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Sequenza di metatrascriptome
A sequenza di metatranscriptome identifica l'espressione genica di i microbi (sia eucarioti sia procarioti) in ambienti naturali (vale à dì terra, acqua, mare, feci, è gut.). In particulare, stu serviziu vi permette di ottene un prufilu d'espressione genica sana di cumunità microbiche cumplesse, analisi tassonomica. di spezie, analisi di arricchimentu funziunale di geni espressi diversamente, è più.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
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Genoma fungicu
Tecnulugii di Biomarker furnisce indagine di genoma, genoma fine è genoma pene-completu di fungi secondu u scopu di ricerca specificu.A sequenza di u genoma, l'assemblea è l'annotazione funzionale ponu esse ottenute cumminendu a sequenza di a prossima generazione + a sequenza di a terza generazione per ottene l'assemblea di genoma di altu livellu.A tecnulugia Hi-C pò ancu esse impiegata per facilità l'assemblea di u genoma à u livellu di u cromusomu.
piattaforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Piattaforma Illumina NovaSeq
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Toolkits
BMKCloud hè una piattaforma bioinformatica di punta chì furnisce una soluzione unica per i prugrammi genomici, chì hè largamente affidata da circadori in diverse aree cumprese mediche, agriculi, ambientali, ecc. BMKCloud hè impegnatu à furnisce servizii integrati, affidabili è efficaci cumpresi piattaforme è strumenti di analisi bioinformatica. , risorse informatiche, basa di dati publica, corsi in linea bioinformtic, etc. BMKCloud hà diversi strumenti bioinformatici friquenti chì includenu annotazione di geni, strumenti genetichi evolutivi, ncRNA, cuntrollu di qualità di dati, assemblea, allineamentu, estrazione di dati, mutazioni, statistiche, generatore di figure, sequenza. analisi, etc.
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Genoma cumpletu di i batteri
Biomarker Technologies furnisce un serviziu di sequenza per a custruzzione di genoma cumpletu di batteri cù gap zero.U flussu di travagliu principale di a custruzzione completa di u genoma di i batteri include a sequenza di a terza generazione, l'assemblea, l'annotazione funzionale è l'analisi bioinformatica avanzata chì cumpiendu scopi di ricerca specifichi.Un prufilu più cumpletu di u genoma di i batteri permette à a revelazione di i meccanismi fundamentali sottumessi à i so prucessi biologichi, chì puderia ancu furnisce una riferenza preziosa per e ricerche genomiche in spezie eucarioti superiori.
piattaforma:Nanopore PromethION P48 + piattaforma Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
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petit RNA
I picculi RNA sò tipu di RNA non codificante curtu cù una durata media di 18-30 nt, cumprese miRNA, siRNA è piRNA.Questi picculi RNA sò stati massivamenti rappurtati per esse implicati in diversi prucessi biologichi cum'è a degradazione di mRNA, l'inibizione di a traduzzione, a furmazione di heterochromatin, etc. L'analisi di sequenza di SmallRNA hè stata largamente appiicata in studii nantu à u sviluppu di l'animali / piante, a malatia, u virus, etc. A piattaforma di analisi di sequenza hè custituita da analisi standard è data mining avanzata.In basa di dati RNA-seq, l'analisi standard pò ottene l'identificazione è a predizione di miRNA, a predizione di geni di destinazione miRNA, l'analisi di l'annotazione è l'espressione.L'analisi avanzata permette a ricerca è l'estrazione di miRNA persunalizati, a generazione di diagrammi Venn, miRNA è a creazione di rete di geni di destinazione.
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NGS-WGS (Illumina/BGI)
NGS-WGS hè una piattaforma di analisi di re-sequenza di genoma intera, chì hè sviluppata nantu à a basa di una ricca sperienza in Biomarker Technologies.Questa piattaforma di facilità d'utilizazione permette a presentazione rapida di un flussu di travagliu di analisi integrata solu per stabilisce uni pochi di parametri di basa, chì si adatta à i dati di sequenza di DNA generati da a piattaforma Illumina è da a piattaforma di sequenza BGI.Sta piattaforma hè implementata nantu à u servitore di l'informatica d'altu rendiment, chì permette l'analisi di dati altamente efficiente in un tempu assai limitatu.L'estrazione di dati persunalizata hè dispunibule nantu à a basa di l'analisi standard, cumpresa a ricerca di geni mutati, u disignu di u primu PCR, etc.
