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Sequenza di transcriptome full-length basatu in nanopori

A sequencing Nanopore si distingue da altre piattaforme di sequenza, in chì i nucleotidi sò letti direttamente senza sintesi di DNA è genera letture longu à decine di kilobases.Questu permette a lettura diretta di trascrizioni integrali è affruntà e sfide in studii transcriptomici.

√ Bassa preghjudiziu specificu di sequenza

√ Lettura integrale di cDNA per studii di struttura di geni

√ Meno dati necessarii per copre u listessu numeru di trascrizioni

√ Identificazione di parechje isoforme per genu

√ Quantificazione di l'espressione à u livellu di l'isoforma

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Pipeline di Bioinformatica tipica

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Ultimi Casi di Successu cù Biomarker Technologies

1. L'analisi comparative di transcriptomi full-length revelanu a dinamica di sviluppu di u troncu di Gnetum luofuense

Journal: Frontières in Genetica

Publicatu: marzu 2021

Parole chjave: MinION |Splicing alternativu |APA |lncRNA |Trascrizioni spressi di manera differenziale

Leghjite u testu cumpletu

2. Movimentu unidirezionale di picculi RNA da i rimjiet à e radiche in heterografts interspecific

Journal: Nature Plants

Publicatu: ghjennaghju 2021

Parole chjave: Nanopore |Illumina |rilevazione di mRNA mobile à longu andà

3. L'analisi di transcriptome à longu andà di e radiche d'asparagus revela u mecanismu moleculare di a tolleranza di u sali indutta da fungi mycorhizal arbuscular.

Journal: Botanica Ambientale è Sperimentale

Publicatu: ghjennaghju 2021

Parole chjave: MinION |Trascrizioni spressi diffarentimenti |Fattori di trascrizzione |Splicing alternativu

4. Cambiamenti caratteristiche fisiulogichi è Transcriptome Full-Length di Rose (Rosa chinensis) Roots è Foglie in Risposta à u Stress di Seca

Journal: Physiology Plant and Cell

Publicatu: Ottobre 2020

Keywords: PromethION |Trascrizioni spressi diffarentimenti |Predizzione funziunale |Isoforme spliced ​​|TF è lncRNA

5. Analisi è paragone cumpletu di PacBio è sequencing RNA basatu in nanopori di u transcriptome Arabidopsis

Journal: Metudu di a pianta

Publicatu: Apr. 2020

Parole chjave: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Allineamentu di u genoma |Identificazione di a trascrizione |Splicing alternativu |SSR |LncRNA |Quantificazione isoforme

Notizie è Highlights hà u scopu di sparta l'ultimi casi di successu cù Biomarker Technologies, catturà novi successi scientifichi è tecniche prominenti applicate durante u studiu.


Tempu di Postu: 08-Jan-2022

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