BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Eukaryot mRNA-sekventering-Illumina

mRNA-sekventering muliggør profilering af alle mRNA'er transskripteret fra celler under specifikke betingelser.Det er en kraftfuld teknologi til at afsløre genekspressionsprofil, genstrukturer og molekylære mekanismer for visse biologiske processer.Hidtil har mRNA-sekventering i vid udstrækning været anvendt i grundforskning, klinisk diagnostik, lægemiddeludvikling osv.

Platform: Illumina NovaSeq Platform


Servicedetaljer

Bioinformatik

Demo resultater

Fordele

● Meget erfaren: Over 200.000 prøver er blevet behandlet i BMK, der dækker forskellige prøvetyper, herunder cellekultur, væv, kropsvæske osv. og over 7.000 mRNA-Seq-projekter lukket, der dækker forskellige forskningsområder.

● Streng kvalitetskontrolsystem: Kernekvalitetskontrolpunkter gennem alle trin, herunder prøveforberedelse, biblioteksforberedelse, sekventering og bioinformatik, er under nøje overvågning for at levere resultater af høj kvalitet.

● Flere databaser tilgængelige for funktionsannotering og berigelsesundersøgelser for at opfylde forskellige forskningsmål.

● Eftersalgsservice: Eftersalgsservice er gyldig i 3 måneder efter projektafslutning, herunder projektopfølgning, fejlfinding, resultater Q&A mv.

Prøvekrav og levering

Bibliotek Sekvenseringsstrategi Data anbefales Kvalitetskontrol
Poly A beriget Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Prøvekrav:

Nukleotider:

Konc.(ng/μl)

Mængde (μg)

Renhed

Integritet

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280=1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Begrænset eller ingen protein- eller DNA-kontamination vist på gel.

For planter: RIN≥6,5;

For dyr: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

begrænset eller ingen basislinjestigning

Væv: Vægt (tør):≥1 g
*For væv, der er mindre end 5 mg, anbefaler vi at sende lynfrosset (i flydende nitrogen) vævsprøve.

Cellesuspension:Celletal = 3×106- 1×107
*Vi anbefaler at sende frosset cellelysat.I tilfælde af at cellen tæller mindre end 5×105.

Blodprøver:Volumen≥1 ml

Mikroorganisme:Masse ≥ 1 g

Anbefalet prøvelevering

Beholder: 2 ml centrifugerør (stanniol anbefales ikke)

Prøvemærkning: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...

Forsendelse:

  1. Tøris: Prøver skal pakkes i poser og begraves i tøris.
  2. RNA-stabile rør: RNA-prøver kan tørres i RNA-stabiliseringsrør (f.eks. RNAstable®) og sendes i stuetemperatur.

Service Work Flow

Prøve QC

Eksperimentdesign

prøve levering

Prøve levering

Piloteksperiment

RNA-ekstraktion

Biblioteksforberedelse

Biblioteksbyggeri

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Dataanalyse

Eftersalgsservice

Eftersalgsservice


  • Tidligere:
  • Næste:

  • Bioinformatik

    wps_doc_10

    Eukaryot mRNA-sekventeringsanalyse arbejdsgang

    Bioinformatik

    ØKvalitetskontrol af rådata

    ØReferencegenomjustering

    ØTransskriptionsstrukturanalyse

    ØKvantificering af udtryk

    ØDifferentiel udtryksanalyse

    ØFunktionsanmærkning og berigelse

    1.mRNA-datamætningskurve

    3(1)

    2.Differentiel ekspressionsanalyse-Vulcano plot

    4(1)

    3.KEGG annotering på DEG'er

    5(1)

    4.GO-klassificering på DEG'er

    6(1)

    få et citat

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: