-
Proteomik
Proteomics involverer anvendelsen af teknologier til kvantificering af det overordnede proteinindhold i en celle, et væv eller en organisme.Proteomics-baserede teknologier anvendes i forskellige kapaciteter til forskellige forskningsmiljøer, såsom påvisning af forskellige diagnostiske markører, kandidater til vaccineproduktion, forståelse af patogenicitetsmekanismer, ændring af ekspressionsmønstre som reaktion på forskellige signaler og fortolkning af funktionelle proteinveje i forskellige sygdomme.På nuværende tidspunkt er kvantitative proteomiske teknologier hovedsageligt opdelt i TMT, Label Free og DIA kvantitative strategier.
-
Metabolomics
Metabolomet er det terminale nedstrøms produkt af genomet og består af det totale komplement af alle lavmolekylære molekyler (metabolitter) i en celle, væv eller organisme.Metabolomics har til formål at måle en bred bredde af små molekyler i sammenhæng med fysiologiske stimuli eller sygdomstilstande.Metabolomics metoder falder i to adskilte grupper: ikke-målrettet metabolomics, en tilsigtet omfattende analyse af alle de målbare analytter i en prøve, inklusive kemiske ukendte ved hjælp af GC-MS/LC-MS, og målrettet metabolomics, måling af definerede grupper af kemisk karakteriserede og biokemisk annoterede metabolitter.
-
Bulked Segregant analyse
Bulked segregant analyse (BSA) er en teknik, der anvendes til hurtigt at identificere fænotype-associerede genetiske markører.BSA's hovedarbejdsgang indeholder udvælgelse af to grupper af individer med ekstremt modsatrettede fænotyper, pooling af alle individers DNA for at danne to bulk af DNA, identifikation af differentielle sekvenser mellem to puljer.Denne teknik er blevet anvendt i vid udstrækning til at identificere genetiske markører, der er stærkt forbundet med målrettede gener i plante-/dyre-genomer.
-
DNA/RNA-sekventering – Nanopore-sekventering
ONT sekventering er et enkelt molekyle i realtid elektrisk signal sekventeringsteknologi baseret på nanoporer, sekventeringsprincippet for hver platform er det samme.Dobbeltstrenget DNA/RNA vil binde til nanoporøst protein indlejret i biofilmen og afvikles under føring af motorprotein, under påvirkning af spændingsforskel fra begge sider af biofilmen passerer DNA/RNA-strenge gennem nanoporekanalproteinet på en vis sats.På grund af forskellene i de kemiske egenskaber af de forskellige baser på DNA/RNA-strengen, vil det, når en enkelt base eller DNA-molekyle passerer gennem nanoporekanalen, forårsage ændring af forskellige elektriske signaler.Ved at detektere og svare til disse signaler kan de tilsvarende basetyper beregnes, og realtidsdetekteringen af sekvensen kan fuldføres.
-
DNA/RNA sekventering -PacBio Sequencer
PacBio sekventeringsplatform er en langlæst sekvenseringsplatform, som også er kendt som en af Third-Generation Sequencing (TGS) teknologierne.Kerneteknologien, single-molecule real-time (SMRT), giver mulighed for generering af læsninger med titusinder af kilo-base i længden.På basis af "Sequencing-by-Synthesis" opnås enkelt nukleotidopløsning ved hjælp af Zero-mode waveguide (ZMW), hvor kun begrænset volumen i bunden (stedet for molekylesyntese) er belyst.Derudover undgår SMRT-sekventering stort set sekvensspecifik bias i NGS-systemet, idet de fleste PCR-amplifikationstrin ikke er påkrævet i bibliotekskonstruktionsprocessen.
Platform: Sequel II, Revio
