En vigtig gartneriegenskab, der adskiller navleappelsiner fra andre almindelige søde appelsinvarianter, er tilstedeværelsen af en navle på frugten.Denne funktion er også et vigtigt kriterium for klassificeringen af søde orange gartnerier.
BMKGENEs kunder brugte BMKGENEs selvudviklede SLAF-sekventeringsteknologi til at udføre en undersøgelse med titlen "Minegener relateret til frugtkvalitet i søde appelsiner baseret på specifik Locus Amplified Fragment Sequencing.“
Undersøgelsen involverede sekventering af 240 sød orange kimplasma-ressourcer med bred genetisk diversitet og forskellig geografisk oprindelse, hvilket resulterede i 497,82 Mb kortlæste data.Analyse af dataene gav 1.467.968 SNP-genotyper på tværs af hele genomet.Ved at anvende Fst-analyse identificerede undersøgelsen 6 kandidatgener relateret til tilstedeværelsen af en navle, frugtvægt og titrerbar surhed, hvilket gav grundlag for målrettet forbedring af søde orange varianter.
Til storskala populationssekventering er specifik locus amplificeret fragmentsekventering (SLAF) mere omkostningseffektiv og højeffektiv sammenlignet med helgenomsekventering (WGS).
Klikherfor at lære mere om denne undersøgelse.
Posttid: Dec-05-2023