GENOME
Cydosod a dadansoddi ar raddfa cromosom o genom cnwd biomas Miscanthus lutarioriparius
Dilyniant Nanopore |Illumina |Hi-C |Dilyniant RNA |Ffylogeni
Yn yr astudiaeth hon, darparodd Biomarker Technologies gymorth technegol ar ddilyniant Nanopore, cydosod genom de novo, cynulliad â chymorth Hi-C, ac ati.
Haniaethol
Miscanthus, planhigyn lluosflwydd rhizomatous, mae ganddo botensial mawr ar gyfer cynhyrchu bio-ynni oherwydd ei oddefgarwch biomas a straen uchel.Rydym yn adrodd am gynulliad ar raddfa cromosom oMiscanthus lutarioripariusgenom trwy gyfuno dilyniannu Oxford Nanopore a thechnolegau Hi-C.Mae'r cynulliad 2.07-Gb yn gorchuddio 96.64% o'r genom, gyda contig N50 o 1.71 Mb.Mae'r dilyniannau centromere a telomere yn cael eu cydosod ar gyfer pob un o'r 19 cromosom a chromosom 10, yn y drefn honno.Mae tarddiad allotetraploid yr M. lutarioriparius yn cael ei gadarnhau gan ddefnyddio ailddarllediadau lloeren centromeric.Mae strwythur y genom tetraploid a sawl ad-drefnu cromosomaidd mewn perthynas â sorghum wedi'u dangos yn glir.Genynnau dyblyg tandem oM. lutarioripariusyn cael eu cyfoethogi swyddogaethol nid yn unig o ran ymateb straen, ond biosynthesis cellfur.Mae teuluoedd genynnau sy'n gysylltiedig ag ymwrthedd i glefydau, biosynthesis wal gell a chludiant ïon metel yn ehangu ac yn esblygu'n fawr.Gall ehangu'r teuluoedd hyn fod yn sail genomig bwysig ar gyfer gwella nodweddion rhyfeddolM. lutarioriparius.
Ystadegau allweddol cydosod genom
Ffigur.Trosolwg o'r cynulliad genom M. lutarioriparius....
Newyddion ac Uchafbwyntiau yn anelu at rannu'r achosion llwyddiannus diweddaraf gyda Biomarker Technologies, gan ddal cyflawniadau gwyddonol newydd yn ogystal â thechnegau amlwg a ddefnyddiwyd yn ystod yr astudiaeth.
Amser postio: Ionawr-05-2022