-
Dilyniannu Immunoprecipitation Chromatin (ChIP-seq)
Mae ChIP-Seq yn darparu proffilio genom-eang o dargedau DNA ar gyfer addasu histone, ffactorau trawsgrifio, a phroteinau eraill sy'n gysylltiedig â DNA.Mae'n cyfuno detholusrwydd imiwn-ddyodiad cromatin (ChIP) i adfer cyfadeiladau protein-DNA penodol, gyda phŵer dilyniannu cenhedlaeth nesaf (NGS) ar gyfer dilyniannu trwybwn uchel y DNA a adferwyd.Yn ogystal, oherwydd bod y cyfadeiladau protein-DNA yn cael eu hadfer o gelloedd byw, gellir cymharu safleoedd rhwymo mewn gwahanol fathau o gelloedd a meinweoedd, neu o dan amodau gwahanol.Mae cymwysiadau'n amrywio o reoleiddio trawsgrifiadol i lwybrau datblygiadol i fecanweithiau clefydau a thu hwnt.
Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq
-
Dilyniannu Metagenomig -NGS
Mae metagenome yn cyfeirio at gasgliad o ddeunydd genetig cyfan o gymuned gymysg o organebau, megis metagenom amgylcheddol, metagenom dynol, ac ati. Mae'n cynnwys genomau micro-organebau y gellir eu trin a rhai na ellir eu trin.Offeryn moleciwlaidd yw dilyniannu metagenomig a ddefnyddir i ddadansoddi'r deunyddiau genomig cymysg a dynnwyd o samplau amgylcheddol, sy'n darparu gwybodaeth fanwl am amrywiaeth a helaethrwydd rhywogaethau, strwythur poblogaeth, perthynas ffylogenetig, genynnau swyddogaethol a rhwydwaith cydberthynas â ffactorau amgylcheddol.
Platfform:Llwyfan Illumina NovaSeq
-
Dilyniant Metagenomig-Nanopor
Offeryn moleciwlaidd yw metagenomeg a ddefnyddir i ddadansoddi'r deunyddiau genomig cymysg a dynnwyd o samplau amgylcheddol, sy'n darparu gwybodaeth fanwl am amrywiaeth a helaethrwydd rhywogaethau, strwythur poblogaeth, perthynas ffylogenetig, genynnau swyddogaethol a rhwydwaith cydberthynas â ffactorau amgylcheddol, ac ati. Mae llwyfannau dilyniannu Nanopore wedi cyflwyno'n ddiweddar i astudiaethau metagenomig.Roedd ei berfformiad rhagorol mewn hyd darllen yn gwella dadansoddiad metagenomig i lawr yr afon i raddau helaeth, yn enwedig cydosod metagenom.Gan fanteisio ar hyd darllen, mae astudiaeth metagenomig seiliedig ar Nanopore yn gallu cyflawni cydosod mwy parhaus o gymharu â metagenomeg dryll.Mae wedi cael ei gyhoeddi bod metagenomeg seiliedig ar Nanopore wedi llwyddo i gynhyrchu genomau bacteriol cyflawn a chaeedig o ficrobiomau (Moss, EL, et. al,Biotechnoleg Natur, 2020)
Platfform:Nanopore PromethION P48
-
Dilyniant bisulfite genom cyfan
Mae methylation DNA yn y pumed safle mewn cytosin (5-mC) yn cael dylanwad sylfaenol ar fynegiant genynnau a gweithgaredd cellog.Mae patrymau methylation annormal wedi bod yn gysylltiedig â sawl cyflwr a chlefyd, megis canser.Mae WGBS wedi dod yn safon aur ar gyfer astudio methylation genom-eang ar gydraniad sylfaen sengl.
Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq
-
Assay ar gyfer Cromatin Hygyrch Trawsposase gyda Dilyniannu Trwybwn Uchel (ATAC-seq)
Mae ATAC-seq yn ddull dilyniannu trwybwn uchel ar gyfer dadansoddi hygyrchedd cromatin ar draws y genom, sy'n bwysig ar gyfer rheolaeth epigenetig byd-eang o fynegiant genynnau.Mae addaswyr dilyniannu yn cael eu gosod mewn rhanbarthau cromatin agored trwy drawsposase Tn5 gorfywiog.Ar ôl ymhelaethu ar PCR, caiff llyfrgell ddilyniannu ei hadeiladu.Gellir cael yr holl ranbarthau cromatin agored o dan amod gofod-amser penodol, nid yn unig yn gyfyngedig i safleoedd rhwymo ffactor trawsgrifio, neu ranbarth penodol wedi'i addasu gan histone.
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Mae'r is-uned ar rRNA 16S a 18S sy'n cynnwys rhanbarthau tra-gadwedig a hyper-newidiol yn ôl bys moleciwlaidd perffaith ar gyfer adnabod organebau procaryotig ac ewcaryotig.Gan fanteisio ar ddilyniant, gellir targedu'r amplicons hyn yn seiliedig ar y rhannau cadw a gellir nodweddu'r rhanbarthau hyper-newidiol yn llawn ar gyfer adnabod microbau gan gyfrannu at astudiaethau sy'n cwmpasu dadansoddiad amrywiaeth microbaidd, tacsonomeg, ffylogeni, ac ati. Amser real moleciwl sengl (SMRT). ) mae dilyniannu platfform PacBio yn galluogi cael darlleniadau hir hynod gywir, a allai gwmpasu ampliconau hyd llawn (tua 1.5 Kb).Roedd yr olygfa ehangach o faes genetig yn gwella'n fawr y datrysiad mewn anodi rhywogaethau mewn cymuned bacteria neu ffyngau.
