-
Metatranscriptome Sequencing
Ang metatranscriptome sequencing nagpaila sa gene expression sa microbes (parehong eukaryotes ug prokaryotes) sulod sa natural nga palibot (ie yuta, tubig, dagat, feces, ug gut.) Sa partikular, kini nga mga serbisyo nagtugot kanimo sa pagkuha sa tibuok gene expression profiling sa komplikado nga microbial nga mga komunidad, taxonomic analysis sa mga espisye, functional enrichment analysis sa lahi nga gipahayag nga mga gene, ug uban pa.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
Fungal Genome
Ang Biomarker Technologies naghatag og genome survey, maayong genome ug pene-complete genome sa fungal depende sa piho nga tumong sa panukiduki.Ang genome sequencing, assembly ug functional annotation mahimong makab-ot pinaagi sa paghiusa sa Next-generation sequencing + Third generation sequencing aron makab-ot ang high-level genome assembly.Ang teknolohiya sa Hi-C mahimo usab nga magamit aron mapadali ang pag-assemble sa genome sa lebel sa chromosome.
Plataporma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Plataporma sa Illumina NovaSeq
-
Mga Toolkit
Ang BMKCloud usa ka nag-unang bioinformatic nga plataporma nga naghatag og one-stop nga solusyon alang sa genomic nga mga programa, nga kaylap nga gisaligan sa mga tigdukiduki sa nagkalain-laing arena lakip na ang medikal, agrikultura, kinaiyahan, ug uban pa. , computing resources, public database, bioinformtic online nga mga kurso, ug uban pa. Ang BMKCloud adunay lain-laing kanunay nga gigamit nga bioinformatic nga mga himan nga naglakip sa gene annotation, evolutionary genetic tools, ncRNA, data quality control, assembly, alignment, data extraction, mutations, statistics, figure generator, sequence pagtuki, ug uban pa.
-
Bakterya Kompleto nga Genome
Ang Biomarker Technologies naghatag serbisyo sa pagsunud sa paghimo sa kompleto nga genome sa bakterya nga adunay zero gap.Ang panguna nga dagan sa trabaho sa bakterya nga kompleto nga pagtukod sa genome naglakip sa ikatulo nga henerasyon nga pagsunud, asembliya, functional annotation ug advanced bioinformatic analysis nga nagtuman sa piho nga mga katuyoan sa panukiduki.Ang usa ka mas komprehensibo nga profiling sa genome sa bakterya naghatag gahum sa pagpadayag sa sukaranang mga mekanismo nga nagpahipi sa ilang mga biolohikal nga proseso, nga mahimo usab nga maghatag hinungdanon nga pakisayran alang sa genomic nga panukiduki sa mas taas nga eukaryotic species
Plataporma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
-
gamay nga RNA
Ang gagmay nga RNA kay tipo sa mugbo nga non-coding RNA nga adunay average nga gitas-on nga 18-30 nt, lakip ang miRNA, siRNA ug piRNA.Kining gagmay nga mga RNA kay dako nga gitaho nga nalambigit sa nagkalain-laing biological nga proseso sama sa mRNA degradation, translation inhibition, heterochromatin formation, ug uban pa. SmallRNA sequencing analysis kaylap nga gigamit sa mga pagtuon sa animal/plant development, disease, virus, etc. Ang sequencing analysis platform naglangkob sa standard analysis ug advanced data mining.Sa base sa datos sa RNA-seq, ang standard nga pag-analisa mahimong makab-ot ang pag-ila ug panagna sa miRNA, pagtagna sa target sa miRNA sa gene, annotation ug pagtuki sa ekspresyon.Ang advanced nga pag-analisa makapahimo sa gipahiangay nga pagpangita ug pagkuha sa miRNA, paghimo sa diagram sa Venn, miRNA ug pagtukod sa target nga gene network.
-
NGS-WGS (Illumina/BGI)
Ang NGS-WGS usa ka tibuok genome re-sequencing analysis platform, nga gimugna base sa adunahang kasinatian sa Biomarker Technologies.Kining sayon gamiton nga plataporma nagtugot sa dali nga pagsumite sa usa ka integrated analysis workflow pinaagi lamang sa pagtakda sa pipila ka batakang parameter, nga mohaum sa DNA sequencing data nga namugna gikan sa Illumina platform ug BGI sequencing platform.Kini nga plataporma gipakatap sa high performance computing server, nga naghatag ug gahom sa episyente kaayo nga pagtuki sa datos sa limitado kaayong panahon.Ang personalized data mining anaa sa base sa standard analysis, lakip ang mutated gene query, PCR primer design, etc.
-
mRNA(Reperensya)
Ang Transcriptome mao ang sumpay tali sa genomic genetic nga impormasyon ug ang proteome sa biological function.Ang regulasyon sa lebel sa transkripsyon mao ang labing hinungdanon ug labing kaylap nga gitun-an nga mode sa regulasyon sa mga organismo.Ang transcriptome sequencing mahimong magsunodsunod sa transcriptome sa bisan unsang punto sa panahon o ubos sa bisan unsa nga kondisyon, nga adunay usa ka resolusyon nga tukma sa usa ka nucleotide. Kini mahimong dinamikong magpakita sa lebel sa transkripsyon sa gene, dungan nga makaila ug makaihap sa talagsaon ug normal nga mga transcript, ug maghatag sa istruktura nga impormasyon sa sample nga piho nga mga transcript.
