Jednou z důležitých zahradnických vlastností, která odlišuje pupkové pomeranče od jiných běžných odrůd sladkých pomerančů, je přítomnost pupíku na ovoci.Tato vlastnost je také důležitým kritériem pro klasifikaci zahradnických odrůd sladkých pomerančů.
Klienti BMKGENE využili vlastní sekvenační technologii SLAF společnosti BMKGENE k provedení studie s názvem „Těžba genů souvisejících s kvalitou ovoce ve sladkých pomerančích na základě specifického sekvenování fragmentů se zesíleným lokusem.“
Studie zahrnovala sekvenování 240 zdrojů zárodečné plazmy sladkého pomeranče s širokou genetickou rozmanitostí a různým geografickým původem, což vedlo k 497,82 Mb krátkých dat.Analýza dat poskytla 1 467 968 genotypů SNP v celém genomu.Využitím Fst analýzy studie identifikovala 6 kandidátních genů souvisejících s přítomností pupku, hmotností ovoce a titrovatelnou kyselostí, což poskytuje základ pro cílené zlepšování odrůd sladkých pomerančů.
Pro sekvenování populace ve velkém měřítku je sekvenování fragmentů s amplifikovaným lokusem (SLAF) nákladově efektivnější a vysoce efektivní ve srovnání se sekvenováním celého genomu (WGS).
Kliknětetadyse o této studii dozvědět více.
Čas odeslání: prosinec-05-2023