dilyniannu circRNA-Illumina
Nodweddion
● dihysbyddiad rRNA wedi'i ddilyn gan baratoi llyfrgell cyfeiriadol, gan alluogi dilyniannu data sy'n benodol i'r llinyn.
● Mae llif gwaith biowybodus yn galluogi rhagfynegiad circRNA a meintioli mynegiant
Manteision Gwasanaeth
●Llyfrgelloedd RNA mwy cynhwysfawr:rydym yn defnyddio disbyddiad rRNA yn lle disbyddiad RNA llinol yn ein paratoadau cyn-lyfrgell, gan sicrhau bod y data dilyniannu yn cynnwys nid yn unig circRNA ond hefyd mRNA ac lncRNA, gan alluogi dadansoddi ar y cyd ar y setiau data hyn
●Dadansoddiad dewisol o rwydweithiau RNA mewndarddol cystadleuol (ceRNA).: darparu mewnwelediad dyfnach i fecanweithiau rheoleiddio cellog
●Arbenigedd helaeth: gyda hanes o brosesu dros 20,000 o samplau yn BMK, yn rhychwantu mathau amrywiol o samplau a phrosiectau lncRNA, mae ein tîm yn dod â chyfoeth o brofiad i bob prosiect.
●Rheoli Ansawdd Trwyadl: rydym yn gweithredu pwyntiau rheoli craidd ar draws pob cam, o baratoi sampl a llyfrgell i ddilyniannu a biowybodeg.Mae'r monitro manwl hwn yn sicrhau y cyflwynir canlyniadau o ansawdd uchel yn gyson.
● Cefnogaeth Ôl-werthu: Mae ein hymrwymiad yn ymestyn y tu hwnt i gwblhau'r prosiect gyda chyfnod gwasanaeth ôl-werthu o 3 mis.Yn ystod y cyfnod hwn, rydym yn cynnig dilyniant prosiect, cymorth datrys problemau, a sesiynau Holi ac Ateb i fynd i'r afael ag unrhyw ymholiadau sy'n ymwneud â'r canlyniadau.
Gofynion Sampl a Chyflenwi
| Llyfrgell | Platfform | Data a argymhellir | Data QC |
| Poly A cyfoethogi | Illumina PE150 | 16-20 Gb | C30≥85% |
Gofynion Sampl:
Niwcleotidau:
| Conc.(ng/μl) | Swm (μg) | Purdeb | Uniondeb |
| ≥ 100 | ≥ 0.5 | OD260/280=1.7-2.5 OD260/230=0.5-2.5 Dangosir halogiad protein neu DNA cyfyngedig neu ddim o gwbl ar y gel. | Ar gyfer planhigion: RIN≥6.5; Ar gyfer anifeiliaid: RIN≥7.0; 5.0≥28S/18S≥1.0; drychiad gwaelodlin cyfyngedig neu ddim drychiad gwaelodlin |
● Planhigion:
Gwraidd, Coesyn neu Petal: 450 mg
Deilen neu Had: 300 mg
Ffrwythau: 1.2 g
● Anifail:
Calon neu Berfedd: 450 mg
Viscera neu Ymennydd: 240 mg
Cyhyr: 600 mg
Esgyrn, Gwallt neu Groen: 1.5g
● Arthropodau:
pryfed: 9g
Cramenogion: 450 mg
● Gwaed cyfan:2 diwb
● Celloedd: 106 celloedd
● Serwm a Plasma:6 mL
Cyflwyno Sampl a Argymhellir
Cynhwysydd: tiwb centrifuge 2 ml (Ni argymhellir ffoil tun)
Labelu enghreifftiol: Grŵp+ at ei gilydd ee A1, A2, A3;B1, B2, B3......
Cludo:
1. Iâ sych: Mae angen pacio samplau mewn bagiau a'u claddu mewn rhew sych.
2. Tiwbiau RNAstable: Gellir sychu samplau RNA mewn tiwb sefydlogi RNA (ee RNAstable®) a'u cludo yn nhymheredd yr ystafell.
Llif Gwaith Gwasanaeth
Dyluniad arbrawf
Cyflwyno sampl
echdynnu RNA
Adeiladu llyfrgell
Dilyniannu
Dadansoddi data
Gwasanaethau ôl-werthu
Biowybodeg
rhagfynegiad circRNA: dosbarthiad cromosomaidd
CircRNAs a fynegwyd yn wahaniaethol – plot llosgfynydd
CircRNAs a fynegwyd yn wahaniaethol – clystyru hierarchaidd
Cyfoethogi genynnau gwesteiwr circRNA yn swyddogaethol
Archwiliwch y datblygiadau ymchwil a hwyluswyd gan wasanaethau dilyniannu circRNA BMKGene trwy gasgliad o gyhoeddiadau wedi'u curadu.
Wang, X. et al.(2021) 'Mae CPSF4 yn rheoleiddio ffurfiant circRNA a thawelu genynnau trwy gyfrwng microRNA mewn carsinoma hepatogellog', Oncogene 2021 40:25, 40(25), tt. 4338-4351.doi: 10.1038/s41388-021-01867-6.
Xia, K. et al.(2023) 'Mae trawsgrifiad oo-ymatebol X yn datgelu rôl yr RNA133 crwn mewn ymwrthedd i glefydau trwy reoleiddio mynegiant OsARAB mewn reis', Phytopathology Research, 5(1), tt. 1–14.doi: 10.1186/S42483-023-00188-8/FFIGURAU/6.
Y, H. et al.(2023) 'Mae CPSF3 yn modiwleiddio cydbwysedd trawsgrifiadau cylchol a llinol mewn carsinoma hepatogellog'.doi: 10.21203/RS.3.RS-2418311/V1.
Zhang, Y. et al.(2023) 'Gwerthusiad cynhwysfawr o circRNAs mewn cardiomyopathi cirrhotig cyn ac ar ôl trawsblannu afu', International Immunopharmacology, 114, t.109495. doi: 10.1016/J.INTIMP.2022.109495.