Platfform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Nod dilyniannu amplicon 16S/18S/ITS yw datgelu ffylogenedd, tacsonomeg, a digonedd o rywogaethau mewn cymuned ficrobaidd trwy ymchwilio i gynhyrchion PCR marcwyr genetig cadw tŷ sy'n cynnwys rhannau tra chyfnewidiol a gor-newidiol.Mae cyflwyno'r olion bysedd moleciwlaidd perffaith hyn gan Woeses et al, (1977) yn grymuso proffilio microbiomau heb ynysu.Mae dilyniannu 16S (bacteria), 18S (ffyngau) a bylchwr trawsgrifiedig mewnol (ITS, ffyngau) yn caniatáu adnabod rhywogaethau toreithiog yn ogystal â rhywogaethau prin ac anhysbys.Mae'r dechnoleg hon wedi dod yn offeryn mawr a gymhwysir yn eang wrth nodi cyfansoddiad microbaidd gwahaniaethol mewn amrywiol amgylcheddau, megis ceg ddynol, coluddion, feces, ac ati.
Platfform:Llwyfan Illumina NovaSeq
-
Ail-ddilyniannu Genom Cyfan Bacteraidd a Ffwngaidd
Mae ail-ddilyniannu genomau cyfan bacteriol a ffwngaidd yn arf hanfodol i gwblhau genomau bacteriwm a ffyngau hysbys, yn ogystal ag i gymharu genomau lluosog neu i fapio genomau organebau newydd.Mae'n hynod bwysig dilyniannu genomau cyfan bacteriwm a ffyngau er mwyn cynhyrchu genomau cyfeirio cywir, i wneud adnabyddiaeth microbaidd ac astudiaethau genom cymharol eraill.
Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq
-
PacBio-Hyd Llawn 16S/18S/ITS Amplicon Dilyniannu
Datblygir platfform Amplicon (16S / 18S / ITS) gyda blynyddoedd o brofiad mewn dadansoddi prosiectau amrywiaeth microbaidd, sy'n cynnwys dadansoddiad sylfaenol safonol a dadansoddiad personol: mae dadansoddiad sylfaenol yn cwmpasu cynnwys dadansoddi prif ffrwd ymchwil microbaidd cyfredol, mae'r cynnwys dadansoddi yn gyfoethog a chynhwysfawr, a chyflwynir canlyniadau dadansoddi ar ffurf adroddiadau prosiect;Mae cynnwys dadansoddiad personol yn amrywiol.Gellir dewis samplau a gellir gosod paramedrau yn hyblyg yn unol â'r adroddiad dadansoddi sylfaenol a phwrpas ymchwil, i wireddu gofynion personol.System weithredu Windows, syml a chyflym.
-
Trawsgrifiad Hyd Llawn PacBio (Di-gyfeiriad)
Gan gymryd data dilyniannu Isoform Pacific Biosciences (PacBio) fel mewnbwn, mae'r Ap hwn yn gallu nodi dilyniannau trawsgrifio hyd llawn (heb gydosod).Trwy fapio dilyniannau hyd llawn yn erbyn genom cyfeirio, gellir optimeiddio trawsgrifiadau gan enynnau hysbys, trawsgrifiadau, rhanbarthau codio, ac ati. Yn yr achos hwn, gellir adnabod strwythurau mRNA yn fwy cywir, megis splicing amgen, ac ati.Mae dadansoddi ar y cyd â data dilyniannu trawsgrifiad NGS yn galluogi anodi mwy cynhwysfawr a meintioli mynegiant mwy cywir ar lefel trawsgrifiad, sydd i raddau helaeth o fudd i fynegiant gwahaniaethol i lawr yr afon a dadansoddiad swyddogaethol.
-
Dilyniannu Deusulfite Cynrychiolaeth Llai (RRBS)
Mae ymchwil methylation DNA bob amser wedi bod yn bwnc llosg mewn ymchwil i glefydau, ac mae ganddo gysylltiad agos â mynegiant genynnau a nodweddion ffeno-nodweddiadol.Mae RRBS yn ddull cywir, effeithlon a darbodus ar gyfer ymchwil methylation DNA.Mae cyfoethogi ardaloedd hyrwyddwr a rhanbarthau ynys CpG trwy holltiad ensymatig (Msp I), ynghyd â dilyniannu Bisulfite, yn darparu canfod methylation DNA cydraniad uchel.
Llwyfan: Platfform Illumina NovaSeq
-
Dilyniant mRNA procaryotig
Mae dilyniannu mRNA yn grymuso proffilio cynhwysfawr yr holl drawsgrifiadau mRNA o fewn celloedd o dan amodau penodol.Mae'r dechnoleg flaengar hon yn arf pwerus, gan ddadorchuddio proffiliau mynegiant genynnau cymhleth, strwythurau genynnau, a mecanweithiau moleciwlaidd sy'n gysylltiedig â phrosesau biolegol amrywiol.Wedi'i fabwysiadu'n eang mewn ymchwil sylfaenol, diagnosteg glinigol, a datblygu cyffuriau, mae dilyniannu mRNA yn cynnig mewnwelediad i gymhlethdodau dynameg cellog a rheoleiddio genetig.Mae ein prosesu sampl mRNA procaryotig wedi'i deilwra ar gyfer trawsgrifiadau procaryotig, sy'n cynnwys disbyddu rRNA a pharatoi llyfrgell cyfeiriadol.
Llwyfan: Illumina NovaSeq X
