Scuprite u putenziale di studià a varietà salvatica di spezie di ricerca, esemplificatu da un casu pivotale da i clienti di BMKGENE.Recentemente publicatu in l'edizione di questu annu di u Plant Biotechnology Journal, l'articulu intitulatu "Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield" hè una riferenza preziosa.
L'arburu di gomma brasiliana (Hevea brasiliensis) hè altu cum'è una fonte di gomma naturali pivotale.In tuttu u seculu passatu, i metodulugii tradiziunali di ripruduzzione pruvucavanu un rimarchevule sei volte in a produzzione di gomma.Eppuru, a roccia genetica sottostante rispunsevuli di u potenziale rinfurzà di u rendiment di gomma resta enigmatica.
Stu studiu hà imbarcatu à custruisce un genoma à livellu di cromusomu per l'arbre di gomma salvaticu, impiegendu una sinergia di sequenza di lettura longa Nanopore, sequenza NGS Illumina è tecnulugia Hi-C.
Parallelamente, un tesoru di 147 risorse di germoplasma, chì includenu variazioni di altu rendiment, ceppi salvatichi è spezie affine, hè statu assemblatu per una resequenza completa di u genoma tutale (WGS) utilizendu a piattaforma Illumina.I dati di sequenza chì seguitanu sò stati sottumessi à una rigurosa analisi genetica di a pupulazione, chì permette a dissezione di a struttura di a pupulazione, a diversità è u disequilibriu di ligami.Questa analisi mette in luce e variazioni di domesticazione trà e pupulazioni.
Ulteriori investigazioni includenu l'analisi chì includenu Fst, π, Tajima's D, è LD, chì miranu à svelà i segnali di selezzione derivanti da un rendimentu di lattice migliuratu, cuncentrazione in particulare nantu à i cloni Wickham.
Culminendu in una Analisi di l'Associazione Genome-wide (GWAS), i marcatori ligati à i tratti di rendimentu è dopu i geni in relazione à u rendiment sò stati identificati.A validazione iniziale hà svelatu attività trascrizionali distintive in diversi mutanti per dui geni ERF, dendu una vista preliminare di u so significatu funzionale.Una ulteriore corroborazione hè prevista in a ricerca futura.
BMKGENE hè fieru di cuntribuisce à a resequenza larga di u genoma sanu di sta populazione considerableu, inseme à un rolu impurtante in l'analisi bioinformatica.A nostra vasta sperienza include a sequenza NGS / TGS è l'analisi bioinformatica multiomica in una serie di più di 1000 spezie.Aspittemu a pruspettiva di partenarii cun voi in i vostri prughjetti futuri.
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Tempu di post: Aug-29-2023