GENOME
Chromosome-scale assembly ug analysis sa biomass crop nga Miscanthus lutarioriparius genome
Nanopore sequencing |Illumina |Hi-C |RNA-sequencing |Phylogeny
Niini nga pagtuon, ang Biomarker Technologies naghatag ug teknikal nga suporta sa Nanopore sequencing, de novo genome assembly, Hi-C assisted assembly, etc.
Abstract
Miscanthus, usa ka rhizomatous perennial nga tanom, adunay dakong potensyal alang sa bioenergy production tungod sa taas nga biomass ug stress tolerance niini.Gi-report namon ang usa ka chromosome-scale nga asembliya saEspesye sa tanom nga bulak ang Miscanthus lutarioripariusgenome pinaagi sa paghiusa sa Oxford Nanopore sequencing ug Hi-C nga mga teknolohiya.Ang 2.07-Gb nga asembliya naglangkob sa 96.64% sa genome, nga adunay contig N50 nga 1.71 Mb.Ang centromere ug telomere sequence gitigom alang sa tanang 19 ka chromosome ug 10 chromosome, matag usa.Ang allotetraploid nga gigikanan sa M. lutarioriparius gikumpirma gamit ang centromeric satellite repeats.Ang tetraploid genome nga istruktura ug daghang chromosomal rearrangements kalabot sa sorghum klaro nga gipakita.Tandem duplicate nga mga gene saM. lutarioripariusmga functional enriched dili lamang sa mga termino nga may kalabutan sa stress tubag, apan cell wall biosynthesis.Ang mga pamilya sa gene nga may kalabutan sa resistensya sa sakit, cell wall biosynthesis ug metal ion nga transportasyon labi nga gipalapdan ug milambo.Ang pagpalapad sa kini nga mga pamilya mahimo’g usa ka hinungdanon nga sukaranan sa genomic alang sa pagpauswag sa mga talagsaon nga mga kinaiya saM. lutarioriparius.
Pangunang estadistika sa genome assembly
Hulagway.Overview sa M. lutarioriparius genome assembly
Mga Balita ug Highlight nagtumong sa pagpaambit sa pinakabag-o nga malampuson nga mga kaso sa Biomarker Technologies, pagkuha sa nobela nga mga kalampusan sa siyensya ingon man sa mga prominenteng teknik nga gigamit sa panahon sa pagtuon.
Oras sa pag-post: Ene-05-2022