BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)

Ang high-throughput genotyping, ilabina sa dako nga populasyon, usa ka sukaranan nga lakang sa genetic association studies, nga naghatag og genetic nga basehan alang sa functional gene discovery, evolutionary analysis, ug uban pa. ) gipaila aron mapamenos ang sequencing cost kada sample, samtang mamentinar ang makatarunganong efficiency sa genetic marker discovery.Kini kasagarang makab-ot pinaagi sa pag-extract sa restriction fragment sulod sa gihatag nga gidak-on nga gidak-on, nga ginganlan og reduced representation library (RRL).Ang specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) kay usa ka self-developed nga estratehiya para sa SNP genotyping nga adunay o walay reference genome.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform


Mga Detalye sa Serbisyo

Mga Resulta sa Demo

Gipili nga mga Publikasyon

Mga Detalye sa Serbisyo

Teknikal nga Scheme

111

Daloy sa trabaho

流程图

Mga Bentaha sa Serbisyo

Taas nga kahusayan sa pagdiskobre sa marker- Ang high-throughput sequencing nga teknolohiya nagtabang sa SLAF-Seq sa pagdiskobre sa gatusan ka libo nga mga tag sulod sa tibuok genome.

Ubos nga pagsalig sa genome- Mahimo kining magamit sa mga espisye nga adunay o wala’y reference genome.

Flexible nga laraw sa laraw- Single-enzyme, dual-enzyme, multi-enzyme digestion ug lain-laing mga matang sa enzymes, ang tanan mahimong mapili aron sa paghatag sa lain-laing mga research tumong o espisye.Ang pre-evaluation sa silico gigamit aron masiguro ang labing maayo nga disenyo sa enzyme.

Epektibo nga enzymatic digestion- Ang pre-eksperimento gihimo aron ma-optimize ang mga kondisyon, nga naghimo sa pormal nga eksperimento nga lig-on ug kasaligan.Ang kahusayan sa pagkolekta sa tipik mahimong makab-ot sa 95%.

Parehas nga giapod-apod nga mga tag sa SLAF- Ang mga tag sa SLAF parehas nga giapod-apod sa tanan nga mga chromosome hangtod sa labing kadako, nga nakab-ot ang aberids nga 1 SLAF matag 4 kb.

Epektibo nga paglikay sa mga pag-usab- Ang nagbalikbalik nga pagkasunod-sunod sa datos sa SLAF-Seq gikunhoran ngadto sa ubos sa 5%, ilabina sa mga espisye nga adunay taas nga lebel sa pagsubli, sama sa trigo, mais, ug uban pa.

Lapad nga kasinatian-Kapin sa 2000 nga gisirado nga mga proyekto sa SLAF-Seq sa gatusan nga mga espisye nga naglangkob sa mga tanum, mammal, langgam, insekto, aqua-organismo, ug uban pa.

Gipalambo sa kaugalingon nga bioinformatic workflow- Usa ka hiniusa nga bioinformatic workflow alang sa SLAF-Seq gimugna sa BMKGENE aron masiguro ang pagkakasaligan ug katukma sa katapusan nga output.

 

Mga Detalye sa Serbisyo

 

Plataporma

Conc.(ng/gl)

Total (ug)

OD260/280

Illumina NovaSeq

>35

>1.6(Tomo>15μl)

1.6-2.5

Mubo nga sulat: Tulo ka sample, matag usa adunay tulo ka enzyme scheme, ang himoon para sa pre-experiment.

Girekomendar nga Estratehiya sa Pagsunod-sunod

Pagsunod-sunod nga giladmon: 10X/Tag

Gidak-on sa Genome

Girekomenda nga SLAF Tags

<500 Mb

100K o WGS

500 Mb- 1 Gb

100 K

1 Gb -2 Gb

200 K

Higante o komplikado nga mga genome

300 - 400K

 

Mga aplikasyon

 

Girekomenda

Population Scale

 

Estratehiya sa pagkasunodsunod ug giladmon

 

Kalalim

 

Numero sa Tag

 

GWAS

 

Sample nga numero ≥ 200

 

10X

 

 

 

 

 

Sumala sa

gidak-on sa genome

 

Genetic nga Ebolusyon

 

Indibidwal sa matag usa

subgroup ≥ 10;

kinatibuk-ang sample ≥ 30

 

10X

 

Girekomenda nga Sample Delivery

Kontainer: 2 ml centrifuge tube

Alang sa kadaghanan sa mga sample, among girekomenda nga dili tipigan sa ethanol.

Sample nga pag-label: Ang mga sample kinahanglan nga klaro nga gimarkahan ug parehas sa gisumite nga porma sa impormasyon sa sample.

Pagpadala: Dry-ice: Ang mga sample kinahanglan nga ibutang una sa mga bag ug ilubong sa dry-ice.

Pag-alagad sa Trabaho

Sample nga QC
Eksperimento sa piloto
Eksperimento sa SLAF
Pagpangandam sa Library
Pagsunodsunod
Pagtuki sa datos
Human sa pagbaligya Serbisyo

Sample nga QC

Eksperimento sa piloto

SLAF-eksperimento

Pagpangandam sa Library

Pagsunodsunod

Pagtuki sa Datos

After-sale nga Serbisyo


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • 1. Estadistika sa resulta sa mapa

    hulagway1

    A1

    2. Pag-uswag sa marka sa SLAF

    A2

    3. Pagkalainlain nga anotasyon

    A3

    Tuig

    Journal

    IF

    Titulo

    Mga aplikasyon

    2022

    Mga komunikasyon sa kinaiyahan

    17.694

    Genomic nga basehan sa giga-chromosome ug giga-genome sa tree peony

    Paeonia ostii

    SLAF-GWAS

    2015

    Bag-ong Phytologist

    7.433

    Domestication footprints anchor genomic rehiyon sa agronomic importansya sa

    soybeans

    SLAF-GWAS

    2022

    Journal of Advanced Research

    12.822

    Genome-wide artificial introgressions sa Gossypium barbadense ngadto sa G. hirsutum

    ipadayag ang labaw nga loci alang sa dungan nga pagpauswag sa kalidad ug abot sa cotton fiber

    mga kinaiya

    SLAF-Ebolusyonaryong genetics

    2019

    Molekular nga Tanum

    10.81

    Populasyon Genomic Analysis ug De Novo Assembly Nagpadayag sa Sinugdanan sa Weedy

    Rice isip Ebolusyonaryong Dula

    SLAF-Ebolusyonaryong genetics

    2019

    Mga Genetika sa Kinaiyahan

    31.616

    Genome sequence ug genetic diversity sa komon nga carp, Cyprinus carpio

    SLAF-Linkage nga mapa

    2014

    Mga Genetika sa Kinaiyahan

    25.455

    Ang genome sa kultibado nga mani naghatag og panabut sa legume karyotypes, polyploid

    ebolusyon ug crop domestication.

    SLAF-Linkage nga mapa

    2022

    Plant Biotechnology Journal

    9.803

    Ang pag-ila sa ST1 nagpadayag sa usa ka pagpili nga naglambigit sa hitchhiking sa seed morphology

    ug lana sulod sa panahon sa soybean domestication

    Pag-uswag sa SLAF-Marker

    2022

    Internasyonal nga Journal sa Molecular Sciences

    6.208

    Identification ug DNA Marker Development alang sa Wheat-Leymus mollis 2Ns (2D)

    Disomic Chromosome Substitution

    Pag-uswag sa SLAF-Marker

    pagkuha sa usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe kanamo: