BMKCloud Log in
条形 banner-03

Zprávy

Sekvenování plné délky transkriptomu založené na nanoporech

Sekvenování nanoporů se odlišuje od jiných sekvenačních platforem tím, že nukleotidy jsou čteny přímo bez syntézy DNA a generují dlouhé čtení o desítkách kilobází.To umožňuje přímé čtení přepisů v plné délce a řešení problémů v transkriptomických studiích.

√ Nízké zkreslení specifické pro sekvenci

√ Kompletní čtení cDNA pro studie genové struktury

√ K pokrytí stejného počtu přepisů je potřeba méně dat

√ Identifikace více izoforem na gen

√ Kvantifikace exprese na úrovni izoforem

nanopóry-1

Typický bioinformatický kanál

Plná délka-trans-bix-1024x254

Nejnovější úspěšné případy s technologiemi Biomarker

1. Srovnávací analýzy transkriptomů plné délky odhalují vývojovou dynamiku kmene Gnetum luofuense

Časopis: Frontiers in Genetics

Zveřejněno: březen 2021

Klíčová slova: MinION |Alternativní spojování |APA |lncRNA |Diferenciálně vyjádřené transkripty

Přečtěte si Fulltext

2. Jednosměrný pohyb malých RNA z výhonků ke kořenům v mezidruhových heterograftech

Časopis: Nature Plants

Zveřejněno: leden 2021

Klíčová slova: Nanopore |Illumina |detekce mobilní mRNA v plné délce

3. Kompletní transkriptomová analýza kořenů chřestu odhaluje molekulární mechanismus tolerance soli vyvolaný arbuskulárními mykorhizními houbami

Časopis: Environmentální a experimentální botanika

Zveřejněno: leden 2021

Klíčová slova: MinION |Diferenciálně vyjádřené přepisy |Transkripční faktory |Alternativní spojování

4. Fyziologické charakteristické změny a úplný transkriptom kořenů a listů růže (Rosa chinensis) v reakci na stres ze sucha

Časopis: Plant and Cell Physiology

Zveřejněno: říjen 2020

Klíčová slova: PromethION |Diferenciálně vyjádřené přepisy |Funkční předpověď |Sestřihané izoformy |TF a lncRNA

5. Analýza a komplexní srovnání PacBio a nanopórového sekvenování RNA transkriptomu Arabidopsis

Časopis: Plant Method

Zveřejněno: duben 2020

Klíčová slova: GridION |PromethION |Pokračování PacBio |Illumina NovaSeq |Zarovnání genomu |Identifikace přepisu |Alternativní spojování |SSR |LncRNA |Kvantifikace izoforem

Novinky a hlavní události si klade za cíl sdílet nejnovější úspěšné případy s Biomarker Technologies, zachycovat nové vědecké úspěchy i prominentní techniky použité během studie.


Čas odeslání: leden-08-2022

Pošlete nám svou zprávu: