Dilyniant RNA procaryotig

Mae dilyniannu RNA procaryotig yn defnyddio dilyniannu cenhedlaeth nesaf (NGS) i ddatgelu presenoldeb a maint RNA ar adeg benodol, trwy ddadansoddi'r trawsgrifiad cellog newidiol.Mae dilyniannu RNA procaryotig ein cwmni, yn anelu'n benodol at procaryotes gyda genomau cyfeirio, gan ddarparu proffilio trawsgrifiad i chi, dadansoddi strwythur genynnau, ac ati Mae wedi'i gymhwyso'n eang i ymchwil gwyddoniaeth sylfaenol, ymchwil a datblygu cyffuriau, a mwy.

Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq

Cysylltwch â Ni

Manylion Gwasanaeth

Manylebau Gwasanaeth

Llwyfan: llwyfan Illumina NovaSeq, PE150

Math o lyfrgell: 350bp mewnosod llyfrgell cDNA (yn dibynnu ar ddosbarthiad brig)

Strategaeth ddilyniannu: Diwedd Pâr 150 bp

Swm data argymell: 2 Gb data amrwd / sampl

Biowybodeg

(1) Dilyniannu rheoli ansawdd data: Dosbarthiad niwcleotid, Dosbarthiad ansawdd Sylfaen, asesiad cymhareb rRNA;

(2) Dadansoddiad aliniad dilyniant: Ystadegau canlyniad aliniad, Dirlawnder y dilyniant, Cwmpas y dilyniant;

(3) Anodiad genom cyfeirio (NR, Swiss-Prot, Pfam, COG, GO, KEGG);

(4) Dadansoddiad mynegiant: Dosbarthiad mynegiant (Gyda dau sampl neu fwy), Dadansoddiad mynegiant rhwng samplau (dadansoddiad Venn, Dadansoddiad cydberthynas, dadansoddiad PCA);

(5) Dadansoddiad mynegiant gwahaniaethol (Gyda dau sampl neu fwy);

(6) Dadansoddiad set genynnau: Dadansoddiad Venn, Dadansoddiad Clwstwr, Dadansoddiad anodi swyddogaeth (COG, GO, KEGG), Dadansoddiad cyfoethogi swyddogaeth (GO, KEGG), Graff cordal cyfoethogi swyddogaeth, dadansoddiad Ipath;

(7) dadansoddiad sRNA: rhagfynegiad sRNA, anodi sRNA (Chwyth, sRNAMap, sRNATarBase, SIPHT, Rfam), rhagfynegiad strwythur uwchradd sRNA, rhagfynegiad genynnau targed sRNA;

(8) Dadansoddiad strwythur trawsgrifiad: Dadansoddiad Operon, rhagfynegiad safleoedd dechrau a diwedd trawsgrifio, anodi a dadansoddi UTR, rhagfynegiad dilyniant Hyrwyddwr, dadansoddiad SNP/InDel (anodiad SNP/InDel, dosbarthiad rhanbarthol SNP/InDel, ystadegau SNP).