● Meget erfaren: Over 200.000 prøver er blevet behandlet i BMK, der dækker forskellige prøvetyper, herunder cellekultur, væv, kropsvæske osv. og over 7.000 mRNA-Seq-projekter lukket, der dækker forskellige forskningsområder.
● Streng kvalitetskontrolsystem: Kernekvalitetskontrolpunkter gennem alle trin, herunder prøveforberedelse, biblioteksforberedelse, sekventering og bioinformatik, er under nøje overvågning for at levere resultater af høj kvalitet.
● Flere databaser tilgængelige for funktionsannotering og berigelsesundersøgelser for at opfylde forskellige forskningsmål.
● Eftersalgsservice: Eftersalgsservice er gyldig i 3 måneder efter projektafslutning, herunder projektopfølgning, fejlfinding, resultater Q&A mv.
Bibliotek | Sekvenseringsstrategi | Data anbefales | Kvalitetskontrol |
Poly A beriget | Illumina PE150 | 6 Gb | Q30≥85 % |
Nukleotider:
Konc.(ng/μl) | Mængde (μg) | Renhed | Integritet |
≥ 20 | ≥ 0,5 | OD260/280=1,7-2,5 OD260/230=0,5-2,5 Begrænset eller ingen protein- eller DNA-kontamination vist på gel. | For planter: RIN≥6,5; For dyr: RIN≥7,0; 5,0≥28S/18S≥1,0; begrænset eller ingen basislinjestigning |
Væv: Vægt (tør):≥1 g
*For væv, der er mindre end 5 mg, anbefaler vi at sende lynfrosset (i flydende nitrogen) vævsprøve.
Cellesuspension:Celletal = 3×106- 1×107
*Vi anbefaler at sende frosset cellelysat.I tilfælde af at cellen tæller mindre end 5×105.
Blodprøver:Volumen≥1 ml
Mikroorganisme:Masse ≥ 1 g
Beholder: 2 ml centrifugerør (stanniol anbefales ikke)
Prøvemærkning: Gruppe+replikat f.eks. A1, A2, A3;B1, B2, B3... ...
Forsendelse:
Bioinformatik
Eukaryot mRNA-sekventeringsanalyse arbejdsgang
Bioinformatik
ØKvalitetskontrol af rådata
ØReferencegenomjustering
ØTransskriptionsstrukturanalyse
ØKvantificering af udtryk
ØDifferentiel udtryksanalyse
ØFunktionsanmærkning og berigelse
1.mRNA-datamætningskurve
2.Differentiel ekspressionsanalyse-Vulcano plot
3.KEGG annotering på DEG'er
4.GO-klassificering på DEG'er