●Piattaforme:Illumina NovaSeq 6000, NovaSeq, HiSeq X Ten è BGI-DNB-T7
●Modi di sequenza:PE50, PE100, PE150, PE250
●Cuntrolla di qualità di biblioteche prima di sequencing
●Consegna di dati di sequenza è QC:consegna di rapportu QC è dati crudi in formatu fastq dopu à demultiplexing è filtru Q30 leghje.
●Versatilità di servizii di sequenza:u cliente pò sceglie di sequenza per via, cellula di flussu o quantità di dati.
●Versatilità di e piattaforme:E biblioteche DNB ponu esse trasferite à e plataforme Illumina
●Vasta sperienza nantu à a piattaforma di sequenza Illumina:cù millaie di prughjetti chjusi cù diverse spezie.
●Consegna di u rapportu QC di sequenza:cù metrica di qualità, precisione di dati è prestazioni generale di u prughjettu di sequenza.
●Prucessu di sequencing maturu:cù un cortu tempu di turn-around.
●Rigurosu cuntrollu di qualità: implementemu requisiti stretti di QC per guarantisce a consegna di risultati sempre di alta qualità.
A quantità di dati (X) | Concentrazione (qPCR/nM) | Volume |
X ≤ 50 Gb | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
50 Gb ≤ X < 100 Gb | ≥ 3 nM | ≥ 20 μl |
X ≥ 100 Gb | ≥ 4 nM | ≥ 20 μl |
Piattaforma | Concentrazione (qPCR/nM) | Volume |
HiSeq X Ten | ≥ 2 nM | ≥ 20 μl |
NovaSeq 6000 SP | ≥ 1 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq 6000 S4 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
NovaSeq X | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
BGI-DNBSEQ-T7 | ≥ 1,5 nM | ≥ 25 μl |
In più di a cuncentrazione è a quantità totale, un mudellu di piccu adattatu hè ancu necessariu.
Un rapportu nantu à a qualità di a biblioteca hè furnitu prima di a sequenza, a valutazione di a quantità di a biblioteca è a frammentazione.
Table 1. Statistiche nantu à i dati di sequenza.
ID di mostra | BMKID | Letture crude | Dati crudi (bp) | Letture pulite (%) | Q20 (%) | Q30 (%) | GC (%) |
C_01 | BMK_01 | 22.870.120 | 6.861.036.000 | 96.48 | 99.14 | 94,85 | 36.67 |
C_02 | BMK_02 | 14.717.867 | 4.415.360.100 | 96.00 | 98,95 | 93,89 | 37.08 |
Figura 1. Distribuzione di qualità à longu leghje in ogni mostra
Figura 2. Distribuzione di cuntenutu di basa
Figura 3. Distribuzione di u cuntenutu di leghje in sequecing data