Højdepunkter
I dette to-timers webinar er det vores store ære at have inviteret seks eksperter i afgrøde-genomics arena.Vores foredragsholdere vil give en dybdegående fortolkning af to Rye genomiske undersøgelser, som for nylig blev offentliggjort påNaturgenetik:
1. Kromosomskala-genomsamling giver indsigt i rugbiologi, evolution og agronomisk potentiale
2. En genomsamling af høj kvalitet fremhæver ruggenomiske egenskaber og agronomisk vigtige gener
Vi er også glade for at have senior R&D-forsker fra Biomarker Technologies til at dele sin erfaring med de novo genomsamling.
Dagsorden
09:00 CET
Velkomstbemærkninger
Zheng Hong-kun
Grundlægger og CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Præsident, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15
Forbedring af forbedring af rug, triticale og hvede ved at bruge referencegenomsekvens af høj kvalitet
I dette webinar gav prof. Wang os en overordnet opdatering om den aktuelle status for triticeae genomisk forskning og demonstrerede succesen og gennembruddene af de to fremragende arbejde med Rye genom-studier, som for nylig blev offentliggjort på Nature Genetics og introducerer hele forskningen grupper, der leder og bidrager i arbejdet.
09:25
Cereal genomics @ IPK Gatersleben
Korngræsser af Triticeae-stammen har været en vigtig fødekilde i tempererede områder, som længe har været betragtet som et hotspot inden for afgrødeforbedring og forædling.Blandt alle dyrkede arter er denne stamme berømt for deres ekstremt komplekse genomiske træk, herunder store genomstørrelser, høje indhold af TE'er, polyploidi osv. I denne session gav prof. Nils Stein os en overordnet introduktion til IPK Gatersleben og nuværende status for korn. genomisk forskning@IPK Gatersleben.
09:35
Kromosomskala-genomsamling giver indsigt i rugbiologi, evolution og agronomisk potentiale
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics and Crop Plan Research (IPK)Rug (Secale cereale L.) er en usædvanligt klimabestandig kornafgrøde, der i vid udstrækning anvendes til at producere forbedrede hvedesorter via introgressiv hybridisering og besidder hele det genrepertoire, der er nødvendigt for at muliggøre hybridforædling.Rug er allogam og først for nylig domesticeret, hvilket giver dyrket rug adgang til en mangfoldig og udnyttelig vildgenpulje.For yderligere at forbedre rugens agronomiske potentiale producerede vi en kromosomskala kommenteret samling af 7,9 Mbp ruggenomet og validerede i vid udstrækning dets kvalitet ved hjælp af en række molekylærgenetiske ressourcer.Vi demonstrerer anvendelser af denne ressource med en bred vifte af undersøgelser.Vi præsenterer fund om kultiveret rugs ufuldstændige genetiske isolation fra vilde slægtninge, mekanismer for genomets strukturelle udvikling, patogenresistens, lavtemperaturtolerance, fertilitetskontrolsystemer til hybridavl og udbyttefordelene ved rug-hvede-introgressioner.
10:05
En genomsamling af høj kvalitet fremhæver ruggenomiske egenskaber og agronomisk vigtige gener
Rug er en værdifuld føde- og foderafgrøde, en vigtig genetisk ressource til forbedring af hvede og triticale og et uundværligt materiale til effektive komparative genomiske undersøgelser i græsser.Her sekventerede vi genomet af Weining rug, en elite kinesisk rugsort.De samlede contigs (7,74 Gb) tegnede sig for 98,47% af den estimerede genomstørrelse (7,86 Gb), med 93,67% af contigs (7,25 Gb) tildelt syv kromosomer.Gentagne elementer udgjorde 90,31% af det samlede genom.Sammenlignet med tidligere sekventerede Triticeae-genomer viste Daniela, Sumaya og Sumana retrotransposoner stærk ekspansion i rug.Yderligere analyser af Weining-samling kaster nyt lys over genom-dækkende genduplikationer og deres indvirkning på stivelsesbiosyntese-gener, fysiske organisationer af komplekse prolamin-loci, genekspressionstræk, der ligger til grund for tidlige overskriftsegenskaber, og formodede domesticerings-associerede kromosomale regioner og loci i rug.Denne genomsekvens lover at fremskynde genomforskningen og avlsundersøgelserne af rug og beslægtede kornafgrøder.
10:35
Udfordringer, løsninger og fremtid for genom de novo-samling
Genom af høj kvalitet er grundlaget for genomisk undersøgelse.Selvom den hurtige udvikling inden for sekventering og algoritme har bemyndiget en meget enklere og mere effektiv genomsamling, stiger kravene til samlingsnøjagtighed og fuldstændighed også med uddybningen af forskningsmål.I dette foredrag vil jeg diskutere de nuværende populære teknologier inden for genomsamling med flere vellykkede cases og få et glimt af den fremtidige udvikling.
Indlægstid: Jan-08-2022