-
Pagtuki sa Genome-wide Association
Ang Genome-wide association study (GWAS) nagtumong sa pag-ila sa mga variant sa genetic (genotype) nga may kalabutan sa piho nga mga kinaiya (phenotype).Gisusi sa pagtuon sa GWAS ang mga genetic marker nga nagtabok sa tibuuk nga genome sa daghang mga indibidwal ug nagtagna sa mga asosasyon sa genotype-phenotype pinaagi sa pagtuki sa istatistika sa lebel sa populasyon.Kini kaylap nga gigamit sa panukiduki bahin sa mga sakit sa tawo ug functional nga pagmina sa gene sa mga komplikadong kinaiya sa mga mananap o tanom.
-
Tanum/Animal Tibuok Genome Sequencing
Ang tibuok genome re-sequencing, nailhan usab nga WGS, makahimo sa pagpadayag sa komon ug talagsaon nga mutasyon sa tibuok genome lakip na ang Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure variation (SV), ug Copy Number Variation (CNV). ).Ang mga SV naglangkob sa mas dako nga bahin sa variation base kay sa mga SNP ug adunay mas dako nga epekto sa genome, nga adunay dakong epekto sa buhi nga mga organismo.Ang dugay nga pagbasa nga resequencing nagtugot alang sa mas tukma nga pag-ila sa dagkong mga tipik ug komplikado nga mga kalainan tungod kay ang taas nga pagbasa naghimo nga mas sayon sa pagtabok sa chromosomal sa mga komplikadong rehiyon sama sa tandem repeats, GC/AT-rich nga mga rehiyon, ug hyper-variable nga mga rehiyon.
Plataporma: Illumina, PacBio, Nanopore
-
Ebolusyonaryong Genetika
Ang ebolusyonaryong genetics kay usa ka packed sequencing service nga gidisenyo para sa paghatag ug komprehensibong interpretasyon sa ebolusyonaryong impormasyon sa gihatag nga mga materyales base sa genetic variation, lakip na ang mga SNP, InDels, SVs ug CNVs.Naghatag kini sa tanan nga sukaranan nga pagtuki nga gikinahanglan alang sa paghulagway sa mga pagbag-o sa ebolusyon ug mga genetic nga bahin sa mga populasyon, sama sa istruktura sa populasyon, pagkalainlain sa genetic, relasyon sa phylogeny, ug uban pa. Naglangkob usab kini mga pagtuon sa dagan sa gene, nga naghatag gahum sa pagbanabana sa epektibo nga gidak-on sa populasyon, oras sa pagkalainlain.
-
Comparative Genomics
Ang pagtandi nga genomics literal nga nagpasabut sa pagtandi sa kompleto nga mga han-ay sa genome ug istruktura sa lainlaing mga espisye.Ang kini nga disiplina nagtumong sa pagpadayag sa ebolusyon sa mga espisye, function sa gene, mekanismo sa regulasyon sa gene sa lebel sa genome pinaagi sa pag-ila sa pagkasunod-sunod nga mga istruktura ug mga elemento nga nagtipig o naglainlain sa lainlaing mga espisye.Ang kasagarang pagtandi sa genomics nga pagtuon naglakip sa mga pagtuki sa gene family, ebolusyonaryong kalamboan, tibuok genome duplication, selective pressure, ug uban pa.
-
Hi-C base sa Genome Assembly
Ang Hi-C usa ka pamaagi nga gidisenyo aron makuha ang chromosome configuration pinaagi sa paghiusa sa probing proximity-based nga interaksyon ug high-throughput sequencing.Ang intensity niini nga mga interaksyon gituohan nga negatibo nga may kalabutan sa pisikal nga gilay-on sa mga chromosome.Busa, ang datos sa Hi-C mahimong mogiya sa clustering, pag-order ug pag-orient sa mga assembled sequences sa usa ka draft genome ug pag-angkla niadtong sa usa ka piho nga gidaghanon sa mga chromosome.Kini nga teknolohiya naghatag gahum sa usa ka chromosome-level genome assembly kung wala ang genetic nga mapa nga nakabase sa populasyon.Ang matag genome nanginahanglan usa ka Hi-C.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform / DNBSEQ
-
Pagsunodsunod sa Genome sa Tanum/Animal De Novo
De NovoAng sequencing nagtumong sa pagtukod sa tibuok genome sa usa ka espisye gamit ang mga teknolohiya sa sequencing, eg PacBio, Nanopore, NGS, ug uban pa, kung walay reference genome.Ang talagsaong pag-uswag sa gidugayon sa pagbasa sa mga teknolohiya sa pagsunud-sunod sa ikatulo nga henerasyon nagdala og bag-ong mga oportunidad sa pag-assemble sa mga komplikadong genome, sama niadtong adunay taas nga heterozygosity, taas nga ratio sa nagbalik-balik nga mga rehiyon, polyploid, ug uban pa. pagsulbad sa nagbalikbalik nga mga elemento, mga rehiyon nga adunay dili normal nga mga sulud sa GC ug uban pang labi ka komplikado nga mga rehiyon.
Platform: PacBio Sequel II / Nanopore PromethION P48 / Illumina NovaSeq Platform
-
Tawo nga Tibuok Exome Sequencing
Ang tibuok exome sequencing (WES) giisip nga usa ka cost-effective nga sequencing nga estratehiya alang sa pag-ila sa mga mutation nga hinungdan sa sakit.Bisan kung ang mga exon nagkuha lamang sa gibana-bana nga 1.7% sa tibuuk nga genome, direkta kini nga nagrepresentar sa profile sa kinatibuk-ang function sa protina.Sa genome sa tawo, gikataho nga labaw pa sa 85% sa mga mutation nga may kalabutan sa sakit mahitabo sa rehiyon sa protina coding.
Nagtanyag ang BMKGENE og komprehensibo ug flexible nga mga serbisyo sa pagsunud sa tibuuk nga exome sa tawo nga adunay lainlaing mga estratehiya sa pagkuha sa exon nga magamit aron makab-ot ang lainlaing mga katuyoan sa panukiduki.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
-
Specific-Locus Amplified Fragment Sequencing (SLAF-Seq)
Ang high-throughput genotyping, ilabina sa dako nga populasyon, usa ka sukaranan nga lakang sa genetic association studies, nga naghatag og genetic nga basehan alang sa functional gene discovery, evolutionary analysis, ug uban pa. ) gipaila aron mapamenos ang sequencing cost kada sample, samtang mamentinar ang makatarunganong efficiency sa genetic marker discovery.Kini kasagarang makab-ot pinaagi sa pag-extract sa restriction fragment sulod sa gihatag nga gidak-on nga gidak-on, nga ginganlan og reduced representation library (RRL).Ang specific-locus amplified fragment sequencing (SLAF-Seq) kay usa ka self-developed nga estratehiya para sa SNP genotyping nga adunay o walay reference genome.
Plataporma: Illumina NovaSeq Platform
