-
Dilyniannu Metagenomig (NGS)
Mae metagenome yn cyfeirio at gasgliad o ddeunydd genetig cyfan o gymuned gymysg o organebau, megis metagenom amgylcheddol, metagenom dynol, ac ati. Mae'n cynnwys genomau micro-organebau y gellir eu trin a rhai na ellir eu trin.Offeryn moleciwlaidd yw dilyniannu metagenomig a ddefnyddir i ddadansoddi'r deunyddiau genomig cymysg a dynnwyd o samplau amgylcheddol, sy'n darparu gwybodaeth fanwl am amrywiaeth a helaethrwydd rhywogaethau, strwythur poblogaeth, perthynas ffylogenetig, genynnau swyddogaethol a rhwydwaith cydberthynas â ffactorau amgylcheddol.
Platfform:Illumina NovaSeq6000
-
Dilyniant Metagenomig-Nanopor
Offeryn moleciwlaidd yw metagenomeg a ddefnyddir i ddadansoddi'r deunyddiau genomig cymysg a dynnwyd o samplau amgylcheddol, sy'n darparu gwybodaeth fanwl am amrywiaeth a helaethrwydd rhywogaethau, strwythur poblogaeth, perthynas ffylogenetig, genynnau swyddogaethol a rhwydwaith cydberthynas â ffactorau amgylcheddol, ac ati Mae llwyfannau dilyniannu Nanopore wedi cyflwyno'n ddiweddar. i astudiaethau metagenomig.Roedd ei berfformiad rhagorol mewn hyd darllen yn gwella dadansoddiad metagenomig i lawr yr afon i raddau helaeth, yn enwedig cydosod metagenom.Gan fanteisio ar hyd darllen, mae astudiaeth metagenomig yn seiliedig ar Nanopor yn gallu sicrhau cydosod mwy parhaus o'i gymharu â metagenomeg dryll.Mae wedi cael ei gyhoeddi bod metagenomeg seiliedig ar Nanopore wedi llwyddo i gynhyrchu genomau bacteriol cyflawn a chaeedig o ficrobiomau (Moss, EL, et. al,Biotechnoleg Natur, 2020)
Platfform:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Mae'r is-uned ar rRNA 16S a 18S sy'n cynnwys rhanbarthau tra-gadwedig a hyper-newidiol yn ôl bys moleciwlaidd perffaith ar gyfer adnabod organebau procaryotig ac ewcaryotig.Gan fanteisio ar ddilyniannu, gellir targedu'r amplicons hyn yn seiliedig ar y rhannau sydd wedi'u cadw a gellir nodweddu'r rhanbarthau hyper-newidiol yn llawn ar gyfer adnabod microbau gan gyfrannu at astudiaethau sy'n cwmpasu dadansoddiad amrywiaeth microbaidd, tacsonomeg, ffylogeni, ac ati. Amser real moleciwl sengl (SMRT). ) mae dilyniannu platfform PacBio yn galluogi cael darlleniadau hir hynod gywir, a allai gwmpasu ampliconau hyd llawn (tua 1.5 Kb).Roedd yr olygfa ehangach o faes genetig yn gwella'n fawr y datrysiad mewn anodi rhywogaethau mewn cymuned bacteria neu ffyngau.
Platfform:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Nod dilyniannu amplicon 16S/18S/ITS yw datgelu ffylogenedd, tacsonomeg, a helaethrwydd rhywogaethau mewn cymuned ficrobaidd trwy ymchwilio i gynhyrchion PCR marcwyr genetig cadw tŷ sy'n cynnwys rhannau tra chyfnewidiol a gor-newidiol.Mae cyflwyno'r olion bysedd moleciwlaidd perffaith hyn gan Woeses et al, (1977) yn grymuso proffilio microbiomau heb ynysu.Mae dilyniannu 16S (bacteria), 18S (ffyngau) a bylchwr trawsgrifiedig mewnol (ITS, ffyngau) yn caniatáu adnabod rhywogaethau toreithiog yn ogystal â rhywogaethau prin ac anhysbys.Mae'r dechnoleg hon wedi dod yn offeryn mawr a gymhwysir yn eang wrth nodi cyfansoddiad microbaidd gwahaniaethol mewn amrywiol amgylcheddau, megis ceg ddynol, coluddion, feces, ac ati.
Platfform:Illumina NovaSeq6000
-
Ail-ddilyniannu Genom Cyfan Bacteraidd a Ffwngaidd
Mae ail-ddilyniannu genomau cyfan bacteriol a ffwngaidd yn arf hollbwysig i gwblhau genomau bacteriwm a ffyngau hysbys, yn ogystal ag i gymharu genomau lluosog neu i fapio genomau organebau newydd.Mae'n bwysig iawn dilyniannu genomau cyfan bacteriwm a ffyngau er mwyn cynhyrchu genomau cyfeirio cywir, i wneud adnabyddiaeth microbaidd ac astudiaethau genom cymharol eraill.
Llwyfan: Illumina NovaSeq 6000
-
Genom ffwngaidd
Mae Biomarker Technologies yn darparu arolwg genom, genom mân a genom pene-cyflawn o ffwng yn dibynnu ar nod ymchwil penodol.Gellir cyflawni dilyniant genom, cydosod ac anodi swyddogaethol trwy gyfuno dilyniant cenhedlaeth Nesaf + Dilyniant trydydd cenhedlaeth i gyflawni cydosod genom lefel uchel.Gellir defnyddio technoleg Hi-C hefyd i hwyluso cydosod genom ar lefel cromosom.
Platfform:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Illumina NovaSeq 6000
-
Bacteria Genom Cyflawn
Mae Biomarker Technologies yn darparu gwasanaeth dilyniannu ar adeiladu genom cyflawn o facteria heb unrhyw fwlch.Mae prif lif gwaith bacteria adeiladu genom cyflawn yn cynnwys dilyniannu trydedd genhedlaeth, cydosod, anodi swyddogaethol a dadansoddiad biowybodeg uwch sy'n cyflawni nodau ymchwil penodol.Mae proffilio mwy cynhwysfawr o genom bacteria yn galluogi datgelu mecanweithiau sylfaenol sy'n sail i'w prosesau biolegol, a allai hefyd ddarparu cyfeiriad gwerthfawr ar gyfer ymchwil genomig mewn rhywogaethau ewcaryotig uwch.
Platfform:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq 6000
PacBio Sequel II