Sa pagkakaron, ang teknolohiya sa transcriptome sequencing kay kaylap nga gigamit sa agronomy, medisina ug uban pang natad sa panukiduki, lakip na ang regulasyon sa pagpalambo sa hayop ug tanum, pagpahiangay sa kalikopan, interaksyon sa imyunidad, lokalisasyon sa gene, ebolusyon sa genetic sa espisye ug pagtuki sa tumor ug genetic nga sakit.
-
Metagenomics (NGS)
Kini nga plataporma sa pagtuki gidisenyo alang sa shotgun metagenomic data analysis base sa mga tuig nga kasinatian.Naglangkob kini sa integrated workflow nga adunay lain-laing mga kasagarang gikinahanglan nga metagenomics analysis lakip na ang pagproseso sa datos, mga pagtuon sa lebel sa espisye, mga pagtuon sa lebel sa function sa gene, metagenome binning, ug uban pa. , setting sa parameter, personalized figure generating, etc.
-
LncRNA
Ang mga long non-coding RNAs (lncRNA) maoy usa ka matang sa mga transcript nga adunay gitas-on nga mas taas kay sa 200 nt, nga dili maka-code sa mga protina.Ang natipon nga ebidensya nagsugyot nga kadaghanan sa mga lncRNA lagmit nga magamit.Ang high-throughput sequencing technologies ug bioinformatic analyzing tools naghatag ug gahom kanamo sa pagpadayag sa lncRNA sequence ug positioning information nga mas episyente ug mogiya kanamo sa pagdiskubre sa mga lncRNA nga adunay mahinungdanong regulatory functions.Mapasigarbuhon ang BMKCloud sa paghatag sa among mga kustomer nga lncRNA sequencing analysis platform aron makab-ot ang paspas, kasaligan ug flexible nga pagsusi sa lncRNA.
-
GWAS
Ang Genome-wide association study (GWAS) nagtumong sa pag-ila sa mga variant sa genetic (genotype) nga may kalabutan sa piho nga mga kinaiya (phenotype).Gisusi sa mga pagtuon sa GWA ang mga genetic marker nga nagtabok sa tibuuk nga genome sa daghang mga indibidwal ug nagtagna sa mga asosasyon sa genotype-phenotype pinaagi sa pagtuki sa istatistika sa lebel sa populasyon.Ang whole-genome resequencing posibling makadiskubre sa tanang genetic variants.Uban sa phenotypic data, ang GWAS mahimong maproseso aron mahibal-an ang mga SNP nga may kalabutan sa phenotype, QTL ug mga kandidato nga gene, nga kusganong nagpaluyo sa modernong pagpasanay sa hayop/tanom.Ang SLAF kay usa ka self-developed nga gipasimple nga genome sequencing nga estratehiya, nga nakadiskubre sa genome-wide distributed markers, SNP.Kini nga mga SNP, ingon nga molekula nga genetic marker, mahimong maproseso alang sa mga pagtuon sa asosasyon nga adunay gipunting nga mga kinaiya.Kini usa ka cost-effective nga estratehiya sa pag-ila sa mga komplikadong kinaiya nga may kalabutan sa genetic variation.
-
Nanopore Full-length transcriptomics
Ang komplikado ug lainlain nga alternatibong mga isoform sa mga organismo hinungdanon nga mekanismo sa genetic para sa pag-regulate sa ekspresyon sa gene ug pagkalainlain sa protina.Ang tukma nga pag-ila sa mga istruktura sa transcript mao ang sukaranan alang sa lawom nga pagtuon sa mga pattern sa regulasyon sa ekspresyon sa gene.Ang plataporma sa pagsunud sa Nanopore malampuson nga nagdala sa transcriptomic nga pagtuon sa lebel sa isoform.Kini nga plataporma sa pag-analisa kay gilaraw aron analisahon ang datos sa RNA-Seq nga namugna sa Nanopore nga plataporma base sa reference genome, nga nakab-ot ang qualitative ug quantitative nga pagtuki sa gene level ug transcripts level.
-
circ-RNA
Ang Circular RNA(circular) maoy usa ka matang sa non-coding RNA, nga bag-o lang nakit-an nga adunay importante nga papel sa regulatory networks nga nalangkit sa pagpalambo, environmental resistance, ug uban pa. Lahi sa linear RNA molecules, eg mRNA, lncRNA, 3′ ug 5′ Ang mga tumoy sa circRNA gidugtong aron mahimong usa ka lingin nga istruktura, nga makaluwas kanila gikan sa paghilis sa exonuclease ug mas lig-on kay sa kadaghanan sa linear RNA.Ang CircRNA nakit-an nga adunay lainlaing mga gimbuhaton sa pag-regulate sa ekspresyon sa gene.Ang CircRNA mahimo’g mahimo ingon ceRNA, nga nagbugkos sa miRNA nga kompetisyon, nailhan nga miRNA sponge.Ang plataporma sa pag-analisa sa pagsunud sa CircRNA naghatag gahum sa istruktura sa circRNA ug pagtuki sa ekspresyon, pagtagna sa target ug hiniusang pagtuki sa ubang mga lahi sa molekula sa RNA
