Ang Nanopore-based Full-length Transcriptome Sequencing
Ang pagsunud sa nanopore nagpalahi sa kaugalingon gikan sa ubang mga platform sa pagsunud, tungod kay ang mga nucleotide direkta nga gibasa nga wala’y synthesis sa DNA ug nagpatunghag taas nga pagbasa sa napulo ka kilobases.Gihatagan niini ang direkta nga pagbasa sa tibuuk nga mga transkrip ug pag-atubang sa mga hagit sa mga pagtuon sa transcriptomic.
√ Ubos nga pagkasunod-sunod nga piho nga bias
√ Full-length nga pagbasa sa cDNA para sa mga pagtuon sa istruktura sa gene
√ Gamay nga datos nga gikinahanglan aron masakop ang parehas nga gidaghanon sa mga transkrip
√ Pag-ila sa daghang isoform matag gene
√ Pag-ihap sa ekspresyon sa lebel sa isoform
Kinaandan nga Bioinformatics Pipeline
Pinakabag-o nga Malampuson nga mga Kaso sa Biomarker Technologies
1. Ang pagtandi nga pag-analisa sa bug-os nga gitas-on nga mga transcriptome nagpadayag sa Gnetum luofuense stem developmental dynamics
Journal: Frontiers sa Genetics
Gipatik: Mar. 2021
Keyword: Minion |Alternatibong splicing |APA |lncRNA |Nagkalainlain nga gipahayag nga mga transkrip
Basaha ang Full-text
2. Unidirectional nga paglihok sa gagmay nga mga RNA gikan sa mga saha ngadto sa mga gamot sa interspecific heterografts
Journal: Nature Plants
Gipatik: Ene. 2021
Keyword: Nanopore |Illumina |full-length nga mobile mRNA detection
3. Ang bug-os nga transcriptome nga pagtuki sa mga gamot sa asparagus nagpadayag sa mekanismo sa molekula sa pagtugot sa asin nga gipahinabo sa arbuscular mycorrhizal fungi
Journal: Environmental ug Experimental Botany
Gipatik: Ene. 2021
Keyword: Minion |Lahi nga gipahayag nga mga transkrip |Mga hinungdan sa transkripsyon |Alternatibong pagdugtong
4. Mga Kausaban sa Physiological nga Kinaiya ug Full-Length Transcriptome sa Rose (Rosa chinensis) Roots and Dahon agig Tubag sa Drought Stress
Journal: Plant ug Cell Physiology
Gipatik: Okt. 2020
Keyword: PromethION |Lahi nga gipahayag nga mga transkrip |Functional nga panagna |Gidugtong nga mga isoform |TF ug lncRNA
5. Pagtuki ug komprehensibo nga pagtandi sa PacBio ug nanopore-based RNA sequencing sa Arabidopsis transcriptome
Journal: Pamaagi sa Tanum
Gipatik: Abr. 2020
Keyword: GridION |PromethION |PacBio Sequel |Illumina NovaSeq |Pag-align sa genome |Pag-ila sa transcript |Alternatibong splicing |SSR |LncRNA |Isoform quantification
Mga Balita ug Highlight nagtumong sa pagpaambit sa pinakabag-o nga malampuson nga mga kaso sa Biomarker Technologies, pagkuha sa nobela nga mga kalampusan sa siyensya ingon man sa mga prominenteng teknik nga gigamit sa panahon sa pagtuon.
Oras sa pag-post: Ene-08-2022