BMKCloud Log in
条形banner-03

Nyheder

Nanopore-baseret fuldlængde transkriptom-sekventering

Nanopore-sekventering adskiller sig fra andre sekventeringsplatforme ved, at nukleotiderne aflæses direkte uden DNA-syntese og genererer lange aflæsninger ved titusvis af kilobaser.Dette giver mulighed for direkte udlæsning af transskriptioner i fuld længde og tackling af udfordringerne i transkriptomiske undersøgelser.

√ Lav sekvensspecifik bias

√ Fuldlængde udlæsning af cDNA til genstrukturundersøgelser

√ Der kræves færre data for at dække samme antal transskriptioner

√ Identifikation af flere isoformer pr. gen

√ Udtrykskvantificering på isoform-niveau

nanopore-1

Typisk bioinformatikpipeline

Fuld længde-trans-bix-1024x254

Seneste vellykkede cases med biomarkørteknologier

1. Sammenlignende analyser af transkriptomer i fuld længde afslører Gnetum luofuense-stammens udviklingsdynamik

Tidsskrift: Frontiers in Genetics

Udgivet: Mar. 2021

Nøgleord: MinION |Alternativ splejsning |APA |lncRNA |Differentielt udtrykte transskriptioner

Læs hele teksten

2. Ensrettet bevægelse af små RNA'er fra skud til rødder i interspecifikke heterotransplantater

Tidsskrift: Naturplanter

Udgivet: januar 2021

Nøgleord: Nanopore |Illumina |mobil mRNA-detektion i fuld længde

3. Transkriptomanalyse i fuld længde af aspargesrødder afslører den molekylære mekanisme for salttolerance induceret af arbuskulære mykorrhizasvampe

Tidsskrift: Environmental and Experimental Botany

Udgivet: januar 2021

Nøgleord: MinION |Differentielt udtrykte afskrifter |Transskriptionsfaktorer |Alternativ splejsning

4. Fysiologiske karakteristiske ændringer og fuld-længde transkriptom af roser (Rosa chinensis) rødder og blade som reaktion på tørkestress

Tidsskrift: Plante- og cellefysiologi

Udgivet: oktober 2020

Nøgleord: PromethION |Differentielt udtrykte afskrifter |Funktionel forudsigelse |Splejsede isoformer |TF og lncRNA

5. Analyse og omfattende sammenligning af PacBio og nanopore-baseret RNA-sekventering af Arabidopsis-transkriptomet

Journal: Plantemetode

Udgivet: april 2020

Nøgleord: GridION |PromethION |PacBio-efterfølger |Illumina NovaSeq |Genomjustering |Udskriftsidentifikation |Alternativ splejsning |SSR |LncRNA |Isoform kvantificering

Nyheder og højdepunkter sigter på at dele de seneste succesfulde cases med Biomarker Technologies, fange nye videnskabelige resultater såvel som fremtrædende teknikker anvendt under undersøgelsen.


Indlægstid: Jan-08-2022

Send din besked til os: