BMKCloud Log in
条形banner-03

Mga produkto

Eukaryotic mRNA Sequencing-Illumina

Ang pagsunud sa mRNA makahimo sa pag-profile sa tanan nga mga mRNA nga na-transcript gikan sa mga selyula sa ilawom sa piho nga mga kondisyon.Kini usa ka gamhanan nga teknolohiya alang sa pagpadayag sa profile sa ekspresyon sa gene, mga istruktura sa gene ug mga mekanismo sa molekula sa pipila ka biolohikal nga proseso.Hangtod karon, ang pagsunud sa mRNA kaylap nga gigamit sa sukaranan nga panukiduki, mga diagnostic sa klinika, pag-uswag sa tambal, ug uban pa.

Plataporma: Illumina NovaSeq Platform


Mga Detalye sa Serbisyo

Bioinformatics

Mga Resulta sa Demo

Bentaha

● Labing Eksperyensiyado: Kapin sa 200,000 ka mga sample ang naproseso sa BMK nga naglangkob sa lain-laing mga sample type, lakip na ang cell culture, tissue, body fluid, ug uban pa ug kapin sa 7,000 ka mRNA-Seq nga mga proyekto nga gisirado nga naglangkob sa nagkalain-laing research area.

● Estrikto nga sistema sa pagkontrol sa kalidad: Ang mga punto sa pagkontrol sa kalidad sa kinauyokan pinaagi sa tanang mga lakang lakip na ang pag-andam sa sample, pag-andam sa librarya, pagkasunodsunod ug bioinformatics ubos sa hugot nga pagmonitor aron makahatag og taas nga kalidad nga mga resulta.

● Daghang mga database nga magamit alang sa function annotation ug enrichment studies aron matuman ang lain-laing mga tumong sa panukiduki.

● After-sale nga mga serbisyo: After-sale nga mga serbisyo balido sulod sa 3 ka bulan human sa proyekto, lakip na ang mga proyekto nga follow-up, trouble-shooting, mga resulta sa Q&A, ug uban pa.

Sample nga Kinahanglanon ug Paghatud

Library Estratehiya sa pagkasunodsunod Girekomenda ang datos Pagkontrol sa Kalidad
Poly A gipadato Illumina PE150

6 Gb

Q30≥85%

Sample nga Kinahanglanon:

Nucleotides:

Conc.(ng/μl)

Gidaghanon (μg)

Kaputli

Integridad

≥ 20

≥ 0.5

OD260/280=1.7-2.5

OD260/230=0.5-2.5

Limitado o walay kontaminasyon sa protina o DNA nga gipakita sa gel.

Para sa mga tanom: RIN≥6.5;

Para sa mga mananap: RIN≥7.0;

5.0≥28S/18S≥1.0;

limitado o walay baseline elevation

Tissue: Timbang(uga):≥1 g
*Para sa tissue nga mas gamay sa 5 mg, among girekomenda nga magpadala ug flash frozen(sa liquid nitrogen) tissue sample.

Cell suspension:Ihap sa selula = 3×106- 1×107
* Girekomenda namon nga ipadala ang frozen cell lysate.Sa kaso nga ang cell nag-ihap nga mas gamay kaysa 5 × 105.

Mga sample sa dugo:Volume≥1 ml

Microorganism:Misa ≥ 1 g

Girekomenda nga Sample Delivery

Kontainer: 2 ml centrifuge tube (Tin foil dili girekomendar)

Sample nga pag-label: Grupo+kopya eg A1, A2, A3;B1, B2, B3...

pagpadala:

  1. Dry-ice: Ang mga sample kinahanglan nga ibutang sa mga bag ug ilubong sa dry-ice.
  2. RNAstable tubes: Ang mga sample sa RNA mahimong mamala sa RNA stabilization tube (eg RNAstable®) ug ipadala sa temperatura sa kwarto.

Daloy sa Trabaho sa Serbisyo

Sample nga QC

Eksperimento nga disenyo

sample delivery

Sample nga paghatod

Eksperimento sa piloto

Pagkuha sa RNA

Pagpangandam sa Library

Pagtukod sa librarya

Pagsunodsunod

Pagsunodsunod

Pagtuki sa datos

Pagtuki sa datos

Human sa pagbaligya Serbisyo

After-sale nga serbisyo


  • Kaniadto:
  • Sunod:

  • Bioinformatics

    wps_doc_10

    Eukaryotic mRNA sequencing analysis workflow

    Bioinformatics

    ØHilaw nga pagkontrol sa kalidad sa datos

    ØReference genome alignment

    ØPagtuki sa istruktura sa transcript

    ØPagsukod sa ekspresyon

    ØDifferential expression analysis

    ØFunction annotation ug enrichment

    1.mRNA Data Saturation curve

    3(1)

    2.Differential expression analysis-Volcano plot

    4(1)

    3.KEGG anotasyon sa DEGs

    5(1)

    4.Klasipikasyon sa GO sa mga DEG

    6(1)

    pagkuha sa usa ka kinutlo

    Isulat ang imong mensahe dinhi ug ipadala kini kanamo

    Ipadala ang imong mensahe kanamo: