, RNA eller SLAF-seq (udviklet af biomarkør) fra alle individer til dannelse af to bulk af DNA;3. identifikation af differentielle sekvenser mod referencegenom eller derimellem, 4. forudsigelse af kandidatforbundne regioner ved ED og SNP-indeksalgoritme;5. Funktionel analyse og berigelse af gener i kandidatregioner osv. Mere avanceret mining i data, herunder genetisk markørscreening og primerdesign er også tilgængelige.
-
Amplikon (16S/18S/ITS)
Amplicon (16S/18S/ITS) platform er udviklet med mange års erfaring i mikrobiel diversitetsprojektanalyse, som indeholder standardiseret grundlæggende analyse og personaliseret analyse: grundlæggende analyse dækker det almindelige analyseindhold i den nuværende mikrobielle forskning, analyseindholdet er rigt og omfattende, og analyseresultater præsenteres i form af projektrapporter;Indholdet af personlig analyse er forskelligartet.Prøver kan udvælges, og parametre kan indstilles fleksibelt i henhold til den grundlæggende analyserapport og forskningsformål for at realisere personlige krav.Windows-operativsystem, enkelt og hurtigt.
-
Evolutionær genetik
Evolutionær genetik er en pakket sekventeringstjeneste designet til at give en omfattende fortolkning af evolutionær information om givne materialer baseret på genetiske variationer, herunder SNP'er, InDels, SV'er og CNV'er.Det giver alle grundlæggende analyser, der kræves for at beskrive evolutionære ændringer og genetiske træk ved populationer, såsom befolkningsstruktur, genetisk diversitet, fylogeniske forhold osv. Den indeholder også undersøgelser af genflow, som giver mulighed for estimering af effektiv populationsstørrelse, divergenstid.
-
Sammenlignende genomik
Komparativ genomik betyder bogstaveligt talt at sammenligne de komplette genomsekvenser og strukturer af forskellige arter.Denne disciplin har til formål at afsløre artsudvikling, genfunktion, genreguleringsmekanisme på genomniveau ved at identificere sekvensstrukturer og elementer, der konserverede eller differentierede på tværs af forskellige arter.Typisk komparativ genomisk undersøgelse inkluderer analyser i genfamilie, evolutionær udvikling, helgenomduplikation, selektivt tryk osv.
-
Evolutionær genetik
Populations- og evolutionær genetisk analyseplatform er etableret på basis af massiv erfaring opsamlet i BMK R&D team i årevis.Det er et brugervenligt værktøj, især for forskere, der ikke har hovedfag i bioinformatik.Denne platform muliggør grundlæggende evolutionær genetik relateret grundlæggende analyse, herunder fylogenetisk trækonstruktion, koblingsuligevægtsanalyse, genetisk diversitetsvurdering, selektiv sweep-analyse, slægtskabsanalyse, PCA, populationsstrukturanalyse osv.
-
Hi-C baseret genomsamling
Hi-C er en metode designet til at fange kromosomkonfigurationen ved at kombinere proximity-baserede interaktioner og high-throughput sekventering.Intensiteten af disse interaktioner menes at være negativt korreleret med fysisk afstand på kromosomerne.Derfor kunne Hi-C-data guide klyngingen, rækkefølgen og orienteringen af samlede sekvenser i et udkast til genom og forankre dem på et vist antal kromosomer.Denne teknologi giver mulighed for en genomsamling på kromosomniveau i fravær af populationsbaseret genetisk kort.Hvert genom har brug for et Hi-C.
Platform: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Plante/dyr De Novo Genome Sequencing
De Novosekventering refererer til konstruktion af en arts hele genom ved hjælp af sekventeringsteknologier, f.eks. PacBio, Nanopore, NGS osv., i fravær af et referencegenom.Den bemærkelsesværdige forbedring i læselængde af tredje generations sekventeringsteknologier har bragt nye muligheder i at samle komplekse genomer, såsom dem med høj heterozygositet, højt forhold mellem gentagne regioner, polyploider osv. Med læselængde på ti kilobaser-niveau muliggør disse sekventeringslæsninger opløsning af gentagne elementer, regioner med unormalt GC-indhold og andre meget komplekse regioner.
Platform: PacBio Sequel II /Nanopore PromethION P48/ Illumina NovaSeq Platform
-
Human Whole Exome Sequencing
Whole exome sequencing (WES) betragtes som en omkostningseffektiv sekventeringsstrategi til at identificere sygdomsfremkaldende mutationer.Selvom exoner kun fylder ca. 1,7% af hele genomet, repræsenterer det profilen af totale proteinfunktioner direkte.I humant genom er det blevet rapporteret, at mere end 85% af sygdomsrelaterede mutationer forekommer i proteinkodende region.
BMKGENE tilbyder omfattende og fleksible menneskelige hele exome-sekventeringstjenester med forskellige exon-fangststrategier til rådighed for at opfylde forskellige forskningsmål.
Platform: Illumina NovaSeq Platform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
High-throughput genotyping, især på storskala population, er et grundlæggende trin i genetiske associationsstudier, som giver genetisk grundlag for funktionel genopdagelse, evolutionær analyse osv. I stedet for dyb helgenom-re-sekventering, reduceret repræsentationsgenom-sekventering (RRGS) ) introduceres for at minimere sekventeringsomkostninger pr. prøve, samtidig med at en rimelig effektivitet ved opdagelse af genetisk markør opretholdes.Dette opnås almindeligvis ved at udtrække restriktionsfragmenter inden for et givet størrelsesområde, som kaldes reduceret repræsentationsbibliotek (RRL).Specifik-locus amplificeret fragmentsekventering (SLAF-Seq) er en selvudviklet strategi for SNP-genotypebestemmelse med eller uden et referencegenom.
Platform: Illumina NovaSeq Platform -
Illumina og BGI
Illumina-sekventeringsteknologi, baseret på Sequencing by Synthesis (SBS), er en globalt omfavnet NGS-innovation, der er ansvarlig for at generere over 90 % af verdens sekventeringsdata.Princippet for SBS involverer billeddannelse af fluorescensmærkede reversible terminatorer, når hver dNTP tilføjes og efterfølgende spaltes for at tillade inkorporering af den næste base.Med alle fire reversible terminator-bundne dNTP'er til stede i hver sekventeringscyklus, minimerer naturlig konkurrence inkorporeringsbias.Denne alsidige teknologi understøtter både enkeltlæsede og parrede biblioteker, der henvender sig til en række genomiske applikationer.Illumina-sekventeringens evner og præcision med høj gennemstrømning placerer den som en hjørnesten i genomisk forskning, hvilket giver videnskabsfolk mulighed for at opklare genomernes forviklinger med uovertruffen detaljer og effektivitet.
DNBSEQ, udviklet af BGI, er en anden innovativ NGS-teknologi, der har formået at reducere sekventeringsomkostningerne yderligere og øge gennemløbet.Fremstilling af DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, fremstilling af ssDNA og rullende cirkelamplifikation for at opnå DNA-nanokuglerne (DNB).Disse lægges derefter på en fast overflade og sekventeres efterfølgende ved kombinatorisk probe-ankersyntese (cPAS).
Vores præfabrikerede bibliotekssekventeringsservice letter kunderne med at forberede deres sekventeringsbiblioteker fra forskellige kilder (mRNA, hele genom, amplicon, blandt andre).Efterfølgende kan disse biblioteker sendes til vores sekventeringscentre til kvalitetskontrol og sekventering i Illumina- eller BGI-platforme.
