Cynhyrchion

Dilyniant DNA/RNA - Dilyniant PacBio

Dilyniant DNA/RNA - Delwedd dan Sylw Sequencer PacBio

Mae platfform dilyniannu PacBio yn blatfform dilyniannu darllen hir, a elwir hefyd yn un o dechnolegau Dilyniannu Trydydd Cenhedlaeth (TGS).Mae'r dechnoleg graidd, un-moleciwl amser real (SMRT), yn grymuso cynhyrchu darlleniadau gyda degau o kilo-bas o hyd.Ar sylfaen “Dilyniannu-wrth-Synthesis”, mae cydraniad niwcleotid sengl yn cael ei gyflawni gan donfedd sero-ddelw (ZMW), lle mai dim ond cyfaint cyfyngedig ar y gwaelod (safle synthesis moleciwl) sy'n cael ei oleuo.Yn ogystal, mae dilyniannu SMRT i raddau helaeth yn osgoi rhagfarn dilyniant-benodol yn system NGS, gan nad oes angen y rhan fwyaf o gamau ymhelaethu PCR yn y broses adeiladu llyfrgell.

Llwyfan: Sequel II, Revio

Cysylltwch â Ni

Manylion Gwasanaeth

Canlyniadau Demo

Nodweddion

Dau ddull dilyniannu ar ddilyniant PacBio: Darllen Hir Parhaus (CLR) a Darllen Consensws Cylchol (CCS)

Modd Dilyniannu

Maint y Llyfrgell

Data DamcaniaetholCnwd (Fesul Cell)

Sengl-sylfaenCywirdeb

Ceisiadau

CLR

20Kb, 30Kb, ac ati.

80 Gb i 130 Gb

Tua.85%

De novo, SV yn galw, ac ati.

CCS

15-20 Kb

14 i 40 Gb/Cell (Dilyniant II)

70 i 110 Gb/Cell (Revio)

Yn dibynnu ar y samplau

Tua.99%

De novo, galwadau SNP/Indel/SV, Iso-Seq,

Cymhariaeth o berfformiad a nodweddion Refio a Sequel II

Termau	Sequel II system	System Revio	Cynyddu
Dwysedd uwch	8 miliwn ZMWs	25 miliwn o ZMWs	3x
Camau annibynnol	1	4	4x
Amseroedd rhedeg byrrach	30 awr	24 awr	1.25x
Genomau dynol 30X HiFi / blwyddyn	88	1,300	15x yn gyffredinol

Manteision Gwasanaeth

● Dros 8 mlynedd o brofiad ar lwyfan dilyniannu PacBio gyda miloedd o brosiectau caeedig gyda gwahanol rywogaethau.

● Wedi'i gyfarparu'n llawn â'r llwyfannau Dilyniannu PacBio diweddaraf, Refio i warantu digon o drwygyrch dilyniannu.

● Amser gweithredu cyflymach, cynnyrch data uwch a data mwy cywir.

● Wedi cyfrannu at gannoedd o gyhoeddiadau effaith uchel yn seiliedig ar PacBio.

Gofynion Sampl

Math Sampl

Swm

Crynodiad （Qubit®）

Cyfrol

Purdeb

Eraill

DNA genomig

Yn dibynnu ar y Gofyniad Data

≥50 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.2;
OD260/230=1.8-2.5；
Uchafbwynt clir ar 260 nm ，dim halogiadau

Mae angen mesur crynodiad gan Qubit a Qubit/Nanopore = 0.8-2.5

Cyfanswm RNA

≥1.2μg

≥120 ng/μl

≥15μl

OD260/280=1.7-2.5;
OD260/230=0.5-2.5；dim halogiadau

Gwerth RIN ≥7.5

5≥28S/18S≥1

Llif Gwaith Gwasanaeth

Paratoi sampl

Adeiladu llyfrgell

Dilyniannu

Dadansoddi data

Cyflwyno'r prosiect

Pâr o: Gwneuthurwr OEM Gwasanaeth Dilyniannu Mrna - Dilyniant hir di-godio-Illumina - Biomarciwr

Nesaf: Illumina a BGI

Cynnyrch Data 1.In-house

Data a gynhyrchwyd o 63 o gelloedd CCS (o 26 rhywogaeth)

DATA-PacBio-CCS-15 Kb	Cyfartaledd	Max	Minnau	Canolrif
Cynnyrch - is-ddarllen (Gb)	421.12	544.27	221.38	426.58
Yiled - CCS(Gb)	25.93	38.59	10.86	25.43
Polymerase N50	145,651	175,430	118,118	144,689
Isddarlleniadau N50	17,509	23,924	12,485	17,584
CCS N50	14,490	19,034	9,876	14,747
Hyd cyfartalog-Polymerase	67,995	89,379	49,664	66,433
Hyd cyfartalog-Is-ddarllen	15,866	21,036	11,657	16,012
Hyd cyfartalog-CCS	14,489	19,074	8,575	14,655

Data a gynhyrchwyd o 16 cell CLR (o 76 rhywogaeth)

DATA-PacBio-CLR-30Kb	Cyfartaledd	Max	Minnau	Canolrif
Cynnyrch - is-ddarllen (Gb)	142.20	291.40	50.55	142.49
Polymerase N50	39,456	121,191	15,389	35,231
Isddarlleniadau N50	28,490	41,012	14,430	29,063
Hyd cyfartalog-Polymerase	22,063	48,886	8,747	21,555
Hyd cyfartalog-Is-ddarllen	17,720	27,225	8,293	17,779

2.Data QC – DemoYstadegau ar gynnyrch data

Sampl	ccs Darllen Rhif	Cyfanswm sylfaen ccs (bp)	ccs yn darllen N50 (bp)	ccs Hyd Cymedrig (bp)	ccs Darllen Hiraf (bp)	isddarllen gwaelodion (bp)	cyfradd ccs(%)
PB_BMKxxx	3,444,159	54,164,122,586	15,728	15,726	36,110	863,326,330,465	6.27