Ymchwilio i botensial astudio amrywiaeth gwyllt o rywogaethau ymchwil, a amlygir gan achos canolog gan gleientiaid BMKGENE.Cyhoeddwyd yr erthygl yn rhifyn eleni o'r Plant Biotechnology Journal yn ddiweddar, ac mae'r erthygl o'r enw “Genom Hevea brasiliensis gwyllt ar lefel cromosom: Grymuso Bridio â Chymorth Genomig a Darganfod Loci Hanfodol ar gyfer Cynnyrch Rwber Uchel” yn gyfeiriad gwerthfawr.
Mae'r goeden rwber Brasil (Hevea brasiliensis) yn sefyll yn dal fel ffynhonnell rwber naturiol ganolog.Drwy gydol y ganrif ddiwethaf, ysgogodd methodolegau bridio traddodiadol ymchwydd chwephlyg rhyfeddol mewn cynhyrchu rwber.Eto i gyd, mae'r sylfaen enetig sylfaenol sy'n gyfrifol am y posibilrwydd o wella cynnyrch rwber yn parhau i fod yn enigmatig.
Dechreuodd yr astudiaeth hon ar adeiladu genom lefel cromosom ar gyfer y goeden rwber wyllt, gan ddefnyddio synergedd o ddilyniant darllen hir Nanopore, dilyniannu Illumina NGS, a thechnoleg Hi-C.
Ochr yn ochr â hyn, casglwyd casgliad o 147 o adnoddau plasm cenhedlu, yn cwmpasu amrywiadau cynnyrch uchel, straen gwyllt, a rhywogaethau cysylltiedig, ar gyfer dilyniannu genom cyfan cynhwysfawr (WGS) gan ddefnyddio platfform Illumina.Bu'r data dilyniannu a ddilynodd yn destun dadansoddiad trylwyr o eneteg poblogaeth, gan alluogi dyrannu strwythur poblogaeth, amrywiaeth, ac anghyfartaledd cysylltedd.Mae'r dadansoddiad hwn yn taflu goleuni ar amrywiadau dofi ar draws poblogaethau.
Roedd ymchwiliadau pellach yn cynnwys dadansoddiad yn cwmpasu Fst, π, Tajima's D, ac LD, gyda'r nod o ddadorchuddio signalau dethol yn deillio o well cynnyrch latecs, gan ganolbwyntio'n benodol ar glonau Wickham.
Gan arwain at Ddadansoddiad Cymdeithas Genom-gyfan (GWAS), dynodwyd marcwyr yn gysylltiedig â nodweddion cnwd ac wedi hynny genynnau yn ymwneud â chynnyrch.Datgelodd dilysiad cychwynnol weithgareddau trawsgrifio nodedig ar draws gwahanol fwtaniaid ar gyfer dau enyn ERF, gan roi cipolwg rhagarweiniol ar eu harwyddocâd swyddogaethol.Mae cadarnhad pellach wedi'i amserlennu o fewn ymchwil sydd ar ddod.
Mae BMKGENE yn ymfalchïo mewn cyfrannu at ddilyniant genom cyfan helaeth y boblogaeth sylweddol hon, ynghyd â rôl sylweddol yn y dadansoddiad biowybodeg.Mae ein profiad helaeth yn cwmpasu dilyniannu NGS/TGS a dadansoddiad biowybodeg amlomeg ar draws amrywiaeth o 1000+ o rywogaethau.Edrychwn ymlaen at y posibilrwydd o weithio mewn partneriaeth â chi ar eich prosiectau sydd i ddod.
Cliciwch yma idysgu mwy am yr astudiaeth hon
Amser post: Awst-29-2023