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mRNA (riferimentu)
U transcriptome hè u ligame trà l'infurmazione genetica genomica è u proteoma di a funzione biologica.A regulazione di u livellu trascrizionale hè u modu di regulazione più impurtante è più studiatu di l'organisimi.A sequenza di u transcriptome pò sequenzià u transcriptome in ogni puntu in u tempu o in ogni cundizione, cù una risoluzione precisa à un unicu nucleotide. Pò riflette dinamicamente u livellu di trascrizzione genica, identificà è quantificà simultaneamente trascrizioni rari è normali, è furnisce l'infurmazioni strutturali di trascrizioni specifiche di mostra.
Attualmente, a tecnulugia di sequencing transcriptome hè stata largamente usata in l'agronomia, a medicina è altri campi di ricerca, cumprese a regulazione di u sviluppu di l'animali è di e piante, l'adattazione ambientale, l'interazione immune, a localizazione di geni, l'evoluzione genetica di e spezie è a rilevazione di tumori è di malatie genetiche.
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Metagenomica (NGS)
Questa piattaforma di analisi hè pensata per l'analisi di dati metagenomici di fucile nantu à a basa di anni di sperienza.Hè custituitu un flussu di travagliu integratu chì cuntene diverse analisi di metagenomica cumune cum'è trattamentu di dati, studii à livellu di spezie, studii à livellu di funzione genica, binning metagenome, ecc. , paràmetru, generazione di figura persunalizata, etc.
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LncRNA
Long non-coding RNAs (lncRNA) sò un tipu di trascrizioni cù una lunghezza più longa di 200 nt, chì ùn sò micca capaci di codificà e proteine.L'evidenza cumulativa suggerisce chì a maiò parte di lncRNAs sò assai probabili di esse funziunali.Tecnulugie di sequencing high-throughput è strumenti di analisi bioinformatica ci permettenu di revelà sequenze di lncRNA è infurmazioni di posizionamentu in modu più efficiente è ci portanu à scopre lncRNA cù funzioni regulatori cruciali.BMKCloud hè fieru di furnisce à i nostri clienti una piattaforma di analisi di sequenza di lncRNA per ottene una analisi lncRNA rapida, affidabile è flessibile.
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GWAS
U studiu di l'associazione di u genoma (GWAS) hà u scopu di identificà varianti genetichi (genotipu) chì sò assuciati cù caratteristiche specifiche (fenotipu).Studi GWA investiganu i marcatori genetichi attraversanu u genoma sanu di un gran numaru di individui è predice l'associazioni genotipu-fenotipu per analisi statistiche à livellu di pupulazione.A resequenza di u genoma sanu pò scopre tutte e varianti genetiche.Accoppiendu cù dati fenotipichi, GWAS pò esse processatu per identificà SNP, QTL è geni candidati in relazione à u fenotipu, chì sustene fermamente l'allevamentu mudernu di animali / piante.SLAF hè una strategia di sequenza di genoma simplificata sviluppata da sè, chì scopre marcatori distribuiti in tuttu u genoma, SNP.Questi SNP, cum'è marcatori genetichi moleculari, ponu esse processati per studii d'associazione cù caratteristiche mirate.Hè una strategia costu-efficace in l'identificazione di tratti cumplessi associati variazioni genetiche.
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Nanopore Trascrittomica a piena lunghezza
Isoforme alternative cumplesse è variabili in l'organisimi sò meccanismi genetichi impurtanti per regulà l'espressione genica è a diversità di prutezione.L'identificazione precisa di e strutture di trascrizione hè a basa per un studiu approfonditu di i mudelli di regulazione di l'espressione genica.A piattaforma di sequenza Nanopore hà purtatu cù successu u studiu transcriptomicu à livellu isoforme.Questa piattaforma di analisi hè pensata per analizà i dati RNA-Seq generati nantu à a piattaforma Nanopore nantu à a basa di u genoma di riferimentu, chì ottene analisi qualitative è quantitative in u livellu di geni è in u livellu di trascrizioni.
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circ-RNA
Circular RNA (circRNA) hè un tipu di RNA non-codificante, chì sò recentemente truvati à ghjucà un rolu vitale in e rete regulatori implicati in u sviluppu, a resistenza ambientale, etc. Distintu da e molécule di RNA lineari, per esempiu mRNA, lncRNA, 3′ è 5′ l'estremità di circRNA sò uniti per furmà una struttura circular, chì li salva da a digestioni di l'exonuclease è sò più stabili di a maiò parte di l'RNA lineari.CircRNA sò stati truvati per avè diverse funzioni in a regulazione di l'espressione genica.CircRNA pò esse cum'è ceRNA, chì unisce miRNA in modu competitivu, cunnisciutu cum'è spugna miRNA.A piattaforma di analisi di sequenza di CircRNA permette l'analisi di a struttura è l'espressione di circRNA, a predizione di destinazione è l'analisi cumuna cù altri tipi di molécule di RNA
