BMKGENE poskytla služby sekvenování prostorových transkriptomů pro studii „STEEL umožňuje vymezování časoprostorových transkriptomických dat ve vysokém rozlišení“, která byla publikována v Briefings in Bioinformatics.
Tato studie navrhla bez dozoru a mnohočetný algoritmus založený na učení, Spatial Transscriptome cell typE clustering (STEEL), který identifikuje domény z prostorového transkriptomu shlukováním kuliček vykazujících jak vysoce podobné profily genové exprese, tak blízkou prostorovou vzdálenost na způsob grafů.
Komplexní hodnocení STEEL na prostorových transkriptomických souborech dat z platformy 10X Visium ukazuje, že nejen dosahuje vysokého rozlišení pro charakterizaci jemných struktur myšího mozku, ale také umožňuje integraci více tkáňových preparátů individuálně analyzovaných do většího.
S rozvojem technologií prostorového transkriptomu bude mít naše metoda velkou použitelnost při identifikaci domén a rekonstrukci atlasu genové exprese.
Kliknětetadyse o této studii dozvědět více.
Čas odeslání: 20. října 2023