Mga produkto

Tanum/Animal Tibuok Genome Sequencing

Tanum/Animal Whole Genome Sequencing Featured Image

Ang tibuok genome re-sequencing, nailhan usab nga WGS, makahimo sa pagpadayag sa komon ug talagsaon nga mutasyon sa tibuok genome lakip na ang Single Nucleotide Polymorphism (SNP), Insertion Deletion (InDel), Structure variation (SV), ug Copy Number Variation (CNV). ).Ang mga SV naglangkob sa mas dako nga bahin sa variation base kay sa mga SNP ug adunay mas dako nga epekto sa genome, nga adunay dakong epekto sa buhi nga mga organismo.Ang dugay nga pagbasa nga resequencing nagtugot alang sa mas tukma nga pag-ila sa dagkong mga tipik ug komplikado nga mga kalainan tungod kay ang taas nga pagbasa naghimo nga mas sayon sa pagtabok sa chromosomal sa mga komplikadong rehiyon sama sa tandem repeats, GC/AT-rich nga mga rehiyon, ug hyper-variable nga mga rehiyon.

Plataporma: Illumina, PacBio, Nanopore

Kontaka Kami

Mga Detalye sa Serbisyo

Resulta sa Demo

Gipili nga Publikasyon

1. Mga Kaayohan sa Serbisyo

Daghang kasinatian sa genome sequencing alang sa kapin sa 1000 ka espisye.

Kapin sa 800 ka gipatik nga mga kaso nga adunay accumulative impact factor nga labaw sa 4000.

Ang komprehensibo nga pag-analisa sa bioinformatics sa pagtawag sa pagbag-o ug pag-analisar sa function.

2. Mga Detalye sa Serbisyo

Plataporma		Library	Girekomenda nga seq giladmon
Illumina		PE 150	Alang sa SNP, ang InDel nagtawag ≥ 10x Para sa SV, CNY nga pagtawag ≥ 30x
Nanopore		8 kb	Para sa SV, CNY nga pagtawag ≥ 20x
Pacbio	CCS	15 kb	Para sa SNP, InDel, SV, CNY nga pagtawag ≥ 10x

3. Sample nga Kinahanglanon

Plataporma		Conc.(ng/μL)	kantidad (ng)	Kaputli		Agarose gel
				OD260/280	OD260/230	1. Tin-aw nga main band nga walay o limitadodegradation naobserbahan sa gel. 2. Wala o limitado nga kontaminasyon sa RNA o protina
Illumina		≥1	≥30	-	-
Nanopore		≥30	Depende sa data ani 10 ug / cell	1.7-2.2	≥1.5
Pacbio	CCS	≥50		1.7-2.2	1.8-2.5

4. Pagtuki sa Bioinformation

5. Pag-agos sa Trabaho sa Serbisyo

Sample nga paghatod

Pagkuha sa DNA

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

Paghatud sa datos

Kaniadto: BMKMANU S1000 Spatial Transcriptome

Sunod: Single-nucleus RNA Sequencing

1) Estadistika sa Genome Mapping

Talaan 1 Mga estadistika sa resulta sa pagmapa

Figure 1 Distribusyon sa gidak-on sa insert ug sakup sa pagbasa.

2) Lainlain nga Detection

Figure 2 Statistics ug annotation sa SNP/INDEL/SV sa mga Sample

Figure 3 Genome-wide distribusyon sa vatiations

3) Functional nga anotasyon sa mga kalainan

2019	Mga komunikasyon sa kinaiyahan	Ang whole-genome resequencing nagpadayag sa Brassica napus nga gigikanan ug genetic loci nga nalangkit sa pag-uswag niini
2020	PNAS	Ang ebolusyonaryong gigikanan ug kasaysayan sa pagpamuhi sa goldfish (Carassius auratus)
2021	Plant Biotechnology Journal	Reference genome sa duha ka kultibado jute species
2021	Plant Biotechnology Journal	Genomic nga pirma sa utanon ug oilseed allopolyploid Brassicajuncea ug genetic loci nga nagkontrolar sa akumulasyon sa glucosinolates
2019	Molekular nga Tanum	Ang tibuok-genome nga resequencing sa tibuok kalibutan nga koleksyon sa rapeseed accessions nagpadayag sa genetic nga basehan sa ilang ecotype divergence
2022	Pagpanukiduki sa Hortikultura	Ang pag-analisa sa asosasyon sa genome-wide naghatag og mga molekular nga panabut sa natural nga pagbag-o sa gidak-on sa liso sa pakwan
2021	Journal sa Eksperimental nga Botany	Ang pagtuon sa asosasyon sa genome-wide nagpaila sa mga variant sa GhSAD1 nga naghatag sa bugnaw nga pagtugot sa gapas
2021	Journal sa Eksperimental nga Botany	Ang pagtuon sa asosasyon sa tibuuk nga genome ug pagtandi sa transcriptome nagpadayag sa nobela nga QTL ug mga gen sa kandidato nga nagkontrol sa gidak-on sa petal sa rapeseed