BMKCloud Log in
条形 banner-03

produkty

Sekvenování eukaryotické mRNA-Illumina

Sekvenování mRNA umožňuje profilování všech mRNA transkriptovaných z buněk za specifických podmínek.Je to výkonná technologie pro odhalení profilu genové exprese, genových struktur a molekulárních mechanismů určitých biologických procesů.K dnešnímu dni je sekvenování mRNA široce využíváno v základním výzkumu, klinické diagnostice, vývoji léků atd.

Platforma: Illumina NovaSeq Platform


Podrobnosti o službě

Bioinformatika

Výsledky ukázky

Výhody

● Zkušení: V BMK bylo zpracováno více než 200 000 vzorků pokrývajících různé typy vzorků, včetně buněčné kultury, tkáně, tělesné tekutiny atd. a více než 7 000 projektů mRNA-Seq pokrývajících různé oblasti výzkumu bylo uzavřeno.

● Přísný systém kontroly kvality: Základní body kontroly kvality ve všech krocích včetně přípravy vzorků, přípravy knihovny, sekvenování a bioinformatiky jsou pečlivě sledovány, aby bylo možné poskytovat vysoce kvalitní výsledky.

● Více databází dostupných pro anotaci funkcí a studie obohacování pro splnění různých výzkumných cílů.

● Poprodejní služby: Poprodejní služby platné 3 měsíce po dokončení projektu, včetně sledování projektů, řešení problémů, dotazů a odpovědí na výsledky atd.

Vzorové požadavky a dodání

Knihovna Strategie sekvenování Doporučené údaje Kontrola kvality
Obohaceno o Poly A Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85 %

Vzorové požadavky:

Nukleotidy:

Konc. (ng/μl)

množství (μg)

Čistota

Integrita

≥ 20

≥ 0,5

OD260/280 = 1,7-2,5

OD260/230=0,5-2,5

Omezená nebo žádná kontaminace proteiny nebo DNA na gelu.

Pro rostliny: RIN≥6,5;

Pro zvířata: RIN≥7,0;

5,0≥28S/18S≥1,0;

omezená nebo žádná základní elevace

Tkáň: Hmotnost (suchá):≥1 g
*Pro tkáň menší než 5 mg doporučujeme odeslat bleskově zmrazený (v tekutém dusíku) vzorek tkáně.

Buněčná suspenze:Počet buněk = 3×106- 1×107
*Doporučujeme zasílat zmrazený buněčný lyzát.V případě, že počet buněk je menší než 5×105.

Vzorky krve:Objem≥1 ml

Mikroorganismus:Hmotnost ≥ 1 g

Doporučené doručení vzorku

Nádoba: 2 ml centrifugační zkumavka (nedoporučuje se cínová fólie)

Označení vzorků: Skupina+replikace např. A1, A2, A3;B1, B2, B3......

Náklad:

  1. Suchý led: Vzorky je třeba zabalit do sáčků a zahrabat do suchého ledu.
  2. Zkumavky RNAstable: Vzorky RNA lze sušit ve zkumavce pro stabilizaci RNA (např. RNAstable®) a přepravovat při pokojové teplotě.

Tok servisní práce

Ukázka kontroly kvality

Návrh experimentu

dodání vzorku

Vzorová dodávka

Pilotní experiment

Extrakce RNA

Příprava knihovny

Stavba knihovny

Sekvenování

Sekvenování

Analýza dat

Analýza dat

Poprodejní služby

Poprodejní služby


  • Předchozí:
  • Další:

  • Bioinformatika

    wps_doc_10

    Eukaryotické Pracovní postup analýzy sekvenování mRNA

    Bioinformatika

    ØKontrola kvality nezpracovaných dat

    ØReferenční zarovnání genomu

    ØAnalýza struktury přepisu

    ØKvantifikace exprese

    ØAnalýza diferenciální exprese

    ØAnotace a obohacení funkcí

    1.Křivka saturace dat mRNA

    3(1)

    2.Diferenciální expresní analýza-Vulcano plot

    4(1)

    3.Anotace KEGG na stupních

    5(1)

    4.GO klasifikace na stupních

    6(1)

    získat cenovou nabídku

    Zde napište svou zprávu a pošlete nám ji

    Pošlete nám svou zprávu: