BMKCloud Log in
条形banner-03

Produkter

Illumina og BGI

Illumina-sekventeringsteknologi, baseret på Sequencing by Synthesis (SBS), er en globalt omfavnet NGS-innovation, der er ansvarlig for at generere over 90 % af verdens sekventeringsdata.Princippet for SBS involverer billeddannelse af fluorescensmærkede reversible terminatorer, når hver dNTP tilføjes og efterfølgende spaltes for at tillade inkorporering af den næste base.Med alle fire reversible terminator-bundne dNTP'er til stede i hver sekventeringscyklus, minimerer naturlig konkurrence inkorporeringsbias.Denne alsidige teknologi understøtter både enkeltlæsede og parrede biblioteker, der henvender sig til en række genomiske applikationer.Illumina-sekventeringens evner og præcision med høj gennemstrømning placerer den som en hjørnesten i genomisk forskning, hvilket giver videnskabsfolk mulighed for at opklare genomernes forviklinger med uovertruffen detaljer og effektivitet.

DNBSEQ, udviklet af BGI, er en anden innovativ NGS-teknologi, der har formået at reducere sekventeringsomkostningerne yderligere og øge gennemløbet.Fremstilling af DNBSEQ-biblioteker involverer DNA-fragmentering, fremstilling af ssDNA og rullende cirkelamplifikation for at opnå DNA-nanokuglerne (DNB).Disse lægges derefter på en fast overflade og sekventeres efterfølgende ved kombinatorisk probe-ankersyntese (cPAS).

Vores præfabrikerede bibliotekssekventeringsservice letter kunderne med at forberede deres sekventeringsbiblioteker fra forskellige kilder (mRNA, hele genom, amplicon, blandt andre).Efterfølgende kan disse biblioteker sendes til vores sekventeringscentre til kvalitetskontrol og sekventering i Illumina- eller BGI-platforme.


Servicedetaljer

Demo resultat

Funktioner

Platforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq , HiSeq X Ten og BGI-DNB-T7

Sekvenseringstilstande:PE50, PE100, PE150, PE250

Kvalitetskontrol af biblioteker før sekventering

Sekventering af datalevering og QC:levering af QC-rapport og rådata i fastq-format efter demultiplexing og filtrering af Q30-læsninger.

 

Service fordele

Alsidigheden af ​​sekventeringstjenester:kunden kan vælge at sekvensere efter bane, flowcelle eller mængde af data.

Alsidighed af platforme:DNB-biblioteker kan overføres til Illumina-platforme

Stor erfaring med Illumina sekventeringsplatform:med tusindvis af lukkede projekter med forskellige arter. 

Levering af sekventerings-QC-rapport:med kvalitetsmålinger, datanøjagtighed og overordnet ydeevne af sekventeringsprojektet.

Moden sekventeringsproces:med kort omløbstid.

Strenge kvalitetskontrol: Vi implementerer strenge QC-krav for at garantere levering af konsekvent højkvalitetsresultater.

Prøvekrav*

Delvis banesekvens

Datamængde (X)

Koncentration (qPCR/nM)

Bind

X ≤ 50 Gb

≥ 2 nM

≥ 20 μl

50 Gb ≤ X < 100 Gb

≥ 3 nM

≥ 20 μl

X ≥ 100 Gb

≥ 4 nM

≥ 20 μl

Enkeltbane (Illumina)

Platform

Koncentration (qPCR/nM)

Bind

HiSeq X Ten

≥ 2 nM

≥ 20 μl

NovaSeq 6000 SP

≥ 1 nM

≥ 25 μl

NovaSeq 6000 S4

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

NovaSeq X

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

BGI-DNBSEQ-T7

≥ 1,5 nM

≥ 25 μl

 Ud over koncentration og total mængde kræves der også et passende topmønster.

 

Kontakt os venligst, hvis dine prøver ikke opfylder kravene til udgangsmateriale.

Service Workflow

Prøveforberedelse

Kvalitetskontrol af biblioteket

Sekvensering

Sekvensering

Dataanalyse

Datakvalitetskontrol

Prøve QC

Projekt levering


  • Tidligere:
  • Næste:

  • Bibliotek QC rapport

    En rapport om kvaliteten af ​​biblioteket leveres før sekventering, vurdering af biblioteksmængde og fragmentering.

     

    Sekvenserings QC rapport

     

    Tabel 1. Statistik over sekventeringsdata.

    Prøve-id

    BMKID

    Rå læser

    Rådata (bp)

    Rene læsninger (%)

    Q20(%)

    Q30(%)

    GC(%)

    C_01

    BMK_01

    22.870.120

    6.861.036.000

    96,48

    99,14

    94,85

    36,67

    C_02

    BMK_02

    14.717.867

    4.415.360.100

    96,00

    98,95

    93,89

    37,08

    Figur 1. Kvalitetsfordeling langs læsninger i hver prøve

    A9

    Figur 2. Basisindholdsfordeling

    A10

    Figur 3. Fordeling af læst indhold i sekventeringsdata

    A11

     

    få et citat

    Skriv din besked her og send den til os

    Send din besked til os: