Dilyniannu Deusulfite Cynrychiolaeth Llai (RRBS)
Manylebau Gwasanaeth
Llwyfan: platfform NovaSeq, PE150
Math o lyfrgell: 200-400bp mewnosod llyfrgell DNA wedi'i drin â bisulfite
Strategaeth ddilyniannu: Diwedd Pâr 150 bp
Argymell allbwn data: data/sampl crai 10 Gb
Gofynion Sampl
Maint DNA: ≥ 2ug
Crynodiad DNA: ≥ 20ng/μl.
Purdeb: OD260/280 = 1.8 i 2.0 heb ddiraddio na halogiad RNA
Dadansoddiad biowybodeg
Llif Gwaith Gwasanaeth
Cyflwyno sampl
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
a.Ystadegau aliniad genom cyfeirio
Ystadegau mapiau yn darllen
Staistics dyfnder dilyniannu a chwmpas safle C
Acwmpas cronedig
Deffeithlonrwydd trechu pob sampl
b.Canfod safle methylation
Rhestr o lefelau methylation ar safle C
BS trosi
Mcytosin ethylated
Dosbarthiad lefel methylation
c.Map Methylation
Geome-eang
Gelfen enome
d.Cymharu lefelau methylation rhwng samplau
Paerwise Cydberthynas o methylation CG
PMethylation CA-CG
Cllewyrch methylation CG
d.Dadansoddiad methylation yn wahaniaethol
Systadegau DMR
Dosbarthiad hyd DMR
Hbwyta map
DDosbarthiad MR yn y rhanbarth wedi'i dargedu
