Platfform | Maint y Llyfrgell | Cynnyrch Data Damcaniaethol (Fesul Cell) | Cywirdeb Sylfaen Sengl | Ceisiadau |
Nanopore | 8Kb, 10kb, 20kb, Ultralong, cDNA-PCR | 70-90Gb/Cell | 85-92% | Galwadau SV, De novo, Dilyniant hyd llawn, Iso-Seq, anodi genynnau, Canfod methylation DNA |
● Dros 5 mlynedd o brofiad ar lwyfan dilyniannu PacBio gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda gwahanol rywogaethau.
● Mae BMKGENE yn bartner swyddogol i Oxford Nanopore, gydag ardystiad RNA/DNA platfform deuol.
● Mae modelau prif ffrwd o ddilynwyr gyda chyfarpar cyflawn a digon o fewnbwn dilyniannu.
● Yn seiliedig ar lwyfan Nanopore, mae mwy na 10 o ymchwil anifeiliaid a phlanhigion Denovo wedi'u cyhoeddi mewn cyfnodolion o fri rhyngwladol.
Math Sampl | Swm | Crynodiad(Qubit ®) | Cyfrol | Purdeb | Eraill |
DNA genomig | Yn dibynnu ar y Gofyniad Data | ≥20ng/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.2; OD260/230 ≥1.5; Uchafbwynt clir ar 260 nm, dim halogiad | Mae angen mesur crynodiad gan Qubit a Qubit/Nanopore ≤ 2 |
Cyfanswm RNA | ≥1.2μg | ≥100μg/μl | ≥15μl | OD260/280=1.7-2.5; OD260/230=0.5-2.5 ; dim halogiad | Gwerth RIN ≥7.5 |
Asesiad Ansawdd Data Sampl DNA
Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.
BMKID | rawSeqNum | rawSumBase | glanSeqNum | glanSumBase | glanN50Len | glanN90Len | glanMeanLen | glanMaxLen | glanMeanQual |
DNA_BMK01 | 1,218,239 | 26.37 | 1,121,736 | 25.90 | 28,014 | 15,764 | 23,090 | 143,181 | 9 |
Asesiad Ansawdd Data Sampl RNA
Tabl 1. Ystadegau ar ddata glân.
Enw Ffeil | ID Cleient | DarllenNum | Rhif Sylfaen | N50 | Hyd Cymedr | Hyd Uchaf | MeanQscore |
RNA_BMK001 | C2 | 8,947,708 | 4,047,230,083 | 398 | 452 | 129,227 | C12 |
Ffigur 1. Darllen dosbarthiad hyd
Ffigur 2. Dosbarthiad sgôr ansawdd data glân
Ffigur 3. Hyd a sgôr ansawdd dosbarthiad data glân