BMKCloud Log in
条形 baner-03

Newyddion

GENOME

Natur_Cyfathrebu_Logo

Cydosod a dadansoddi ar raddfa cromosom o genom cnwd biomas Miscanthus lutarioriparius

Dilyniant Nanopore |Illumina |Hi-C |Dilyniant RNA |Ffylogeni

Yn yr astudiaeth hon, darparodd Biomarker Technologies gymorth technegol ar ddilyniant Nanopore, cydosod genom de novo, cynulliad â chymorth Hi-C, ac ati.

Haniaethol

Miscanthus, planhigyn lluosflwydd rhizomatous, mae ganddo botensial mawr ar gyfer cynhyrchu bio-ynni oherwydd ei oddefgarwch biomas a straen uchel.Rydym yn adrodd am gynulliad ar raddfa cromosom oMiscanthus lutarioripariusgenom trwy gyfuno dilyniannu Oxford Nanopore a thechnolegau Hi-C.Mae'r cynulliad 2.07-Gb yn gorchuddio 96.64% o'r genom, gyda contig N50 o 1.71 Mb.Mae'r dilyniannau centromere a telomere yn cael eu cydosod ar gyfer pob un o'r 19 cromosom a chromosom 10, yn y drefn honno.Mae tarddiad allotetraploid yr M. lutarioriparius yn cael ei gadarnhau gan ddefnyddio ailddarllediadau lloeren centromeric.Mae strwythur y genom tetraploid a sawl ad-drefnu cromosomaidd mewn perthynas â sorghum wedi'u dangos yn glir.Genynnau dyblyg tandem oM. lutarioripariusyn cael eu cyfoethogi swyddogaethol nid yn unig o ran ymateb straen, ond biosynthesis cellfur.Mae teuluoedd genynnau sy'n gysylltiedig ag ymwrthedd i glefydau, biosynthesis wal gell a chludiant ïon metel yn ehangu ac yn esblygu'n fawr.Gall ehangu'r teuluoedd hyn fod yn sail genomig bwysig ar gyfer gwella nodweddion rhyfeddolM. lutarioriparius.

Ystadegau allweddol cydosod genom

newyddion-1
newyddion-2

Ffigur.Trosolwg o'r cynulliad genom M. lutarioriparius....

Newyddion ac Uchafbwyntiau yn anelu at rannu'r achosion llwyddiannus diweddaraf gyda Biomarker Technologies, gan ddal cyflawniadau gwyddonol newydd yn ogystal â thechnegau amlwg a ddefnyddiwyd yn ystod yr astudiaeth.


Amser postio: Ionawr-05-2022

Anfonwch eich neges atom: