Tan-awa ang potensyal sa pagtuon sa ihalas nga lainlaing mga espisye sa panukiduki, nga gipakita sa usa ka hinungdanon nga kaso gikan sa mga kliyente sa BMKGENE.Bag-o lang gipatik sa edisyon karong tuiga sa Plant Biotechnology Journal, ang artikulo nga giulohan og “Chromosome-level Wild Hevea brasiliensis Genome: Empowering Genomic-Assisted Breeding and Unearthing Vital Loci for Elevated Rubber Yield” nagbarog ingong bililhong reperensiya.
Ang Brazilian rubber tree (Hevea brasiliensis) nagbarog nga taas isip usa ka importante nga natural nga tinubdan sa goma.Sa tibuok miaging siglo, ang tradisyonal nga mga pamaagi sa pagpasanay nagpahinabog talagsaong unom ka pilo nga pagdagsang sa produksiyon sa goma.Bisan pa, ang nagpahiping genetic bedrock nga responsable sa potensyal nga pagpauswag sa ani sa goma nagpabilin nga misteryoso.
Ang kini nga pagtuon nagsugod sa pagtukod sa usa ka chromosome-level genome alang sa ihalas nga punoan sa goma, nga gigamit ang usa ka synergy sa Nanopore nga dugay na nga pagbasa nga pagkasunud-sunod, pagsunud sa Illumina NGS, ug teknolohiya sa Hi-C.
Sa susama, usa ka trove sa 147 ka mga kapanguhaan sa germplasm, nga naglangkob sa taas nga ani nga mga kalainan, ihalas nga mga strain, ug may kalabutan nga mga espisye, gitigum alang sa komprehensibo nga tibuok genome resequencing (WGS) gamit ang plataporma sa Illumina.Ang misunod nga sequencing data miagi sa higpit nga pag-analisa sa genetics sa populasyon, nga nakapahimo sa pagdissection sa istruktura sa populasyon, pagkalainlain, ug pagkalainlain sa linkage.Kini nga pagtuki naghatag kahayag sa mga kalainan sa domestication sa tibuok populasyon.
Ang dugang nga mga imbestigasyon naglangkob sa pagtuki nga naglangkob sa Fst, π, Tajima's D, ug LD, nga nagtumong sa pagpadayag sa mga senyales sa pagpili nga naggikan sa gipaayo nga abot sa latex, ilabina ang pagtutok sa mga clone sa Wickham.
Ang pagtapos sa usa ka Genome-wide Association Analysis (GWAS), ang mga marka nga nalambigit sa mga kinaiya sa pag-ani ug pagkahuman gipunting ang mga gene nga may kalabotan sa ani.Ang pasiuna nga pag-validate nagpadayag sa lahi nga mga kalihokan sa transkripsyon sa lainlaing mga mutant alang sa duha nga mga gene sa ERF, nga naghatag usa ka pasiuna nga pagtan-aw sa ilang kahinungdanon sa pag-andar.Ang dugang nga corroboration gikatakda sulod sa umaabot nga panukiduki.
Gipasigarbo sa BMKGENE ang pag-amot sa halapad nga tibuuk nga genome nga resequencing sa kini nga dako nga populasyon, kauban ang usa ka hinungdanon nga papel sa pagtuki sa bioinformatics.Ang among halapad nga kasinatian naglangkob sa NGS/TGS sequencing ug multiomics bioinformatics analysis sa usa ka han-ay sa 1000+ ka espisye.Kami nagpaabut sa paglaum nga makig-uban kanimo sa imong umaabot nga mga proyekto.
I-klik dinhi sapagkat-on og dugang mahitungod niini nga pagtuon
Oras sa pag-post: Ago-29-2023