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Sequenza metagenomica -NGS
Metagenome si riferisce à una cullizzioni di materiale geneticu tutale di una cumunità mista d'urganismi, cum'è metagenome ambientale, metagenome umanu, etc. Contene genomi di i microorganismi cultivabili è incultivabili.A sequenza metagenomica hè un strumentu molekulari utilizatu per analizà i materiali genomici misti estratti da campioni ambientali, chì furnisce infurmazioni detallate in a diversità è l'abbundanza di spezie, a struttura di a pupulazione, a relazione filogenetica, i geni funzionali è a rete di correlazione cù fatturi ambientali.
piattaforma:Piattaforma Illumina NovaSeq
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Sequencing Metagenomic-Nanopore
A metagenomica hè un strumentu molekulari utilizatu per analizà i materiali genomici misti estratti da campioni ambientali, chì furnisce infurmazioni detallate in a diversità è l'abbundanza di e spezie, a struttura di a pupulazione, a relazione filogenetica, i geni funzionali è a rete di correlazione cù i fatturi ambientali, etc. I plataformi di sequenza Nanopore anu introduttu recentemente. à i studii metagenomici.A so prestazione eccezziunale in a lunghezza di lettura hà largamente rinfurzata l'analisi metagenomica in a valle, in particulare l'assemblea metagenomica.Pigliendu i vantaghji di a lunghezza di lettura, u studiu metagenomicu basatu in Nanopore hè capaci di ottene un assemblamentu più cuntinuu cumparatu cù a metagenomica di fucile.Hè statu publicatu chì a metagenomica basata in Nanopore hà generatu cun successu genomi batterichi cumpleti è chjusi da microbiomi (Moss, EL, et. al,Natura Biotech, 2020)
piattaforma:Nanopore PromethION P48
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16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
A subunità nantu à 16S è 18S rRNA chì cuntene sia regioni altamente conservate è ipervariabili hè una perfetta impronta molecolare per l'identificazione di organismi procarioti è eucarioti.Apprufittannu di a sequenza, sti ampliconi ponu esse mirati in basa di e parti cunsirvate è e regioni ipervariabili ponu esse cumpletamente carattarizati per l'identificazione microbica cuntribuiscenu à studii chì coprenu l'analisi di a diversità microbica, a tassonomia, a filogenesia, ecc. ) a sequenza di a piattaforma PacBio permette di ottene letture longu assai precise, chì puderanu copre ampliconi di lunghezza completa (circa 1,5 Kb).A vista allargata di u campu geneticu hà aumentatu assai a risoluzione in l'annotazione di spezie in a comunità di batteri o fungi.
piattaforma:PacBio Sequel II
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16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
A sequenza di l'amplicone 16S / 18S / ITS hà per scopu di revelà a filogenesi, a tassonomia è l'abbundanza di spezie in una comunità microbica investigando i prudutti PCR di marcatori genetichi di pulizia chì cuntenenu parti altamente conversate è ipervariabili.L'intruduzione di queste impronte moleculari perfette da Woeses et al, (1977) permette un prufilu di microbioma senza isolamentu.A sequenza di 16S (bacteria), 18S (fungi) è spaziatore trascrittu internu (ITS, fungi) permette l'identificazione di e spezie abbundanti è di spezie rare è micca identificate.Sta tecnulugia hè diventata una strumenta largamente applicata è maiò per identificà a cumpusizioni microbiana differenziale in diversi ambienti, cum'è bocca umana, intestini, feci, etc.
piattaforma:Piattaforma Illumina NovaSeq
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Re-Sequencing di u genoma tutale di batteri è fungi
A re-sequenza di u genoma sanu di batteri è fungi hè un strumentu criticu per cumplettà i genomi di battìri è fungi cunnisciuti, è ancu di paragunà parechji genomi o di cartografia genomi di novi organismi.Hè di grande impurtanza à sequenzianu genomi interi di batteri è fungi per generà genomi di riferimentu precisi, per fà l'identificazione microbica è altri studii comparativi di genoma.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
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Sequenza di metatrascriptome
A sequenza di metatranscriptome identifica l'espressione genica di i microbi (sia eucarioti sia procarioti) in ambienti naturali (vale à dì terra, acqua, mare, feci, è gut.). In particulare, stu serviziu vi permette di ottene un prufilu d'espressione genica sana di cumunità microbiche cumplesse, analisi tassonomica. di spezie, analisi di arricchimentu funziunale di geni espressi diversamente, è più.
Piattaforma: piattaforma Illumina NovaSeq
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Genoma fungicu
Tecnulugii di Biomarker furnisce indagine di genoma, genoma fine è genoma pene-completu di fungi secondu u scopu di ricerca specificu.A sequenza di u genoma, l'assemblea è l'annotazione funzionale ponu esse ottenute cumminendu a sequenza di a prossima generazione + a sequenza di a terza generazione per ottene l'assemblea di genoma di altu livellu.A tecnulugia Hi-C pò ancu esse impiegata per facilità l'assemblea di u genoma à u livellu di u cromusomu.
piattaforma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Piattaforma Illumina NovaSeq
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Genoma cumpletu di i batteri
Biomarker Technologies furnisce un serviziu di sequenza per a custruzzione di genoma cumpletu di batteri cù gap zero.U flussu di travagliu principale di a custruzzione completa di u genoma di i batteri include a sequenza di a terza generazione, l'assemblea, l'annotazione funzionale è l'analisi bioinformatica avanzata chì cumpiendu scopi di ricerca specifichi.Un prufilu più cumpletu di u genoma di i batteri permette à a revelazione di i meccanismi fundamentali sottumessi à i so prucessi biologichi, chì puderia ancu furnisce una riferenza preziosa per e ricerche genomiche in spezie eucarioti superiori.
piattaforma:Nanopore PromethION P48 + piattaforma Illumina NovaSeq
PacBio Sequel II
