Ang pagkahimulag sa nuclei nakab-ot sa 10 × Genomics ChromiumTM, nga naglangkob sa walo ka channel nga microfluidics system nga adunay double crossings.Niini nga sistema, ang usa ka gel beads nga adunay mga barcode ug primer, mga enzyme ug usa ka nucleus giputos sa nanoliter-sized nga oil drop, nga nagmugna og Gel Bead-in-Emulsion (GEM).Kung maporma ang GEM, ang cell lysis ug pagpagawas sa mga barcode gihimo sa matag GEM.Ang mRNA gibalikbalik nga gi-transcribe ngadto sa mga molekula sa cDNA nga adunay 10 × barcode ug UMI, nga dugang nga gipailalom sa standard sequencing library construction.
Cell / Tissue | Rason |
Dili bag-o nga frozen nga tisyu | Dili makakuha mga bag-o o dugay nang natipig nga mga organisasyon |
Muscle cell, Megakaryocyte, Fat… | Ang diametro sa cell dako kaayo aron makasulod sa instrumento |
Atay… | Huyang kaayo nga mabuak, dili makaila sa usa ka selula |
Neuron cell, Utok… | Ang labi ka sensitibo, dali nga ma-stress, magbag-o sa mga resulta sa pagsunud |
Pancreas, thyroid… | Daghan sa endogenous enzymes, nga makaapekto sa produksyon sa usa ka cell suspension |
Single-nucleus | Usa ka selula |
Walay kinutuban nga diametro sa cell | Cell diametro: 10-40 μm |
Ang materyal mahimong frozen nga tisyu | Ang materyal kinahanglan nga presko nga tisyu |
Ubos nga stress sa mga frozen nga mga selula | Ang pagtambal sa enzyme mahimong hinungdan sa reaksyon sa stress sa cell |
Dili kinahanglan nga tangtangon ang pula nga mga selyula sa dugo | Ang pula nga mga selula sa dugo kinahanglan nga tangtangon |
Ang nukleyar nagpahayag sa bioinformation | Ang tibuok selula nagpahayag sa bioinformation |
Library | Estratehiya sa pagkasunodsunod | Damo sa Data | Sample nga Kinahanglanon | Tissue |
10× Genomics single-nuclei library | 10x Genomics -Illumina PE150 | 100,000 ka pagbasa/selula gibanabana.100-200 Gb | Numero sa cell: >2× 105 Cell conc.sa 700-1,200 cell/μL | ≥ 200 mg |
Alang sa dugang nga mga detalye sa giya sa pag-andam sa sample ug dagan sa serbisyo, palihug ayaw pagduhaduha sa pagpakigsulti sa aEksperto sa BMKGENE
1.Spot clustering
2. Marker nga ekspresyon kadagaya clustering heatmap
3.Maker gene distribution sa lain-laing clusters
4.Cell trajectory analysis/pseudotime