Mga highlight
Niining duha ka oras nga webinar, dako namong dungog ang pag-imbitar ug unom ka eksperto sa crop genomics arena.Ang among mga mamumulong maghatag usa ka lawom nga paghubad sa duha nga Rye genomic nga pagtuon, nga bag-o lang gipatik saMga Genetika sa Kinaiyahan:
1. Ang Chromosome-scale genome assembly naghatag og mga panabut sa rye biology, ebolusyon, ug agronomic nga potensyal
2. Ang usa ka taas nga kalidad nga genome assembly nagpasiugda sa rye genomic nga mga kinaiya ug agronomically importante nga mga gene
Usab, nalipay kami nga adunay Senior R&D Scientist sa Biomarker Technologies aron ipaambit ang iyang kasinatian sa de novo genome assembly.
Agenda
09:00am CET
Pag-abiabi nga mga Pahayag
Zheng Hong-kun
Founder ug CEO Biomarker Technologies
Deng Xing-wang
Presidente, School of Advanced Agricultural Sciences Peking University
09:15 sa buntag
Pagpauswag sa rye, triticale ug pag-uswag sa trigo pinaagi sa paggamit sa taas nga kalidad nga reference genome sequence
Niini nga webinar, si Prof. Wang naghatag kanamo og kinatibuk-ang mga update sa kasamtangan nga status sa triticeae genomic research ug gipakita ang kalampusan ug break-through sa duha ka talagsaong trabaho sa Rye genome studies, nga bag-o lang gipatik sa Nature Genetics ug gipaila ang tibuok research mga grupo nga nanguna ug nag-amot sa mga buhat.
09:25 sa buntag
Cereal genomics @ IPK Gatersleben
Ang mga cereal grasses sa tribong Triticeae nahimong dakong tinubdan sa pagkaon sa kasarangang mga rehiyon, nga dugay na nga giisip nga usa ka hotspot sa pagpaayo sa tanom ug pagpasanay.Taliwala sa tanan nga gitikad nga mga espisye, kini nga tribo nabantog tungod sa ilang labi ka komplikado nga genomic nga mga bahin lakip ang dagkong mga gidak-on sa genome, taas nga sulud sa TE, polyploidy, ug uban pa. Niini nga sesyon, si Prof. Nils Stein naghatag kanamo usa ka kinatibuk-ang pasiuna sa IPK Gatersleben ug karon nga kahimtang sa cereal genomic research@IPK Gatersleben.
09:35 sa buntag
Ang Chromosome-scale genome assembly naghatag og mga panabut sa rye biology, ebolusyon, ug agronomic nga potensyal
Dr. M Timothy Rabanus-Wallace, Leibniz Institute of Plant Genetics ug Crop Plan Research(IPK)Ang Rye (Secale cereale L.) kay usa ka talagsaon nga klima-mabag-o nga tanum nga cereal, kay gigamit sa pagprodyus og maayo nga mga klase sa trigo pinaagi sa introgressive hybridization, ug nagbaton sa tibuok repertoire sa mga gene nga gikinahanglan aron makahimo sa hybrid breeding.Ang rye kay allogamous ug bag-o lang nga gipamuhi, nga naghatag sa mga kultibado nga rye nga access sa lainlain ug mapahimuslan nga wild gene pool.Aron madugangan pa ang potensyal sa agronomic sa rye, naghimo kami usa ka chromosome-scale annotated nga asembliya sa 7.9 Mbp rye genome, ug kaylap nga gipamatud-an ang kalidad niini gamit ang usa ka suite sa molekular nga genetic nga kapanguhaan.Gipakita namo ang mga aplikasyon niini nga kapanguhaan uban ang halapad nga mga imbestigasyon.Gipresentar namon ang mga nahibal-an bahin sa dili kompleto nga pagkahimulag sa genetic nga rye gikan sa ihalas nga mga paryente, mga mekanismo sa ebolusyon sa istruktura sa genome, resistensya sa pathogen, pagtugot sa ubos nga temperatura, mga sistema sa pagkontrol sa pagkamabungahon alang sa hybrid nga pagpasanay, ug ang mga benepisyo sa ani sa mga introgresiyon sa rye-wheat.
10:05 sa buntag
Ang usa ka taas nga kalidad nga genome assembly nagpasiugda sa rye genomic nga mga kinaiya ug agronomically importante nga mga gene
Ang Rye kay usa ka bililhon nga pagkaon ug forage crop, usa ka importante nga genetic resource alang sa trigo ug triticale improvement, ug usa ka kinahanglanon nga materyal alang sa episyente nga comparative genomics nga mga pagtuon sa mga sagbot.Dinhi, among gisunod-sunod ang genome sa Weining rye, usa ka elite nga Chinese rye variety.Ang gitigum nga mga contigs (7.74 Gb) nagkantidad sa 98.47% sa gibanabana nga gidak-on sa genome (7.86 Gb), nga adunay 93.67% sa mga contigs (7.25 Gb) nga gi-assign sa pito ka chromosome.Ang nagbalikbalik nga mga elemento naglangkob sa 90.31% sa gitigum nga genome.Kung itandi sa nauna nga sunud-sunod nga mga genome sa Triticeae, ang Daniela, Sumaya ug Sumana retrotransposon nagpakita og kusog nga pagpalapad sa rye.Ang dugang nga pag-analisa sa Weining assembly naghatag og bag-ong kahayag sa genome-wide gene duplications ug ang epekto niini sa starch biosynthesis genes, pisikal nga mga organisasyon sa complex prolamin loci, gene expression features nga nagpahipi sa sayo nga heading trait, ug putative domestication-associated chromosomal regions ug loci sa rye.Kini nga genome sequence nagsaad sa pagpadali sa genomics ug breeding nga mga pagtuon sa rye ug may kalabutan nga mga tanum nga cereal.
10:35 sa buntag
Mga hagit, solusyon ug kaugmaon alang sa genome de novo nga asembliya
Ang genome nga adunay taas nga kalidad mao ang sukaranan sa pagtuon sa genomic.Bisan kung ang paspas nga pag-uswag sa pagkasunud-sunod ug algorithm naghatag gahum sa usa ka labi ka yano ug labi ka episyente nga genome nga asembliya, ang mga kinahanglanon sa katukma ug pagkakompleto sa asembliya nagtaas usab uban ang pagpalawom sa mga katuyoan sa panukiduki.Niini nga pakigpulong akong hisgutan ang karon nga mga sikat nga teknolohiya sa genome assembly nga adunay daghang malampuson nga mga kaso ug tan-awon ang umaabot nga kalamboan.
Oras sa pag-post: Ene-08-2022