-
Metagenomic Sequencing -NGS
Ang metagenome nagtumong sa usa ka koleksyon sa kinatibuk-ang genetic nga materyal sa usa ka nagkasagol nga komunidad sa mga organismo, sama sa environmental metagenome, human metagenome, ug uban pa. Naglangkob kini og mga genome sa duha nga maugmad ug dili maugmad nga mga mikroorganismo.Ang metagenomic sequencing kay usa ka molecular tool nga gigamit sa pag-analisa sa mga mixed genomic nga materyales nga gikuha gikan sa environmental samples, nga naghatag ug detalyadong impormasyon sa diversity ug kadagaya sa species, population structure, phylogenetic relationship, functional genes ug correlation network uban sa environmental factors.
Plataporma:Plataporma sa Illumina NovaSeq
-
Metagenomic Sequencing-Nanopore
Ang metagenomics usa ka molekular nga himan nga gigamit sa pag-analisar sa nagkasagol nga genomic nga mga materyales nga gikuha gikan sa mga sample sa kalikopan, nga naghatag og detalyado nga impormasyon sa pagkalain-lain ug kadagaya sa mga espisye, istruktura sa populasyon, phylogenetic nga relasyon, functional genes ug correlation network uban sa environmental nga mga hinungdan, ug uban pa. Nanopore sequencing platforms bag-o lang gipaila sa metagenomic nga mga pagtuon.Ang talagsaon nga pasundayag niini sa gitas-on sa pagbasa sa kadaghanan nagpauswag sa pag-analisar sa metagenomic sa suba, labi na ang metagenome assembly.Ang pagpahimulos sa read-length, Nanopore-based metagenomic nga pagtuon makahimo sa pagkab-ot sa mas padayon nga asembliya itandi sa shot-gun metagenomics.Gimantala nga ang Nanopore-based metagenomics malampuson nga nakamugna og kompleto ug sirado nga mga genome sa bakterya gikan sa microbiomes (Moss, EL, et. al,Kinaiyahan Biotech, 2020)
Plataporma:Nanopore PromethION P48
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-PacBio
Ang subunit sa 16S ug 18S rRNA nga adunay duha nga labi nga gikonserba ug hyper-variable nga mga rehiyon usa ka hingpit nga molekular nga fingerprint alang sa pag-ila sa prokaryotic ug eukaryotic nga mga organismo.Gipahimuslan ang pagkasunodsunod, kini nga mga amplicon mahimong ma-target base sa gitipigan nga mga bahin ug ang hyper-variable nga mga rehiyon mahimong hingpit nga gihulagway alang sa microbial identification nga nakatampo sa mga pagtuon nga naglangkob sa microbial diversity analysis, taxonomy, phylogeny, ug uban pa. Single-molecule real-time (SMRT) ) ang pagkasunodsunod sa PacBio nga plataporma makapahimo sa pagkuha sa tukma kaayo nga taas nga mga pagbasa, nga makatabon sa tibuok nga gitas-on nga mga amplicon (gibana-bana nga 1.5 Kb).Ang pagpalapad nga pagtan-aw sa genetic field nakapauswag pag-ayo sa resolusyon sa anotasyon sa mga espisye sa komunidad sa bakterya o fungi.
Plataporma:PacBio Sequel II
-
16S/18S/ITS Amplicon Sequencing-NGS
Ang 16S/18S/ITS amplicon sequencing nagtumong sa pagpadayag sa phylogeny, taxonomy, ug species nga kadagaya sa microbial community pinaagi sa pag-imbestigar sa PCR nga mga produkto sa housekeeping nga genetic marker nga adunay duha ka kaayo nga gikaistorya ug hypervariable nga mga bahin.Ang pagpaila niining mga hingpit nga molekular nga fingerprint ni Woeses et al, (1977) naghatag gahum sa pag-inusara nga wala’y pagbulag sa microbiome profiling.Ang pagkasunodsunod sa 16S (bakterya), 18S (fungi) ug Internal transcribed spacer(ITS, fungi) nagtugot sa pag-ila sa abunda nga mga espisye ingon man sa talagsaon ug wala mailhi nga mga espisye.Kini nga teknolohiya nahimong kaylap nga gigamit ug mayor nga himan sa pag-ila sa differential microbial nga komposisyon sa lain-laing mga palibot, sama sa baba sa tawo, tinai, feces, ug uban pa.
Plataporma:Plataporma sa Illumina NovaSeq
-
Bacterial ug Fungal Whole Genome Re-Sequencing
Ang bacterial ug fungal whole genome re-sequencing usa ka kritikal nga himan aron makompleto ang genome sa nailhan nga bakterya ug fungi, ingon man sa pagtandi sa daghang genome o sa pagmapa sa mga genome sa bag-ong mga organismo.Importante kaayo ang pagsunud-sunod sa tibuok genome sa bakterya ug fungi aron makamugna og tukma nga reference genome, sa paghimo sa microbial identification ug uban pang comparative genome studies.
Plataporma: Plataporma sa Illumina NovaSeq
-
Metatranscriptome Sequencing
Ang metatranscriptome sequencing nagpaila sa gene expression sa microbes (parehong eukaryotes ug prokaryotes) sulod sa natural nga palibot (ie yuta, tubig, dagat, feces, ug gut.) Sa partikular, kini nga mga serbisyo nagtugot kanimo sa pagkuha sa tibuok gene expression profiling sa komplikado nga microbial nga mga komunidad, taxonomic analysis sa mga espisye, functional enrichment analysis sa lahi nga gipahayag nga mga gene, ug uban pa.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
Fungal Genome
Ang Biomarker Technologies naghatag og genome survey, maayong genome ug pene-complete genome sa fungal depende sa piho nga tumong sa panukiduki.Ang genome sequencing, assembly ug functional annotation mahimong makab-ot pinaagi sa paghiusa sa Next-generation sequencing + Third generation sequencing aron makab-ot ang high-level genome assembly.Ang teknolohiya sa Hi-C mahimo usab nga magamit aron mapadali ang pag-assemble sa genome sa lebel sa chromosome.
Plataporma:PacBio Sequel II
Nanopore PromethION P48
Plataporma sa Illumina NovaSeq
-
Bakterya Kompleto nga Genome
Ang Biomarker Technologies naghatag serbisyo sa pagsunud sa paghimo sa kompleto nga genome sa bakterya nga adunay zero gap.Ang panguna nga dagan sa trabaho sa bakterya nga kompleto nga pagtukod sa genome naglakip sa ikatulo nga henerasyon nga pagsunud, asembliya, functional annotation ug advanced bioinformatic analysis nga nagtuman sa piho nga mga katuyoan sa panukiduki.Ang usa ka mas komprehensibo nga profiling sa genome sa bakterya naghatag gahum sa pagpadayag sa sukaranang mga mekanismo nga nagpahipi sa ilang mga biolohikal nga proseso, nga mahimo usab nga maghatag hinungdanon nga pakisayran alang sa genomic nga panukiduki sa mas taas nga eukaryotic species
Plataporma:Nanopore PromethION P48 + Illumina NovaSeq Platform
PacBio Sequel II
