-
Proteomika
Proteomika zahrnuje aplikace technologií pro kvantifikaci celkového obsahu proteinů v buňce, tkáni nebo organismu.Technologie založené na proteomice se využívají v různých kapacitách pro různá výzkumná nastavení, jako je detekce různých diagnostických markerů, kandidátů na výrobu vakcín, pochopení mechanismů patogenity, změny vzorců exprese v reakci na různé signály a interpretace funkčních proteinových drah u různých onemocnění.V současnosti se kvantitativní proteomické technologie dělí především na kvantitativní strategie TMT, Label Free a DIA.
-
Metabolomika
Metabolom je koncovým následným produktem genomu a skládá se z celkového komplementu všech molekul s nízkou molekulovou hmotností (metabolitů) v buňce, tkáni nebo organismu.Metabolomika si klade za cíl měřit širokou škálu malých molekul v kontextu fyziologických podnětů nebo chorobných stavů.Metabolomické metodiky spadají do dvou odlišných skupin: necílená metabolomika, zamýšlená komplexní analýza všech měřitelných analytů ve vzorku včetně chemických neznámých pomocí GC-MS/LC-MS, a cílená metabolomika, měření definovaných skupin chemicky charakterizovaných a biochemicky anotované metabolity.
-
Analýza hromadného segregantu
Bulked segregant analysis (BSA) je technika používaná k rychlé identifikaci genetických markerů spojených s fenotypem.Hlavní pracovní postup BSA zahrnuje výběr dvou skupin jedinců s extrémně protichůdnými fenotypy, spojení DNA všech jedinců do dvou objemů DNA, identifikaci rozdílných sekvencí mezi dvěma pooly.Tato technika byla široce využívána při identifikaci genetických markerů silně spojených s cílenými geny v genomech rostlin/zvířat.
-
Sekvenování DNA/RNA – Nanopore Sequencer
ONT sekvenování je technologie sekvenování elektrických signálů v reálném čase s jednou molekulou založená na nanopórech, princip sekvenování každé platformy je stejný.Dvouřetězcová DNA/RNA se naváže na nanoporézní protein uložený v biofilmu a odvíjí se pod vedením motorického proteinu, působením rozdílu napětí z obou stran biofilmu procházejí řetězce DNA/RNA proteinem nanopórového kanálu v určitém čase. hodnotit.Vzhledem k rozdílům v chemických vlastnostech různých bází na řetězci DNA/RNA, když jedna báze nebo molekula DNA prochází nanopórovým kanálem, způsobí změnu různých elektrických signálů.Detekcí a odpovídajícím způsobem těmto signálům lze vypočítat odpovídající typy bází a dokončit detekci sekvence v reálném čase.
-
Sekvenování DNA/RNA -PacBio Sequencer
Sekvenční platforma PacBio je sekvenační platforma s dlouhým čtením, která je také známá jako jedna z technologií sekvenování třetí generace (TGS).Základní technologie, jedna molekula v reálném čase (SMRT), umožňuje generování čtení o délce desítek kilobází.Na základě „Sequencing-by-Synthesis“ je rozlišení jednoho nukleotidu dosaženo pomocí Zero-mode vlnovodu (ZMW), kde je osvětlen pouze omezený objem na dně (místo syntézy molekuly).Kromě toho sekvenování SMRT do značné míry zabraňuje sekvenčně specifickému zkreslení v systému NGS v tom, že většina kroků PCR amplifikace není v procesu konstrukce knihovny vyžadována.
Platforma: Sequel II, Revio
